N⁴-(3-(N-(Trifluoroacetyl)amino)propyl)-2'-deoxycytidine | 109082-27-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: N⁴-(3-(N-(Trifluoroacetyl)amino)propyl)-2'-deoxycytidine
• 英文别名: N-(3-trifluoroacetylaminopropyl)-2'-deoxycytidine；2,2,2-trifluoro-N-[3-[[1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-2-oxopyrimidin-4-yl]amino]propyl]acetamide
• CAS: 109082-27-1
• 化学式: C₁₄H₁₉F₃N₄O₅
• 分子量: 380.324
• InChiKey: KCDSHKMDVQVYHB-IQJOONFLSA-N

物化性质

• 密度：
  1.61±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.6
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.64
• 拓扑面积：
  124
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N⁴-(3-(N-(Trifluoroacetyl)amino)propyl)-2'-deoxycytidine 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 N⁴-(3-(N-(Trifluoroacetyl)amino)propyl)-5'-dimethoxytrityl-2'-deoxycytidine-3'-(O-methyl-N,N-diisopropyl)phosphoramidate
  参考文献：
  名称：

  含有共价连接分子标记的 DNA 寡聚体和双链体的合成和表征：通过热力学和光学光谱测量比较生物素、荧光素和芘标记

  摘要：

  Synthese de nucleotides modates, de la cytidine et de l'uridine, permettant la liaison avec des composesfluores tel que la biotine, le pyrenebutyrate-1, la fluorescesine, afin de rendrefluorescence des oligonucleotides

  DOI：

  10.1021/ja00200a011
• 作为产物：
  描述：

  2'-脱氧胞苷盐酸盐 在 sodium hydrogensulfite 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 192.0h， 生成 N⁴-(3-(N-(Trifluoroacetyl)amino)propyl)-2'-deoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  含有共价连接分子标记的 DNA 寡聚体和双链体的合成和表征：通过热力学和光学光谱测量比较生物素、荧光素和芘标记

  摘要：

  Synthese de nucleotides modates, de la cytidine et de l'uridine, permettant la liaison avec des composesfluores tel que la biotine, le pyrenebutyrate-1, la fluorescesine, afin de rendrefluorescence des oligonucleotides

  DOI：

  10.1021/ja00200a011

文献信息

• TELSER, JOSHUA;CRUICKSHANK, KENNETH A.;MORRISON, LARRY E.;NETZEL, THOMAS +, J. AMER. CHEM. SOC., 111,(1989) N8, C. 6966-6976
  作者：TELSER, JOSHUA、CRUICKSHANK, KENNETH A.、MORRISON, LARRY E.、NETZEL, THOMAS +

  DOI：——

  日期：——
• US5405950A
  申请人：——

  公开号：US5405950A

  公开（公告）日：1995-04-11
• US5633364A
  申请人：——

  公开号：US5633364A

  公开（公告）日：1997-05-27
• Synthesis and characterization of DNA oligomers and duplexes containing covalently attached molecular labels: comparison of biotin, fluorescein, and pyrene labels by thermodynamic and optical spectroscopic measurements
  作者：Joshua Telser、Kenneth A. Cruickshank、Larry E. Morrison、Thomas L. Netzel

  DOI：10.1021/ja00200a011

  日期：1989.8

  Synthese de nucleotides modifies, de la cytidine et de l'uridine, permettant la liaison avec des composes fluorescents tel que la biotine, le pyrenebutyrate-1, la fluorescesine, afin de rendre fluorescent des oligonucleotides

  Synthese de nucleotides modates, de la cytidine et de l'uridine, permettant la liaison avec des composesfluores tel que la biotine, le pyrenebutyrate-1, la fluorescesine, afin de rendrefluorescence des oligonucleotides