5-(1-β-D-glucopyranosyl)thiomethyl-2'-deoxycytidine | 1433286-49-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5-(1-β-D-glucopyranosyl)thiomethyl-2'-deoxycytidine
• CAS: 1433286-49-7
• 化学式: C₁₆H₂₅N₃O₉S
• 分子量: 435.455
• InChiKey: PFABITMBGZQFRN-JSDFYWKGSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.5
• 重原子数：
  29.0
• 可旋转键数：
  6.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.75
• 拓扑面积：
  200.75
• 氢给体数：
  7.0
• 氢受体数：
  13.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2'-脱氧-5-(羟甲基)胞啶 、 sodium 1-thio-β-D-glucopyranoside 在 sodium metabisulfite 、 sodium phosphate 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 2'-deoxycytidine 5-methylenesulfonate 、 5-(1-β-D-glucopyranosyl)thiomethyl-2'-deoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  通过化学修饰和纳米孔分析技术对DNA中的5个羟甲基胞嘧啶进行单分子检测

  摘要：

  DNA穿刺针：开发了一种单分子检测DNA中5-羟甲基胞嘧啶（5hmC）的新方法。在亚硫酸氢盐介导的单步反应中（参见方案），将5hmC选择性硫醇取代（产生SMC）可将肽（黄色球体）或生物素掺入DNA中。修饰的5hmC碱基可以使用蛋白质纳米孔分析在单分子水平上轻松区分。

  DOI：

  10.1002/anie.201300413