(2R,3R,4S,5R)-2-(6-Amino-purin-9-yl)-5-(2-nitrooxy-ethyl)-tetrahydro-furan-3,4-diol | 189166-00-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 5'-脱氧核糖核苷
• 英文名称: (2R,3R,4S,5R)-2-(6-Amino-purin-9-yl)-5-(2-nitrooxy-ethyl)-tetrahydro-furan-3,4-diol
• CAS: 189166-00-5
• 化学式: C₁₁H₁₄N₆O₆
• 分子量: 326.269
• InChiKey: AWADYQUMVUTGNA-IOSLPCCCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.37
• 重原子数：
  23.0
• 可旋转键数：
  5.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.55
• 拓扑面积：
  171.68
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  11.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2R,3R,4S,5R)-2-(6-Amino-purin-9-yl)-5-(2-nitrooxy-ethyl)-tetrahydro-furan-3,4-diol 在 偶氮二异丁腈 、 氘代三正丁基锡 、 对甲苯磺酸 、 原甲酸三乙酯 作用下， 以 N,N-二甲基乙酰胺 、 苯 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 9-(5-deoxy-2,3-O-isopropylidene-β-D-ribo-hexofuranosyl)adenine
  参考文献：
  名称：

  自由基引发的级联反应的仿生模拟假定发生在核糖核苷酸还原酶的活性位点1

  摘要：

  在升高的温度下用三丁基锡烷和 AIBN 处理核苷的 5'-O-硝基酯导致所得 5'-氧自由基的 β-断裂，得到甲醛和脱同系的赤呋喃糖基核苷。同核苷的 6'-O-硝基酯 [（5-脱氧-β-d-核糖-己呋喃糖基）腺嘌呤或来自 d-葡萄糖的尿嘧啶核苷] 的类似处理导致 6'-氧自由基的产生，然后提取H3' 通过 [1,5]-氢位移。用氘化三丁基锡进行自由基淬灭得到 3'-[2H] 同核苷。这种氘转移和 C3' 上未受保护的同核苷的构型反转证实了 C3' 自由基的中继生成。含有 2'-氯 (30) 或 2'-O-甲苯磺酰基 (40) 取代基的同核苷的 6'-O-硝基酯的类似处理导致起始材料完全消失并生成 (R)-2-(2 -羟乙基)-3(2H)-呋喃酮(33)。6'-氧自由基的产生，H3'的[1,5]-氢位移得到C3'自由基......

  DOI：

  10.1021/ja983449p
• 作为产物：
  描述：

  (2R,3R,4S,5R)-2-Methoxy-5-(2-nitrooxy-ethyl)-tetrahydro-furan-3,4-diol 在 4-二甲氨基吡啶 、 氨 、 四氯化锡 作用下， 生成 (2R,3R,4S,5R)-2-(6-Amino-purin-9-yl)-5-(2-nitrooxy-ethyl)-tetrahydro-furan-3,4-diol
  参考文献：
  名称：

  从核苷 C3' 自由基的 C2' 中消除氯（自由基）或甲苯磺酸盐（阴离子）作为假设发生在核糖核苷酸还原酶活性位点的模型反应1

  摘要：

  2'-氯-2'-脱氧核苷 5'二磷酸的 H3' 离子生成 C3' 自由基被提议 2a,c 引发反应，导致 RDPR 失活。6 氯化物的自发损失和 OH3 ' 质子向谷氨酸的转移将产生 2'-脱氧-3'-酮核苷酸中间体，而不涉及 R1 上的半胱氨酸对。2a,c 连续消除（H2'/碱基和 H4'/焦磷酸盐）会产生迈克尔受体 2-亚甲基-3(2 H)-呋喃酮，这会影响酶的共价失活。7 我们最近展示了一种可能产生迈克尔受体的机制替代方案，该替代方案涉及从模型 2' 取代核苷的 C2' 中丢失一个自由基，而不是一个阴离子物质。8,9 因此，处理 2'-（叠氮、溴、氯、碘、或甲硫基）核苷 3 '-硫代碳酸酯与三丁基锡烷/AIBN 导致 2 ' 取代基丢失，作为假定的自由基，在生成 C3 ' 自由基后得到 2 ',3'-二脱氢-2',3' 双脱氧衍生物（没有O3'); 而具有 2 '-氟或 2'-O-（甲磺酰基或甲苯磺酰基）取代基的

  DOI：

  10.1021/ja970171c