We synthesized a fluorogenic dansylamide derivative (JB2-48), which fills the entire (15 Å deep) active site pocket of human carbonic anhydrase I, and investigated the contributions of sulfonamide and hydrophobic regions of the ligand structure on the spectral, kinetic, and thermodynamic properties of the enzyme–ligand complex. The steady-state and fluorescence lifetime data revealed that the deprotonation
我们合成了一种荧光的丹磺酰胺衍
生物(JB2-48),该衍
生物填充了人类
碳酸酐酶I的整个(15Å深)活性位点,并研究了磺酰胺和
配体结构的疏
水区在光谱,动力学和
化学性质上的贡献。酶-
配体复合物的热力学性质。稳态和荧光寿命数据表明,酶结合
配体的磺酰胺部分去质子化增加了荧光发射强度以及荧光团的寿命。这是通过活性位点的Zn驻地之间的静电相互作用表现2+辅因子,并且
配体的带负电荷的磺酰胺基,和这样的相互作用促成约2.2千卡/摩尔(ΔΔ ģ∘)和0.89千卡/摩尔(ΔΔ ģ ‡在分别稳定地与推定的过渡态)能量。我们提供的证据表明,JB2-48的阴离子和中性形式通过酶的互补微观/构象态得以稳定。讨论了本文研究的机理研究在
碳酸酐酶
抑制剂的原理设计中的意义。