Rational Design, Synthesis, and Mechanism of (3<i>S</i>,4<i>R</i>)-3-Amino-4-(difluoromethyl)cyclopent-1-ene-1-carboxylic Acid: Employing a Second-Deprotonation Strategy for Selectivity of Human Ornithine Aminotransferase over GABA Aminotransferase
作者:Wei Zhu、Arseniy Butrin、Rafael D. Melani、Peter F. Doubleday、Glaucio Monteiro Ferreira、Mauricio T. Tavares、Thahani S. Habeeb Mohammad、Brett A. Beaupre、Neil L. Kelleher、Graham R. Moran、Dali Liu、Richard B. Silverman
DOI:10.1021/jacs.2c00924
日期:2022.3.30
Human ornithine aminotransferase (hOAT) is a pyridoxal 5′-phosphate (PLP)-dependent enzyme that contains a similar active site to that of γ-aminobutyric acid aminotransferase (GABA-AT). Recently, pharmacological inhibition of hOAT was recognized as a potential therapeutic approach for hepatocellular carcinoma. In this work, we first studied the inactivation mechanisms of hOAT by two well-known GABA-AT
人鸟氨酸转氨酶 (hOAT) 是一种 5'-磷酸吡哆醛 (PLP) 依赖性酶,其活性位点与 γ-氨基丁酸转氨酶 (GABA-AT) 相似。最近,hOAT 的药理学抑制被认为是肝细胞癌的潜在治疗方法。在这项工作中,我们首先研究了两种著名的 GABA-AT 灭活剂(CPP-115和OV329)对 hOAT 的灭活机制。受这两种氨基转移酶灭活机制差异的启发,设计并合成了一系列类似物,从而发现了类似物10b作为一种高选择性和有效的 hOAT 抑制剂。完整的蛋白质质谱、蛋白质晶体学和透析实验表明,10b在 hOAT 的活性位点转化为不可逆的紧密结合加合物 ( 34 ),不饱和类似物 ( 11 )也是如此。10b和11之间的动力学研究比较表明,活性中间体 ( 17b ) 仅在 hOAT 中产生,而不在 GABA-AT 中产生。分子对接研究和 p Ka计算计算突出了手性和环内双键对抑制活性的重要性。10