oxy-O-(dimethoxytrityl)-6-hexanol | 919770-05-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: oxy-O-(dimethoxytrityl)-6-hexanol
• 英文别名: 6-[Bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy]hexanal；6-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]hexanal
• CAS: 919770-05-1
• 化学式: C₂₇H₃₀O₄
• 分子量: 418.533
• InChiKey: YQNWTKAHFKPDGZ-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  542.6±50.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.091±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.2
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.3
• 拓扑面积：
  44.8
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  oxy-O-(dimethoxytrityl)-6-hexanol 在 吡啶 、 咪唑 、 4-二甲氨基吡啶 、 甲基磺酰胺 、 AD-mix-α 、 potassium tert-butylate 、 水 作用下， 以 四氢呋喃 、 4-(dicyanomethylene)-2-methyl-6-(p-dimethylaminostyryl)-4H-pyran 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 叔丁醇 为溶剂， 反应 20.5h， 生成 [4-Acetyloxy-10-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]-1-hydroxydecan-5-yl] acetate
  参考文献：
  名称：

  Preparation of Templates for Nucleic Acid Sequencing

  摘要：

  这项发明涉及用于生成核酸测序反应模板的方法，包括：提供至少一种双链核酸分子，其中双链核酸分子的两条链均连接在固体支持物上的5'端，裂解双链核酸分子的一条或两条链，并将裂解的链置于变性条件下，以去除未连接到固体支持物的裂解链部分，从而生成用于核酸测序反应的部分或基本上单链模板。

  公开号：

  US20150343410A1
• 作为产物：
  描述：

  O-dimethoxytrityl-1,6-hexanediol 在 sodium hypochlorite 、 2,2,6,6-四甲基哌啶氧化物 、 碳酸氢钠 、 potassium bromide 作用下， 以 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 0.5h， 生成 oxy-O-(dimethoxytrityl)-6-hexanol
  参考文献：
  名称：

  COMPOSITIONS AND METHODS FOR CHEMICAL CLEAVAGE AND DEPROTECTION OF SURFACE-BOUND OLIGONUCLEOTIDES

  摘要：

  本公开的实施例涉及用于多核苷酸测序模板制备的方法。具体而言，本公开涉及通过过渡金属络合物（例如钯络合物或镍络合物）裂解固定在固体支持物上的双链多核苷酸的一条或多条第一链，以便为测序做准备。进一步公开涉及通过Na2S2O4裂解固定在含有偶氮苯联结剂的固体支持物上的双链多核苷酸的一条或多条第二链来线性化团簇化的多核苷酸。还公开了含有3'磷酸酯基团阻断基团的核苷酸和寡核苷酸，以及使用氟化试剂去除这些基团的方法。

  公开号：

  US20190352327A1

文献信息

• Method for pairwise sequencing of target polynucleotides
  申请人：Illumina Cambridge Limited

  公开号：US09267173B2

  公开（公告）日：2016-02-23

  The invention relates to methods for pairwise sequencing of a double-stranded polynucleotide template, which methods result in the sequential determination of nucleotide sequences in two distinct and separate regions of the polynucleotide template. Using the methods of the invention it is possible to obtain two linked or paired reads of sequence information from each double-stranded template on a clustered array, rather than just a single sequencing read from one strand of the template.

  该发明涉及一种双链多核苷酸模板的成对测序方法，该方法导致在多核苷酸模板的两个不同和独立区域中顺序确定核苷酸序列。利用该发明的方法，可以从聚集阵列上的每个双链模板获得两个连接或成对的序列信息读取，而不仅仅是从模板的一条链上获得单个测序读取。
• Preparation of Templates for Nucleic Acid Sequencing
  申请人：Illumina Cambridge Limited

  公开号：US20150343410A1

  公开（公告）日：2015-12-03

  The invention relates to methods of generating templates for a nucleic acid sequencing reaction which comprise: providing at least one double-stranded nucleic acid molecule, wherein both strands of the double-stranded nucleic acid molecule are attached to a solid support at the 5′ end, cleaving one or both strands of the double-stranded nucleic acid molecule, and subjecting the cleaved strand(s) to denaturing conditions to remove the portion of the cleaved strand(s) not attached to the solid support, thereby generating a partially or substantially single-stranded template for a nucleic acid sequencing reaction.

  这项发明涉及用于生成核酸测序反应模板的方法，包括：提供至少一种双链核酸分子，其中双链核酸分子的两条链均连接在固体支持物上的5'端，裂解双链核酸分子的一条或两条链，并将裂解的链置于变性条件下，以去除未连接到固体支持物的裂解链部分，从而生成用于核酸测序反应的部分或基本上单链模板。
• Preparation of templates for nucleic acid sequencing
  申请人：Illumina Cambridge Limited

  公开号：EP2298930A1

  公开（公告）日：2011-03-23

  The present invention relates to a method of generating a template for a nucleic acid sequencing reaction comprising, (i) providing at least one double-stranded nucleic acid molecule attached to a solid support at the 5' end, (ii) cleaving one or both strands of the double-stranded nucleic acid molecule at an abasic site, and (iii) subjecting the cleaved strand(s) to denaturing conditions to remove the portion of the cleaved strand(s) not attached to the solid support, thereby generating a partially or substantially single-stranded template for a nucleic acid sequencing reaction.

  本发明涉及一种生成核酸测序反应模板的方法，包括 (i) 提供至少一个在 5'端连接到固体支持物上的双链核酸分子、 (ii) 在消旋位点裂解双链核酸分子的一条或两条链，以及 (iii) 将裂解后的链置于变性条件下，以去除裂解后的链中未连接到固体支持物上的部分，从而生成用于核酸测序反应的部分或基本单链模板。
• Method for sequencing a polynucleotide template
  申请人：Illumina Cambridge Limited

  公开号：EP2453023A2

  公开（公告）日：2012-05-16

  The invention relates to methods for pairwise sequencing of a double-stranded polynucleotide template, which methods result in the sequential determination of nucleotide sequences in two distinct and separate regions of the polynucleotide template. Using the methods of the invention it is possible to obtain two linked or paired reads of sequence information from each double-stranded template on a clustered array, rather than just a single sequencing read from one strand of the template.

  本发明涉及对双链多核苷酸模板进行成对测序的方法，该方法可依次测定多核苷酸模板两个不同独立区域的核苷酸序列。使用本发明的方法可以从聚类阵列上的每个双链模板中获得两个相连或成对的序列信息读数，而不是仅从模板的一条链中获得一个测序读数。
• PREPARATION OF TEMPLATES FOR NUCLEIC ACID SEQUENCING
  申请人：Illumina Cambridge Limited

  公开号：EP1910559B1

  公开（公告）日：2012-06-13