3'-azido-3'-deoxy-5'-O-monomethoxytritylthymidine | 152388-78-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 3'-azido-3'-deoxy-5'-O-monomethoxytritylthymidine
• 英文别名: 1-[(2R,4S,5S)-4-azido-5-[[(4-methoxyphenyl)-diphenylmethoxy]methyl]oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 152388-78-8
• 化学式: C₃₀H₂₉N₅O₅
• 分子量: 539.591
• InChiKey: GAKMADAUFBBJAW-OYUWMTPXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.2
• 重原子数：
  40
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.27
• 拓扑面积：
  91.5
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3'-azido-3'-deoxy-5'-O-monomethoxytritylthymidine 在 对甲苯磺酸 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 齐多夫定
  参考文献：
  名称：

  核苷酸。第XLVI部分。通过改进的亚磷酰胺方法合成抗病毒活性核苷的磷脂缀合物†

  摘要：

  将改进的亚磷酰胺策略用于使用β-消除保护基团合成寡核苷酸到磷脂化学中的应用为合成AZT（6）和虫草素的磷脂结合物提供了可能性。3'-叠氮基-3'-脱氧胸腺嘧啶核苷（6）的合成是通过一种新的分离方法完成的，无需色谱纯化步骤，总产率为50％。保护虫草素（= 3'-脱oxyadenosine）衍生物，该Ñ 6，2,2'-双[2-（4-硝基苯基）乙氧基羰基]虫草素（12）和所述Ñ 6，5'-双[2-（4-硝基苯]乙氧基羰基] cordycepin（13）通过已知方法制备，并直接将N酰化6- [2-（4-硝基苯基）乙氧基羰基] cordycepin（9）。这些受保护的核苷和3'-叠氮基-3'-脱oxythymidine（6）与反应新合成的和正确表征的脂质-亚磷酰胺21-25，由1个催化ħ四唑，为相应的核苷的缀合物的磷脂26-38高产。脱保护作用是通过在质子惰性溶剂中用1,8-二氮杂双环[5.4.0]

  DOI：

  10.1002/hlca.19960790210
• 作为产物：
  描述：

  methanesulfonic acid (2R,3S,5R)-2-[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethoxymethyl]-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)tetrahydrofuran-3-yl ester 在 molecular sieve 、 叠氮化锂 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 21.0h， 生成 3'-azido-3'-deoxy-5'-O-monomethoxytritylthymidine
  参考文献：
  名称：

  核苷酸。第XLVI部分。通过改进的亚磷酰胺方法合成抗病毒活性核苷的磷脂缀合物†

  摘要：

  将改进的亚磷酰胺策略用于使用β-消除保护基团合成寡核苷酸到磷脂化学中的应用为合成AZT（6）和虫草素的磷脂结合物提供了可能性。3'-叠氮基-3'-脱氧胸腺嘧啶核苷（6）的合成是通过一种新的分离方法完成的，无需色谱纯化步骤，总产率为50％。保护虫草素（= 3'-脱oxyadenosine）衍生物，该Ñ 6，2,2'-双[2-（4-硝基苯基）乙氧基羰基]虫草素（12）和所述Ñ 6，5'-双[2-（4-硝基苯]乙氧基羰基] cordycepin（13）通过已知方法制备，并直接将N酰化6- [2-（4-硝基苯基）乙氧基羰基] cordycepin（9）。这些受保护的核苷和3'-叠氮基-3'-脱oxythymidine（6）与反应新合成的和正确表征的脂质-亚磷酰胺21-25，由1个催化ħ四唑，为相应的核苷的缀合物的磷脂26-38高产。脱保护作用是通过在质子惰性溶剂中用1,8-二氮杂双环[5.4.0]

  DOI：

  10.1002/hlca.19960790210

文献信息

• Synthesis of 3′-Deoxy-3′ and 5′-Deoxy-5′-[4-(Purin-9-yl/Pyrimidin-1-yl) methyl-1,2,3-Triazol-1-yl]thymidine via 1,3-Dipolar Cycloaddition
  作者：H. B. Lazrek、M. Taourirte、T. Oulih、Y. Kabbaj、J. L. Barascut、J. L. Imbach、N. A. Almasoudi、W. Pfleiderer

