1-O-methyl-3-O,5-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2-oxo-β-D-ribose | 897035-15-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二氢呋喃
• 英文名称: 1-O-methyl-3-O,5-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2-oxo-β-D-ribose
• 英文别名: (6aR,8R,9aR)-8-methoxy-2,2,4,4-tetra(propan-2-yl)-6a,9a-dihydro-6H-furo[3,2-f][1,3,5,2,4]trioxadisilocin-9-one
• CAS: 897035-15-3
• 化学式: C₁₈H₃₆O₆Si₂
• 分子量: 404.651
• InChiKey: WREJRRJEEAUHNM-KBAYOESNSA-N

物化性质

• 沸点：
  394.7±42.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.03±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.88
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.94
• 拓扑面积：
  63.2
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-O-methyl-3-O,5-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2-oxo-β-D-ribose 在 sodium tetrahydroborate 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 (6aR,8R,9R,9aS)-2,2,4,4-tetraisopropyl-8-methoxytetrahydro-6H-furo[3,2- f][1,3,5,2,4]trioxadisilocin-9-ol
  参考文献：
  名称：

  Transition State of ADP-Ribosylation of Acetyllysine Catalyzed by Archaeoglobus fulgidus Sir2 Determined by Kinetic Isotope Effects and Computational Approaches

  摘要：

  Sirtuins are protein-modifying enzymes distributed throughout all forms of life. These enzymes bind NAD(+), a universal metabolite, and react it with acetyllysine residues to effect deacetylation of protein side chains. This NAD(+)-dependent deacetylation reaction has been observed for sirtuin enzymes derived from archaeal, eubacterial, yeast, metazoan, and mammalian species, suggesting conserved chemical mechanisms for these enzymes. The first chemical step of deacetylation is the reaction of NAD(+) with an acetyllysine residue which forms an enzyme-bound ADPR-peptidylimidate intermediate and nicotinamide. In this manuscript, the transition state for the ADP-ribosylation of acetyllysine is solved for an Archaeoglobus fulgidus sirtuin (Af2Sir2). Kinetic isotope effects (KIEs) were obtained by the competitive substrate method and were [1(N)-N-15] = 1.024(2), [1'(N)-C-14] = 1.014(4), [1'(N)-H-3] = 1.300(3), [2'(N)-H-3] = 1.099(5), [4'(N)-H-3] = 0.997(2), [5'(N)-H-3] = 1.020(5), [4'(N)-O-18] = 0.984(5). KIEs were calculated for candidate transition state structures using computational methods (Gaussian 03 and ISOEFF 98) in order to match computed and experimentally determined KIEs to solve the transition state. The results indicate that the enzyme stabilizes a highly dissociated oxocarbenium ionlike transition state with very low bond orders to the leaving group nicotinamide and the nucleophile acetyllysine. A concerted yet highly asynchronous substitution mechanism forms the ADPR-peptidylimidate intermediate of the sirtuin deacetylation reaction.

  DOI：

  10.1021/ja910342d
• 作为产物：
  描述：

  1,3二氯-1,1,3,3-四异丙基二硅氧烷 在 吡啶 、 2-碘酰苯甲酸 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 1-O-methyl-3-O,5-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2-oxo-β-D-ribose
  参考文献：
  名称：

  C-2'-支化阿拉伯核苷的合成及抗癌和抗病毒活性。

  摘要：

  d-阿拉伯呋喃糖基-嘧啶和-嘌呤核苷类似物在 C2' 位置含有烷硫基-、乙酰硫基-或 1-硫代糖取代基，由相应的 3',5'-O-甲硅烷缩醛保护的核苷 2'-外亚甲基通过光引发制备，自由基介导的氢硫醇化反应。虽然氢硫醇化的立体化学结果取决于硫醇和呋喃糖苷配基的结构，但通常可以获得高 d-阿拉伯糖选择性。通过 MTT 法研究了阿拉伯糖核苷对肿瘤性 SCC（小鼠鳞状细胞）和永生化对照 HaCaT（人角质形成细胞）细胞系的细胞毒作用。三个含有 C2' 的嘧啶核苷 -丁基硫烷基甲基或-乙酰硫甲基基团在低微摩尔浓度下显示出有希望的细胞毒性，并且对肿瘤细胞具有良好的选择性。使用甲基 β-d-阿拉伯呋喃糖苷参考化合物的 SAR 分析表明，甲硅烷基保护基团、核碱基和相应的 C2' 取代基对细胞生长抑制活性至关重要。通过近红外活细胞成像研究了三种活性最强的核苷类似物对细胞毒性参数的影响，如细胞大小、分裂时间和细胞生成时间，结果表明

  DOI：

  10.3390/ijms232012566

文献信息

• [EN] ALKYNE CONTAINING NUCLEOTIDE AND NUCLEOSIDE THERAPEUTIC COMPOSITIONS AND USES RELATED THERETO<br/>[FR] COMPOSITIONS THÉRAPEUTIQUES À BASE DE NUCLÉOTIDES ET NUCLÉOSIDES CONTENANT UN ALCYNE ET UTILISATIONS ASSOCIÉES
  申请人：UNIV EMORY

  公开号：WO2017189978A1

  公开（公告）日：2017-11-02

  This disclosure relates to nucleotide and nucleoside therapeutic compositions and uses in treating infectious diseases, viral infections, and cancer, where the base of the nucleotide or nucleoside contains at least one thiol, thione or thioether.

  这份披露涉及到核苷酸和核苷类治疗组合物，用于治疗传染病、病毒感染和癌症，其中核苷酸或核苷的碱基至少含有一个硫醇、硫酮或硫醚。
• 一种索氟布韦的制备方法
  申请人：常州市勇毅生物药业有限公司

  公开号：CN106565805B

  公开（公告）日：2020-04-14

  本发明涉及医药技术领域，特别涉及一种索氟布韦的制备方法，该方法以D‑核糖为起始原料，通过酯化反应、羟基保护反应、羟基氧化反应、甲基化反应、氟化反应、对接反应、水解、与磷酸酯侧链相接等一系列反应，最终得到产物索氟布韦。本发明制备索氟布韦的方法以D‑核糖为原料，原料易得且成本低，反应中采用一步水解反应步骤少，易于工业化。