5'-O-dimethoxytrityl-3'-O-[(2-cyanoethyl)-N,N-diisopropyl]phosphoramidite-2'-trifluoroacetamido-2'-deoxyuridine | 126139-44-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-dimethoxytrityl-3'-O-[(2-cyanoethyl)-N,N-diisopropyl]phosphoramidite-2'-trifluoroacetamido-2'-deoxyuridine
• 英文别名: 2'-Deoxy-2'-(N-trifluoroacetyl)amino-5'-O-DMTr-uridine 3'-CED phosphoramidit；N-[(2R,3R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxy-2-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]-2,2,2-trifluoroacetamide
• CAS: 126139-44-4
• 化学式: C₄₁H₄₇F₃N₅O₉P
• 分子量: 841.821
• InChiKey: SSRAEXJTISFPEB-WEYVJJSGSA-N

物化性质

• 熔点：
  240-243 °C(Solv: ethanol (64-17-5))

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.4
• 重原子数：
  59
• 可旋转键数：
  18
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.41
• 拓扑面积：
  161
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  14

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-dimethoxytrityl-3'-O-[(2-cyanoethyl)-N,N-diisopropyl]phosphoramidite-2'-trifluoroacetamido-2'-deoxyuridine 在 四氮唑 、 ammonium hydroxide 、 borane diisopropylethylamine complex 、 四丁基氟化铵 、 溶剂黄146 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 乙腈 为溶剂， 反应 26.0h， 生成 3'-(2'-aminoborane-2'-deoxyuridyl)-5'-thymidilyl hydrogen phosphate
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and Conformational Studies of 3'-(2'-Aminoborane-2'-deoxyuridyl)-5'-thymidilyl Hydrogen Phosphate to be Used in the Construction of Oligonucleotide Sequences

  摘要：

  DOI：

  10.3987/com-03-s56
• 作为产物：
  描述：

  双(二异丙基氨基)(2-氰基乙氧基)膦 、 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxy-2'-(trifluoroacetamido)uridine 在 (diisopropyl)bisammoniumtetrazolide 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 16.0h， 以67%的产率得到5'-O-dimethoxytrityl-3'-O-[(2-cyanoethyl)-N,N-diisopropyl]phosphoramidite-2'-trifluoroacetamido-2'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and Conformational Studies of 3'-(2'-Aminoborane-2'-deoxyuridyl)-5'-thymidilyl Hydrogen Phosphate to be Used in the Construction of Oligonucleotide Sequences

  摘要：

  DOI：

  10.3987/com-03-s56