基于结构的药物设计用于开发新型的基于Mcl-1的
1-羟基-2-萘甲酸的小分子
抑制剂。通过利用具有R263的盐桥以及与蛋白质p2口袋的相互作用来驱动
配体设计。重要的是,目标分子仅需两个合成步骤即可进入,这表明进一步的优化将需要最少的合成工作。使用通过
配体竞争饱和位点识别(SILCS)方法进行分子建模,以定性指导
配体设计,并开发定量模型来确定
抑制剂对Mcl-1和Bcl-2相对Bcl-x L的结合亲和力以及对与两种蛋白质结合的特异性。结果表明,最有利的结合
配体在p2口袋中的疏
水相互作用占主导地位(3bl:K i =31nM)。化合物对Mcl-1的选择性是Bcl-x L的19倍。
抑制剂的选择性是由与Mcl-1和Bcl-x L中较深的p2口袋相互作用而驱动的。本发明化合物的基于SILCS的
SAR代表了开发Mcl-1特异性
抑制剂的基础,所述Mcl-1特异性
抑制剂具有治疗广泛的实体瘤和血液系统癌症,包括急性髓细胞白血病的潜力。