5-[4-(6-Amino-3-imino-3H-xanthen-9-yl)-phenylethynyl]-2-(6-hydroxy-3-oxo-3H-xanthen-9-yl)-benzoic acid 5-tert-butoxycarbonyl-pentyl ester | 918293-68-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并吡喃
• 英文名称: 5-[4-(6-Amino-3-imino-3H-xanthen-9-yl)-phenylethynyl]-2-(6-hydroxy-3-oxo-3H-xanthen-9-yl)-benzoic acid 5-tert-butoxycarbonyl-pentyl ester
• CAS: 918293-68-2
• 化学式: C₅₁H₄₂N₂O₈
• 分子量: 810.903
• InChiKey: MOTIBMQULSNJCC-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  10.31
• 重原子数：
  61.0
• 可旋转键数：
  9.0
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.18
• 拓扑面积：
  166.05
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  10.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-[4-(6-Amino-3-imino-3H-xanthen-9-yl)-phenylethynyl]-2-(6-hydroxy-3-oxo-3H-xanthen-9-yl)-benzoic acid 5-tert-butoxycarbonyl-pentyl ester 在 三异丙基硅烷 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 24.0h， 以43%的产率得到5-[4-(6-Amino-3-imino-3H-xanthen-9-yl)-phenylethynyl]-2-(6-hydroxy-3-oxo-3H-xanthen-9-yl)-benzoic acid 5-carboxy-pentyl ester
  参考文献：
  名称：

  用于在一项实验中标记多个生物分子的荧光、通过键合能量转移盒

  摘要：

  已经设计并合成了基于与罗丹明样受体电子偶联的荧光素供体成分的键合能量转移盒。它们在 488 nm 处强烈吸收（Ar 激光发射）并有效地将能量转移到发射强烈的受体组件。此外，与荧光素相比，盒式磁带对光漂白更稳定，因此与荧光素本身相比，它们可能更适合单分子检测方法。这些研究构成了在高通量测序和其他生物技术应用中改进链终止 DNA 检测的基础。

  DOI：

  10.1021/ja037193l
• 作为产物：
  描述：

  5-ethynylfluorescein 在 copper(l) iodide 、 四(三苯基膦)钯 、 potassium carbonate 、 三乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 48.0h， 生成 5-[4-(6-Amino-3-imino-3H-xanthen-9-yl)-phenylethynyl]-2-(6-hydroxy-3-oxo-3H-xanthen-9-yl)-benzoic acid 5-tert-butoxycarbonyl-pentyl ester
  参考文献：
  名称：

  用于在一项实验中标记多个生物分子的荧光、通过键合能量转移盒

  摘要：

  已经设计并合成了基于与罗丹明样受体电子偶联的荧光素供体成分的键合能量转移盒。它们在 488 nm 处强烈吸收（Ar 激光发射）并有效地将能量转移到发射强烈的受体组件。此外，与荧光素相比，盒式磁带对光漂白更稳定，因此与荧光素本身相比，它们可能更适合单分子检测方法。这些研究构成了在高通量测序和其他生物技术应用中改进链终止 DNA 检测的基础。

  DOI：

  10.1021/ja037193l