N-{(2R)-1-[(5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-deoxythymidine-3'-yl)amino]-1-oxoprop-2-yl}-3'-[(2-cyanoethoxy)(diisopropylamino)phosphinooxy]-3'-deoxythymidine-5'-carboxamide | 1246949-97-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: N-{(2R)-1-[(5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-deoxythymidine-3'-yl)amino]-1-oxoprop-2-yl}-3'-[(2-cyanoethoxy)(diisopropylamino)phosphinooxy]-3'-deoxythymidine-5'-carboxamide
• CAS: 1246949-97-2
• 化学式: C₅₃H₆₅N₈O₁₃P
• 分子量: 1053.12
• InChiKey: GYOZEYWMYBPJGF-ZTFMILKDSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.96
• 重原子数：
  75.0
• 可旋转键数：
  22.0
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  259.56
• 氢给体数：
  4.0
• 氢受体数：
  17.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  methyl (2R)-2-[3'-O-(tert-butyldimethylsilyl)thymidine-5'-carboxamido]propanoate 在 吡啶 、 四氮唑 、 N-羟基丁二酰亚胺 、 四丁基氟化铵 、 水 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 、 potassium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 8.5h， 生成 N-{(2R)-1-[(5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-deoxythymidine-3'-yl)amino]-1-oxoprop-2-yl}-3'-[(2-cyanoethoxy)(diisopropylamino)phosphinooxy]-3'-deoxythymidine-5'-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  Oligonucleotide Analogs with Peptide Internucleotide Linkages

  摘要：

  Oligonucleotide analogs containing one or a few glycine, L-, and D-alanine or L-and D-phenylalanine residues instead of phosphodiesterinternucleotide linkages were synthesized. The stability of the duplexes formed by modified oligonucleotides and their wildtype complements was studied. Oligonucleotides with D-alanine residues in internucleotide linkages form duplexes more stable than native ones (Tm +0.2 degrees C per modification), whereas other modifications destabilize the duplexes.

  DOI：

  10.1080/15257770.2010.542790