N⁴-(3-Aminopropyl)-2'-deoxycytidine | 109082-26-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: N⁴-(3-Aminopropyl)-2'-deoxycytidine
• 英文别名: n 4-(3-Aminopropyl)-2'-deoxycytidine；4-(3-aminopropylamino)-1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidin-2-one
• CAS: 109082-26-0
• 化学式: C₁₂H₂₀N₄O₄
• 分子量: 284.315
• InChiKey: IJYYDUULKFOYSG-IQJOONFLSA-N

物化性质

• 沸点：
  522.8±60.0 °C(predicted)
• 密度：
  1.54±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.4
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.67
• 拓扑面积：
  120
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N⁴-(3-Aminopropyl)-2'-deoxycytidine 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 三乙胺 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 26.0h， 生成 N⁴-(3-(N-(Trifluoroacetyl)amino)propyl)-5'-dimethoxytrityl-2'-deoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  含有共价连接分子标记的 DNA 寡聚体和双链体的合成和表征：通过热力学和光学光谱测量比较生物素、荧光素和芘标记

  摘要：

  Synthese de nucleotides modates, de la cytidine et de l'uridine, permettant la liaison avec des composesfluores tel que la biotine, le pyrenebutyrate-1, la fluorescesine, afin de rendrefluorescence des oligonucleotides

  DOI：

  10.1021/ja00200a011
• 作为产物：
  描述：

  2'-脱氧胞苷盐酸盐 、 1,3-丙二胺 在 sodium hydrogensulfite 作用下， 反应 168.0h， 以97.3%的产率得到N⁴-(3-Aminopropyl)-2'-deoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  含有共价连接分子标记的 DNA 寡聚体和双链体的合成和表征：通过热力学和光学光谱测量比较生物素、荧光素和芘标记

  摘要：

  Synthese de nucleotides modates, de la cytidine et de l'uridine, permettant la liaison avec des composesfluores tel que la biotine, le pyrenebutyrate-1, la fluorescesine, afin de rendrefluorescence des oligonucleotides

  DOI：

  10.1021/ja00200a011

文献信息

• TELSER, JOSHUA;CRUICKSHANK, KENNETH A.;MORRISON, LARRY E.;NETZEL, THOMAS +, J. AMER. CHEM. SOC., 111,(1989) N8, C. 6966-6976
  作者：TELSER, JOSHUA、CRUICKSHANK, KENNETH A.、MORRISON, LARRY E.、NETZEL, THOMAS +

  DOI：——

  日期：——
• CYTIDINE ANALOGS
  申请人：INTEGRATED GENETICS, INC.

  公开号：EP0222889A1

  公开（公告）日：1987-05-27
• EP0222889A4
  申请人：——

  公开号：EP0222889A4

  公开（公告）日：1988-09-28
• US5405950A
  申请人：——

  公开号：US5405950A

  公开（公告）日：1995-04-11
• [EN] CYTIDINE ANALOGS
  申请人：INTEGRATED GENETICS, INC.

  公开号：WO1986006726A1

  公开（公告）日：1986-11-20

  (EN) An oligonucleotide containing at least one cytidine analog labeled at C4 with a reporter group.(FR) Un oligonucléotide contient au moins un analogue de cytidine marqué en C4 avec un groupe rapporteur.