methyl (5'-O-dimethoxytrityl-3'-O-thymidinyl)methylphosphonate | 854389-42-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: methyl (5'-O-dimethoxytrityl-3'-O-thymidinyl)methylphosphonate
• 英文别名: [(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxymethyl-methoxyphosphinic acid
• CAS: 854389-42-7
• 化学式: C₃₃H₃₇N₂O₁₀P
• 分子量: 652.638
• InChiKey: YAFIJRXTBSIBTE-FRXPANAUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3
• 重原子数：
  46
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  142
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl (5'-O-dimethoxytrityl-3'-O-thymidinyl)methylphosphonate 在 吡啶 、 4-甲氧基吡啶-N-氧化物 、 5,5-二甲基-2-氯-1,3,2-二氧磷杂己内酰磷酸酯 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 16.83h， 生成 4-methoxy-1-oxy-2-pyridylmethyl 2-deoxy-5-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-1-(thymin-1-yl)-β-D-erythro-pentofuranos-3-yloxymethylphosphonate
  参考文献：
  名称：

  核苷-O-甲基膦酸酯：修饰寡核苷酸的单体池

  摘要：

  四种天然 2'-脱氧核糖核苷、1-（2-脱氧-β-D-苏式-戊呋喃糖基）胸腺嘧啶、5'-O- 和 2' 的一组独特的 5'-O- 和 3'-O-膦酰基甲基衍生物1-(3-脱氧-β-D-赤型-戊呋喃糖基)胸腺嘧啶和1-(3-脱氧-β-D-苏式-戊呋喃糖基)胸腺嘧啶的-O-膦酰基甲基衍生物已被合成为单体库修饰寡核苷酸的合成。膦酸酯部分用 4-甲氧基-1-氧化-2-吡啶基甲酯基团保护，在偶联步骤中也作为分子内催化剂。

  DOI：

  10.1081/ncn-200033912
• 作为产物：
  描述：

  4,4'-双甲氧基三苯甲基氯 在 吡啶 、 sodium hydride 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 40.0h， 生成 methyl (5'-O-dimethoxytrityl-3'-O-thymidinyl)methylphosphonate
  参考文献：
  名称：

  核苷-O-甲基膦酸酯：修饰寡核苷酸的单体池

  摘要：

  四种天然 2'-脱氧核糖核苷、1-（2-脱氧-β-D-苏式-戊呋喃糖基）胸腺嘧啶、5'-O- 和 2' 的一组独特的 5'-O- 和 3'-O-膦酰基甲基衍生物1-(3-脱氧-β-D-赤型-戊呋喃糖基)胸腺嘧啶和1-(3-脱氧-β-D-苏式-戊呋喃糖基)胸腺嘧啶的-O-膦酰基甲基衍生物已被合成为单体库修饰寡核苷酸的合成。膦酸酯部分用 4-甲氧基-1-氧化-2-吡啶基甲酯基团保护，在偶联步骤中也作为分子内催化剂。

  DOI：

  10.1081/ncn-200033912

文献信息

• Methyl 4-toluenesulfonyloxymethylphosphonate, a new and versatile reagent for the convenient synthesis of phosphonate-containing compounds
  作者：Ivana Kóšiová、Zdeněk Točík、Miloš Buděšínský、Ondřej Šimák、Radek Liboska、Dominik Rejman、Ondřej Pačes、Ivan Rosenberg

  DOI：10.1016/j.tetlet.2009.09.062

  日期：2009.12

  A straightforward procedure leading to the new phosphonylating reagent, methyl 4-toluenesulfonyloxymethylphosphonate, requiring no chromatographic purification is described. This stable reagent works with the same efficiency as dimethyl and other dialkyl esters for the introduction of an O-phosphonomethyl moiety while, in contrast to dimethyl ester, it does not cause any unwanted methylation of sensitive

  描述了一种无需新的色谱纯化方法即可直接产生新的膦酰化试剂4-甲苯磺酰氧基甲基膦酸甲酯的方法。对于引入O-膦酰基甲基部分，该稳定的试剂与二甲基和其他二烷基酯具有相同的效率，而与二甲基酯相反，它不会引起敏感官能团的任何不希望的甲基化。举例说明了其以高产率用于被保护的核苷的烷基化的效用。
• Inhibition of human thymidine phosphorylase by conformationally constrained pyrimidine nucleoside phosphonic acids and their “open-structure” isosteres
  作者：Ivana Košiová、Ondřej Šimák、Natalya Panova、Miloš Buděšínský、Magdalena Petrová、Dominik Rejman、Radek Liboska、Ondřej Páv、Ivan Rosenberg

  DOI：10.1016/j.ejmech.2013.12.026

  日期：2014.3

  A series of conformationally constrained uridine-based nucleoside phosphonic acids containing annealed 1,3-dioxolane and 1,4-dioxane rings and their “open-structure” isosteres were synthesized and evaluated as potential multisubstrate-like inhibitors of the human recombinant thymidine phosphorylase (TP, EC 2.4.2.4) and TP obtained from peripheral blood mononuclear cells (PBMC). From a large set of

  合成了一系列构象受约束的基于尿苷的核苷膦酸，其中包含退火的1,3-二氧戊环和1,4-二氧杂环丁烷环及其“开放结构”等位基因，并被评估为人类重组胸苷磷酸化酶的潜在多底物状抑制剂（ TP，EC 2.4.2.4）和从外周血单核细胞（PBMC）获得的TP。从大量经过测试的核苷膦酸中，鉴定出几种有效化合物，它们的K i值在0.048–1μM的范围内。所研究化合物的抑制能力在很大程度上取决于膦酸酯部分的构象柔性程度，糖膦酸酯组分的立体化学排列以及嘧啶核碱基5位上的取代基。