N(2)-(2-nitrobenzylcarbonyl)-O(6)-(2-chloroethyl)-5''-O-dimethoxytrityl-3'-O-(2-cyanoethyl-N,N-diisopropylphosphoramidite)-2'-deoxyguanosine | 1376827-51-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: N(2)-(2-nitrobenzylcarbonyl)-O(6)-(2-chloroethyl)-5''-O-dimethoxytrityl-3'-O-(2-cyanoethyl-N,N-diisopropylphosphoramidite)-2'-deoxyguanosine
• CAS: 1376827-51-8
• 化学式: C₅₀H₅₆ClN₈O₁₁P
• 分子量: 1011.47
• InChiKey: HLQQMDACFMBPOH-QBHHYVSHSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  10.08
• 重原子数：
  71.0
• 可旋转键数：
  24.0
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  216.71
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  17.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  3',5'-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxyguanosine 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 18-冠醚-6 、 sodium hydride 、 氟化氢吡啶 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 58.07h， 生成 N(2)-(2-nitrobenzylcarbonyl)-O(6)-(2-chloroethyl)-5''-O-dimethoxytrityl-3'-O-(2-cyanoethyl-N,N-diisopropylphosphoramidite)-2'-deoxyguanosine
  参考文献：
  名称：

  KL-50（一种治疗耐药脑癌的候选咪唑四嗪）的作用机制

  摘要：

  异常的 DNA 修复是癌症的一个标志，许多肿瘤表现出 DNA 修复能力下降，从而使它们对基因毒素敏感。在这里，我们证明健康组织和转化组织的不同 DNA 修复能力可用于获得高度选择性的化疗。我们发现新型 N3-(2-氟乙基)咪唑四嗪“KL-50”是一种针对缺乏 DNA 修复蛋白 O 6 -甲基鸟嘌呤-DNA-甲基转移酶 (MGMT) 的肿瘤的选择性毒素，该蛋白可逆转 O 6 -烷基鸟嘌呤损伤。我们确定 KL-50 通过多步骤过程产生 DNA 链间交联 (ICL)，包括 DNA 烷基化以产生 O 6 -(2-氟乙基)鸟嘌呤 (O 6 FEtG) 损伤，缓慢单分子置换氟化物以形成 N1 ,O 6 -乙醇鸟嘌呤(N1,O 6 EtG)中间体，并通过相邻胞苷开环。 N1,O 6 EtG 形成的缓慢速率使得表达 MGMT 的健康细胞能够在最初的 O 6 FEtG 病变发展为 N1,O 6 EtG 之前逆转它，从而抑制有毒

  DOI：

  10.1021/jacs.3c06483

文献信息

• Synthesis of DNA Interstrand Cross-Links Using a Photocaged Nucleobase
  作者：Sarah Hentschel、Jawad Alzeer、Todor Angelov、Orlando D. Schärer、Nathan W. Luedtke

  DOI：10.1002/anie.201108018

  日期：2012.4.2

  drug that generates an ethylene bridge between N1 of deoxyguanosine and N3 of deoxycytidine. No synthesis of a DNA containing this moiety has been reported until now. A new strategy uses a photocaged nucleobase that, when released, generates a highly reactive intermediate which cross‐links the opposing DNA strand in a manner analogous to BCNU (see scheme, NBOC=ortho‐nitrobenzyloxycarbonyl).

  缺少的联系：BCNU是一种化学治疗药物，可在脱氧鸟苷的N 1与脱氧胞苷的N 3之间产生乙烯桥。迄今为止，尚未报道过合成含有该部分的DNA。一种新的策略是使用光笼核碱基，该碱基在释放时会产生高反应活性的中间体，该中间体以类似于BCNU的方式交联相对的DNA链（请参阅方案NBOC =邻硝基苄氧基羰基）。