5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxy-2'-S-hexyluridine | 268740-71-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxy-2'-S-hexyluridine
• 英文别名: Shexyl(-2d)[DMT(-5)]Ribf(b)-uracil-1-yl；1-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-3-hexylsulfanyl-4-hydroxyoxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 268740-71-2
• 化学式: C₃₆H₄₂N₂O₇S
• 分子量: 646.805
• InChiKey: ZNBIRIGOKMGIJU-DWNQJFHRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6
• 重原子数：
  46
• 可旋转键数：
  15
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.39
• 拓扑面积：
  132
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 、 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxy-2'-S-hexyluridine 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.0h， 以51.2%的产率得到3'-O-[(2-cyanoethyl)(diisopropylamino)]phosphino-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxy-2'-S-hexyluridine
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of Oligodeoxyribonucleotide Bearing 2′-S-Alkyl Residue and its Effect on the Duplex Stability

  摘要：

  2'-Deoxy-2'-S-hexyluridine derivative was synthesized from 2,2'-anhydrouridine and 1-hexanethiol and incorporated into an oligodeoxyribonucleotide. The thermal stability of the duplexes formed by the 2'-S-hexyl modified ODN with either the complementary DNA or RNA strand was decreased compared to the unmodified counterparts.

  DOI：

  10.1080/15257770008035010
• 作为产物：
  描述：

  尿嘧啶核苷 在 碳酸二苯酯 、 4-二甲氨基吡啶 、 碳酸氢钠 、 四甲基胍 作用下， 以 吡啶 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxy-2'-S-hexyluridine
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of Oligodeoxyribonucleotide Bearing 2′-S-Alkyl Residue and its Effect on the Duplex Stability

  摘要：

  2'-Deoxy-2'-S-hexyluridine derivative was synthesized from 2,2'-anhydrouridine and 1-hexanethiol and incorporated into an oligodeoxyribonucleotide. The thermal stability of the duplexes formed by the 2'-S-hexyl modified ODN with either the complementary DNA or RNA strand was decreased compared to the unmodified counterparts.

  DOI：

  10.1080/15257770008035010