5'-O-(2-dansylethoxycarbonyl)-2'-deoxy-N⁴-<2-(4-nitrophenyl)ethoxycarbonyl>-3'-O-succinylcytidine | 156159-87-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5'-O-(2-dansylethoxycarbonyl)-2'-deoxy-N⁴-<2-(4-nitrophenyl)ethoxycarbonyl>-3'-O-succinylcytidine
• CAS: 156159-87-4
• 化学式: C₃₇H₃₉N₅O₁₅S
• 分子量: 825.807
• InChiKey: VIVPHMLDEHAJAE-NPLMNSEMSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.85
• 重原子数：
  58.0
• 可旋转键数：
  17.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  262.1
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  17.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-(2-dansylethoxycarbonyl)-2'-deoxy-N⁴-<2-(4-nitrophenyl)ethoxycarbonyl>-3'-O-succinylcytidine 、 5'-O-(2-dansylethoxycarbonyl)-2'-deoxy-N4-<2-(4-nitrophenyl)ethoxycarbonyl>cytidine 3'-<2-(4-nitrophenyl)ethyl N,N-diethylphosphoramidite> 生成 d(pC)₁₀
  参考文献：
  名称：

  核苷酸。第XLI部分。用于保护寡脱氧核糖核苷酸合成中5'-羟基功能的2-dansylethoxy羰基（2-{[5-（二甲基氨基）萘-1-基]磺酰基}乙氧基羰基; dnseoc）基团用于保护寡脱氧核糖核苷酸合成中的5'-羟基功能†

  摘要：

  在使用自动亚磷酰胺方法合成寡脱氧核糖核苷酸的过程中，描述了使用2-丹酰基乙氧羰基（2-{[5-（二甲基氨基萘-1-基]磺酰基}乙氧羰基； Dnseoc）基团作为寡聚脱氧核糖核苷酸合成中的中间体5'-OH保护基。 RNA合成替代策略的模型研究。

  DOI：

  10.1002/hlca.19940770123
• 作为产物：
  描述：

  丁二酸酐 、 5'-O-(2-dansylethoxycarbonyl)-2'-deoxy-N4-[2-(4-nitrophenyl)ethoxycarbonyl]cytidine 在 4-二甲氨基吡啶 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 2.0h， 以93%的产率得到5'-O-(2-dansylethoxycarbonyl)-2'-deoxy-N⁴-<2-(4-nitrophenyl)ethoxycarbonyl>-3'-O-succinylcytidine
  参考文献：
  名称：

  核苷酸。第XLI部分。用于保护寡脱氧核糖核苷酸合成中5'-羟基功能的2-dansylethoxy羰基（2-{[5-（二甲基氨基）萘-1-基]磺酰基}乙氧基羰基; dnseoc）基团用于保护寡脱氧核糖核苷酸合成中的5'-羟基功能†

  摘要：

  在使用自动亚磷酰胺方法合成寡脱氧核糖核苷酸的过程中，描述了使用2-丹酰基乙氧羰基（2-{[5-（二甲基氨基萘-1-基]磺酰基}乙氧羰基； Dnseoc）基团作为寡聚脱氧核糖核苷酸合成中的中间体5'-OH保护基。 RNA合成替代策略的模型研究。

  DOI：

  10.1002/hlca.19940770123