9-((2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)-1-((2E,6E)-3,7,11-trimethyldodeca-2,6,10-trienyl)-1H-purin-6(9H)-one-5'-sulforhodaminsulfonic ester | 1426240-02-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 类固醇和类固醇衍生物
• 英文名称: 9-((2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)-1-((2E,6E)-3,7,11-trimethyldodeca-2,6,10-trienyl)-1H-purin-6(9H)-one-5'-sulforhodaminsulfonic ester
• CAS: 1426240-02-9
• 化学式: C₅₆H₆₄N₆O₁₀S₂
• 分子量: 1045.29
• InChiKey: XPIDEBKQMLEDJP-QHEYXRCJSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.41
• 重原子数：
  74.0
• 可旋转键数：
  15.0
• 环数：
  11.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.46
• 拓扑面积：
  198.22
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  15.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2'-脱氧肌苷 在 potassium carbonate 作用下， 以 吡啶 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 72.0h， 生成 9-((2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)-1-((2E,6E)-3,7,11-trimethyldodeca-2,6,10-trienyl)-1H-purin-6(9H)-one-5'-sulforhodaminsulfonic ester
  参考文献：
  名称：

  Reactive, lipophilic nucleoside building blocks for the synthesis of hydrophobic nucleic acids

  摘要：

  本发明涉及一种用于通过与基本上互补序列（以下简称为样品寡核苷酸、样品序列或样品核酸）的碱基特异性杂交来分离和/或鉴定已知或未知核酸序列（目标序列）的方法，该目标序列可以选择性地标记有报告基团，这些目标序列属于一个序列库。此外，本发明涉及用于所述方法的核脂质以及用于制备所述核脂质的方法。

  公开号：

  EP2712869A1

文献信息

• REACTIVE, LIPOPHILIC NUCLEOSIDE BUILDING BLOCKS FOR THE SYNTHESIS OF HYDROPHOBIC NUCLEIC ACIDS
  申请人：Ionovation GmbH

  公开号：US20190175633A1

  公开（公告）日：2019-06-13

  The present invention relates to a method for the isolation and/or identification of known or unknown sequences of nucleic acids (target sequences) optionally marked with reporter groups by base specific hybridation with complementary sequences using nucleolipids. The nucleolipids are prepared by lipophilizing nucleosides of formula (Ia) wherein Q represents a group having a substituted tetrahydrofuran ring and Bas represents a group having one or more heterocyclic rings having one or more heterocyclic nitrogen atoms.

  本发明涉及一种方法，用于通过碱特异性杂交与互补序列使用核苷酸脂质来分离和/或识别带有报告基团的已知或未知核酸序列（目标序列）。所述核苷酸脂质是通过使式（Ia）的核苷的亲脂化制备的， 其中，Q代表具有取代四氢呋喃环的基团，Bas代表具有一个或多个含有一个或多个杂环氮原子的杂环环的基团。