  DOI：10.1080/07328319708006135

  日期：1997.7

  Synthesis of new 3'-deoxy-3' and 5'-deoxy-5'-[(4-(purin-9-yl/pyrimidin-1-yl)methyl-1,2,3- 8a-g, 10a-g from 3'-azido-3'-deoxy-5'-O-monomethoxytrityl-thymidine and 5'-azido-5'-deoxythymidine respectively are described. The key step is the 1,3-dipolar cycloaddition between the azido group and N-9/N-1-propargylpurine/pyrimidine derivatives.
• Incorporation of positively charged deoxynucleic S-Methylthiourea linkages into oligodeoxyribonucleotides
  作者：Hemavathi Challa、Thomas C Bruice

  DOI：10.1016/s0960-894x(01)00455-3

  日期：2001.9

  Oligodeoxyribonucleic acids (15- and 18-mers) containing both negatively charged phosphate and positively charged S-methyl thiourea internucleoside linkages (DNmt/DNA chimera) have been synthesized. DNA binding characteristics and nuclease resistance of DNmt/DNA chimera have been evaluated. (C) 2001 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.
• Synthesis of 3′-Deoxy-3′-[4-(pyrimidin-1-yl)methyl-1,2,3-triazol-1-yl]thymidine via 1,3-Dipolar Cycloaddition
  作者：M. Tourirte、T. Oulih、H. B. Lazrek、J. L. Barascut、J. L. Imbach、N. A. Almasoudi

  DOI：10.1081/ncn-120026399

  日期：2003.11

  The synthesis of new 3'-deoxy-3'-[4-(pyrimidin-1-yl)methyl-1,2,3-triazol-1-yl]-thymidine 6a-f, from 3'-azido-3'-deoxy-5'-O-monomethoxytrityl-thymidine is described. The key step is the 1,3-dipolar cycloaddition between the azido group of the protected AZT 3 and N-1-propargylpyrimidine derivatives 2a-f. All new derivatives 6a-f were evaluated for their inhibitory effects against the replication of HIV-1 (IIIB), HIV-2 (ROD). No marked activity was found.
• Nucleotides. Part XLVI. The synthesis of phospholipid conjugates of antivirally active nucleosides by the improved phosphoramidite methodology
  作者：Harald Sigmund、Wolfgang Pfleiderer

  DOI：10.1002/hlca.19960790210

  日期：1996.3.20

  respectively. These protected nucleosides and the 3′-azido-3′-de-oxythymidine (6) reacted with newly synthesized and properly characterized lipid-phosphoramidites 21–25, catalyzed by 1H-tetrazole, to the corresponding nucleoside-phospholipid conjugates 26–38 in high yield. The deprotection was accomplished via β-elimination with 1,8-diazabicyclo[5.4.0]undec-7-ene (DBU) in aprotic solvents to give analytically

  将改进的亚磷酰胺策略用于使用β-消除保护基团合成寡核苷酸到磷脂化学中的应用为合成AZT（6）和虫草素的磷脂结合物提供了可能性。3'-叠氮基-3'-脱氧胸腺嘧啶核苷（6）的合成是通过一种新的分离方法完成的，无需色谱纯化步骤，总产率为50％。保护虫草素（= 3'-脱oxyadenosine）衍生物，该Ñ 6，2,2'-双[2-（4-硝基苯基）乙氧基羰基]虫草素（12）和所述Ñ 6，5'-双[2-（4-硝基苯]乙氧基羰基] cordycepin（13）通过已知方法制备，并直接将N酰化6- [2-（4-硝基苯基）乙氧基羰基] cordycepin（9）。这些受保护的核苷和3'-叠氮基-3'-脱oxythymidine（6）与反应新合成的和正确表征的脂质-亚磷酰胺21-25，由1个催化ħ四唑，为相应的核苷的缀合物的磷脂26-38高产。脱保护作用是通过在质子惰性溶剂中用1,8-二氮杂双环[5.4.0]