为了简化药物开发的临床前阶段,我们探索了分子目标上的结构数据的实用性以及计算
化学和药物
化学之间的协同作用。我们专注于寄生虫传染病,特别着重于开发特定的非共价蛋白酶抑制剂,这些
抑制剂在寄生虫的生命周期中起着关键作用。通常,没有药物学上感兴趣的酶靶标的结构。在这种情况下,我们通过相关酶与已知结构蛋白的序列相似性对结构进行了建模。例如,我们已经构建了一种基于同源性的模型,其中一种是恶性营养素,滋养体半胱
氨酸
蛋白酶,并使用计算性
配体识别算法DOCK识别了包括
草酸双(2-羟基-1-
萘基-亚甲基)酰
肼(1)在内的复合酶
抑制剂[Ring,CS; 孙E. JH McKerow;Lee G .;罗森塔尔(Rosenthal),PJ,昆茨(Kuntz),爱达荷州;科恩,FE,过程 Natl Acad。科学 U
SA 1993,90,3583]。通过
次黄嘌呤摄取(IC50 7 microM)判断,化合物1在体外抑制了falcipain(IC50