1-(2-deoxy-β-D-ribofuranosyl)-7-propynylisocarbostyril | 254912-67-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 异喹啉及其衍生物
• 英文名称: 1-(2-deoxy-β-D-ribofuranosyl)-7-propynylisocarbostyril
• 英文别名: 2-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-4-prop-1-ynylisoquinolin-1-one
• CAS: 254912-67-9
• 化学式: C₁₇H₁₇NO₄
• 分子量: 299.326
• InChiKey: KTORWVJOZUVRQZ-ARFHVFGLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.3
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  70
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(2-deoxy-β-D-ribofuranosyl)-7-propynylisocarbostyril 在 磷酸三甲酯 、 Proton Sponge 、 三氯氧磷 作用下， 反应 2.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  扩展基因字母表的努力：非自然疏水碱基对的信息存储和复制

  摘要：

  对互补核碱基之间的链间氢键的忠实识别构成了遗传密码的基础。复制包含稳定第三个碱基对的 DNA 的能力将允许通过用第三个补充遗传字母表的现有两个碱基对来扩展 DNA 的信息内容。我们报告了非天然核碱基的优化，其在双链 DNA 中的配对基于碱基间疏水相互作用。我们表明，这种非天然碱基对的稳定性和选择性可能与天然碱基对相当，甚至超过。我们还证明了几个非天然碱基对通过大肠杆菌 DNA 聚合酶 I 的 Klenow 片段掺入 DNA，其效率与天然 DNA 合成的效率相当。而且，

  DOI：

  10.1021/ja9940064
• 作为产物：
  描述：

  1-[3,5-bis-O-(p-chlorobenzoyl)-2-deoxy-β-D-ribofuranosyl]-7-propynylisocarbostyril 在 sodium methylate 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 0.25h， 以90%的产率得到1-(2-deoxy-β-D-ribofuranosyl)-7-propynylisocarbostyril
  参考文献：
  名称：

  SYNTHESIS OF UNNATURAL 7-SUBSTITUTED-1-(2-DEOXY-β-D-RIBOFURANOSYL)ISOCARBOSTYRILS^†: “THYMINE REPLACEMENT” ANALOGS OF DEOXYTHYMIDINE FOR EVALUATION AS ANTIVIRAL AND ANTICANCER AGENTS

  摘要：

  A group of unnatural 1-(2-deoxy-beta -D-ribofuranosyl)isocarbostyrils having a variety of C-7 substituents [H, 4,7-(NO2)(2), I, CF3, CN, (E)-CH=CH-I, -C drop CH, -C dropC-I, -C dropC-Br, -C dropC-Me], designed as nucleoside mimics, were synthesized for evaluation as anticancer and antiviral agents. This class of compounds exhibited weak cytotoxicity in a MTT assay (CC50 = 10(-3) to 10(-5) M range) with the 4,7-dinitro derivative being the most cytotoxic, relative to thymidine (CC50=10(-3) to 10(-5) M range), against a variety of cancer cell lines. The 4,7-dinitro, 7-I and 7-C drop CH compounds exhibited similar cytotoxicity against nontransfected (KBALB, 143B), and HSV-1 TK+ gene transfected (KBALB-STK, 143B-LTK) cancer cell lines possessing the herpes simplex virus type I (HSV-1) thymidine kinase gene (TK+). This observation indicates that these compounds are not substrates for HSV type-1 TK, and are therefore unlikely to be useful in gene therapy based on the HSV gene therapy paradigm.

  DOI：

  10.1081/ncn-100105246

文献信息

• Enzymatic Phosphorylation of Unnatural Nucleosides
  作者：Yiqin Wu、Ming Fa、Eunju Lee Tae、Peter G. Schultz、Floyd E. Romesberg

  DOI：10.1021/ja028050m

  日期：2002.12.1

  In an effort to expand the genetic alphabet, a number of unnatural, predominantly hydrophobic, nucleoside analogues have been developed which pair selectively in duplex DNA and during enzymatic synthesis. Significant progress has been made toward the efficient in vitro replication of DNA containing these base pairs. However, the in vivo expansion of the genetic alphabet will require that the unnatural

  为了扩大遗传字母表，已经开发了许多非天然的、主要是疏水性的核苷类似物，它们在双链 DNA 中和酶促合成过程中选择性地配对。在含有这些碱基对的 DNA 的体外有效复制方面取得了重大进展。然而，基因字母表的体内扩展将要求非天然三磷酸核苷在细胞内以足够的浓度用于 DNA 复制。我们报告了我们为开发基于核苷补救酶的非自然体内核苷磷酸化途径所做的初步努力。该途径的第一步由黑腹果蝇核苷激酶催化，该激酶催化核苷磷酸化为相应的单磷酸酯。
• Efforts toward Expansion of the Genetic Alphabet:  DNA Polymerase Recognition of a Highly Stable, Self-Pairing Hydrophobic Base
  作者：Dustin L. McMinn、Anthony K. Ogawa、Yiqin Wu、Jianquan Liu、Peter G. Schultz、Floyd E. Romesberg

  DOI：10.1021/ja9925150

  日期：1999.12.1

  The storage and replication of biological information is based on the specific hydrogen-bonding patterns of the Watson-Crick A:T and G:C base pairs.1 The generation of enzymatically replicable unnatural base pairs with thermal stability comparable to that of A:T and G:C would significantly expand the biological and chemical potential of DNA. One strategy for expanding the genetic alphabet has focused

  生物信息的存储和复制基于 Watson-Crick A:T 和 G:C 碱基对的特定氢键模式。1 生成具有与 A:T 相当的热稳定性的酶促复制非天然碱基对和 G:C 将显着扩展 DNA 的生物和化学潜力。扩大遗传字母表的一种策略侧重于合成具有改变氢键模式的碱基。 2-8 然而，鉴于疏水性在蛋白质折叠和稳定性中发挥的主导作用，9-11 我们探索了使用疏水和范德华相互作用产生正交碱基对，用于遗传信息的存储和复制。之前的实验中将疏水性碱基掺入双链体 DNA 导致双链体相对于天然对不稳定。 12-18 在系统评估各种主要疏水性核碱基的过程中，19 我们表征了一个碱基，它不能形成H 键，其自身对相对于 A:T 或 G:C 碱基对稳定双链 DNA。如方案 1 所示，合成了 7-丙炔基异喹啉核苷 (1) 并转化为核苷三磷酸 (4) 和亚磷酰胺 (5)。当掺入双链 DNA 时，预计 1:1 的链间相互作用