GRCTKSIPPRCH-NH2 | 1426560-21-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机聚合物 - 多肽
• 英文名称: GRCTKSIPPRCH-NH2
• 英文别名: GRCTKSIPPRCH-NH₂
• CAS: 1426560-21-5
• 化学式: C₅₅H₉₄N₂₂O₁₄S₂
• 分子量: 1351.62
• InChiKey: HJDDFJCCMPSGNN-GWFXKQNSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -7.79
• 重原子数：
  93.0
• 可旋转键数：
  25.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.69
• 拓扑面积：
  590.59
• 氢给体数：
  21.0
• 氢受体数：
  21.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  H-Gly-Arg-Cys-Thr-Lys-Ser-Ile-Pro-Pro-Arg-Cys-His-NH2 在 碳酸氢铵 作用下， 以 水 为溶剂， 以10.5 mg的产率得到GRCTKSIPPRCH-NH2
  参考文献：
  名称：

  Combinatorial tuning of peptidic drug candidates: high-affinity matriptase inhibitors through incremental structure-guided optimization

  摘要：

  在此我们报告了一种便捷的策略，用于开发新型高效的肽类抑制剂，这些抑制剂针对与胰蛋白酶类似的丝氨酸蛋白酶matriptase，基于向日葵胰蛋白酶抑制剂-1（SFTI-1[1,14]）的单环变体。我们筛选了具有渐进性修饰的SFTI-1[1,14]变体，以寻找有利的结合特性。这个化合物库包含6种肽和16种含有三唑的肽模仿物，采用结构导向的合理设计建立，并通过利用“铜点击”化学的发散策略合成。最有利的氨基酸替代被组合到一个框架中，生成强效的SFTI-1衍生的matriptase抑制剂-1（SDMI-1）和截短的十二肽变体（SDMI-2），具有单数纳摩尔抑制常数。计算机模拟研究表明，与母肽相比，改善的matriptase亲和力是由于成功建立了基本抑制剂侧链与目标酶表面酸性残基之间额外的有利质子供体-接受者相互作用。SDMI-1和SDMI-2是在接近生理pH下有效抑制药用相关蛋白酶matriptase的强效抑制剂，因此可能在治疗或诊断中具有应用潜力。

  DOI：

  10.1039/c3ob27469a

文献信息

• Improving the Selectivity of Engineered Protease Inhibitors: Optimizing the P2 Prime Residue Using a Versatile Cyclic Peptide Library
  作者：Simon J. de Veer、Conan K. Wang、Jonathan M. Harris、David J. Craik、Joakim E. Swedberg

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.5b01148

  日期：2015.10.22

  Standard mechanism inhibitors are attractive design templates for engineering reversible serine protease inhibitors. When optimizing interactions between the inhibitor and target protease, many studies focus on the nonprimed segment of the inhibitor's binding loop (encompassing the contact beta-strand). However, there are currently few methods for screening residues on the primed segment. Here, we designed a synthetic inhibitor library (based on sunflower trypsin inhibitorI) for characterizing the P2' specificity of various serine proteases. Screening the library against 13 different proteases revealed unique P2' preferences for trypsin, ch-ymotrypsin, matriptase, plasmin, thrombin, four kallikrein-related peptidases, and several clotting factors. Using this information to modify existing engineered inhibitors yielded new variants that showed considerably improved selectivity, reaching up to 7000-fold selectivity over certain off-target proteases. Our study demonstrates the importance of the P2' residue in standard mechanism inhibition and unveils a new approach for screening P2' substitutions that will benefit future inhibitor engineering studies.