3'-O-tert-butyldimethylsilyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxy-5-iodouridine | 364613-26-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 3'-O-tert-butyldimethylsilyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxy-5-iodouridine
• 英文别名: 3'-O-tert-butyldimethylsilyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityI)-2'-deoxy-5-iodouridine；1-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxyoxolan-2-yl]-5-iodopyrimidine-2,4-dione
• CAS: 364613-26-3
• 化学式: C₃₆H₄₃IN₂O₇Si
• 分子量: 770.737
• InChiKey: WWSCOPXONQBPMD-DCMFLLSESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.85
• 重原子数：
  47.0
• 可旋转键数：
  11.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.39
• 拓扑面积：
  101.01
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3'-O-tert-butyldimethylsilyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxy-5-iodouridine 在 三异丙基硅烷 、 溶剂黄146 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 1.0h， 以43%的产率得到3'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5-iodo-2'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  IMMUNOMODULATING POLYNUCLEOTIDES, ANTIBODY CONJUGATES THEREOF, AND METHODS OF THEIR USE

  摘要：

  免疫调节多核苷酸被披露。这些免疫调节多核苷酸可能包含5-修饰尿苷、5-修饰胞苷、总共6到16个核苷酸，和/或一个或多个缺失间隔子和/或核苷酸间磷三酯。还披露了含有靶向基团和一个或多个免疫调节多核苷酸的结合物。这些免疫调节多核苷酸和结合物可能进一步包含一个或多个辅助基团。还披露了含有这些免疫调节多核苷酸或含有一个或多个立体化富集的核苷酸间磷硫酸酯的结合物的组合物。进一步披露了含有这些免疫调节多核苷酸或结合物的药物组合物以及它们的使用方法。

  公开号：

  US20180312536A1
• 作为产物：
  描述：

  叔丁基二甲基氯硅烷 、 5-O-(二甲氧基三苯甲游基)-5-碘-2-脱氧尿苷 在 咪唑 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.5h， 以98%的产率得到3'-O-tert-butyldimethylsilyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxy-5-iodouridine
  参考文献：
  名称：

  Synthesis, structure and imaging of oligodeoxyribonucleotides with tellurium-nucleobase derivatization

  摘要：

  我们在此报告了 5-苯基碲化物胸苷衍生物和 Te-亚磷酰胺的首次合成。我们还在此报告了含有 5-苯基碲化物官能团 (5-Te) 衍生的核碱基 (胸腺嘧啶) 的 DNA 寡核苷酸的合成、结构和 STM 电流成像研究。我们的结果表明 5-Te-DNA 是稳定的，并且 Te-DNA 双链体具有与相应的天然双链体相似的热稳定性。晶体结构表明 5-Te-DNA 双链体结构实际上与天然双链体结构相同，并且 Te 修饰的 T 和天然 A 相互作用与天然 T 和 A 对类似。此外，虽然相应的天然信号显示出微弱的信号，但用富电子碲功能修饰的 DNA 双链体通过 STM 成像显示出很强的形貌和电流峰，这表明了一种在没有结构扰动的情况下直接对 DNA 进行成像的潜在策略。

  DOI：

  10.1093/nar/gkq1288

文献信息

• [EN] NOVEL COMPOUNDS AND DERIVATIZATION OF DNAS AND RNAS ON THE NUCLEOBASES OF PYRIMIDINES FOR FUNCTION, STRUCTURE, AND THERAPEUTICS<br/>[FR] NOUVEAUX COMPOSÉS ET DÉRIVATION D'ADN ET D'ARN SUR LES NUCLÉOBASES DE PYRIMIDINES À DES FINS DE FONCTION, DE STRUCTURE ET DE THÉRAPEUTIQUE
  申请人：SENA RES INC

  公开号：WO2010135564A3

  公开（公告）日：2011-05-05