CpG | 172793-53-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - （3'->5'）-二核苷酸和类似物
• 英文名称: CpG
• CAS: 172793-53-2
• 化学式: C₁₉H₂₄N₈O₁₂P
• 分子量: 587.42
• InChiKey: CTMZLDSMFCVUNX-VMIOUTBZSA-M

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.72
• 重原子数：
  40.0
• 可旋转键数：
  8.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.53
• 拓扑面积：
  308.47
• 氢给体数：
  7.0
• 氢受体数：
  19.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  CpG 在 venom exonuclease 作用下， 生成 3'-(二氢磷酸)鸟嘌呤核苷 、 胞苷
  参考文献：
  名称：

  Studies on transfer ribonucleic acids and related compounds. XXXIV. Stepwise diester or partial triester synthesis of penta- to octanucleotides corresponding to residues 41-46, 47-54, 61-65 and 66-71 of tRNAfMet of E. coli.

  摘要：

  通过逐步添加单核苷酸，合成了对应于tRNAMetf第41-46位和第47-54位的六核苷酸和八核苷酸。这个八核苷酸是通过这种方法合成的最大的寡核糖核酸。通过部分三酯化中间体，合成了一个五核苷酸（第61-65位）和一个六核苷酸（第66-71位）。去阻断产物通过离子交换色谱法进行纯化，并利用酶解法进行表征。这些寡核苷酸被用作RNA连接酶连接反应中的底物。

  DOI：

  10.1248/cpb.28.2450
• 作为产物：
  描述：

  在 氨 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 生成 CpG
  参考文献：
  名称：

  Studies on transfer ribonucleic acids and related compounds. XXXIV. Stepwise diester or partial triester synthesis of penta- to octanucleotides corresponding to residues 41-46, 47-54, 61-65 and 66-71 of tRNAfMet of E. coli.

  摘要：

  通过逐步添加单核苷酸，合成了对应于tRNAMetf第41-46位和第47-54位的六核苷酸和八核苷酸。这个八核苷酸是通过这种方法合成的最大的寡核糖核酸。通过部分三酯化中间体，合成了一个五核苷酸（第61-65位）和一个六核苷酸（第66-71位）。去阻断产物通过离子交换色谱法进行纯化，并利用酶解法进行表征。这些寡核苷酸被用作RNA连接酶连接反应中的底物。

  DOI：

  10.1248/cpb.28.2450

文献信息

• Regioselective cleavage of di- and poly-ribonucleotides induced by cyclodextrins (cyclomalto-oligosaccharides)
  作者：Makoto Komiyama

  DOI：10.1016/0008-6215(89)85169-9

  日期：1989.10

  Abstract Cyclodextrins (cyclomalto-oligosaccharides, CDs) induce regioselective cleavage of the 3′,5′-phosphodiester linkages in di- and poly-ribonucleotides at pH 11.08 and 50°. 0.15 m Cyclomaltohexaose (α-CD) mediates the cleavage of CpA, CpC, CpG, and CpU to give 96–97% of cytidine 3′-phosphate together with adenosine, cytidine, guanosine, and uridine, respectively. In the absence of α-CD, 50–52%

  摘要环糊精（环麦芽寡糖，CD）在pH 11.08和50°下诱导二和多核糖核苷酸中3'，5'-磷酸二酯键的区域选择性切割。0.15 m的环己二糖（α-CD）介导CpA，CpC，CpG和CpU的裂解，分别产生96–97％的胞苷3'-磷酸以及腺苷，胞苷，鸟苷和尿苷。在没有α-CD的情况下，形成了50-52％的胞苷2'-磷酸副产物。α-CD还促进了ApA和ApC的腺苷3'-磷酸的形成，GpG的鸟苷3'-磷酸的形成和UpU的尿苷3'-磷酸的形成。相反，β-CD和γ-CD增强了相应的2'-磷酸盐的形成。还实现了poly [A]，poly [C]，poly [G]和poly [U]的区域选择性切割。