6-[2]naphthylmethyl-2-thioxo-2,3-dihydro-1H-pyrimidin-4-one | 108618-38-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 萘
• 英文名称: 6-[2]naphthylmethyl-2-thioxo-2,3-dihydro-1H-pyrimidin-4-one
• 英文别名: 6-[2]Naphthylmethyl-2-thioxo-2,3-dihydro-1H-pyrimidin-4-on；4(1H)-Pyrimidinone, 2,3-dihydro-6-(2-naphthalenylmethyl)-2-thioxo-；6-(naphthalen-2-ylmethyl)-2-sulfanylidene-1H-pyrimidin-4-one
• CAS: 108618-38-8
• 化学式: C₁₅H₁₂N₂OS
• 分子量: 268.339
• InChiKey: RTABYIHINFKBLO-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 熔点：
  267-268 °C
• 密度：
  1.35±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.8
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.07
• 拓扑面积：
  73.2
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  2

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-碘丁烷 、 6-[2]naphthylmethyl-2-thioxo-2,3-dihydro-1H-pyrimidin-4-one 在 potassium carbonate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 8.0h， 以62%的产率得到2-sec-Butylsulfanyl-6-naphthalen-2-ylmethyl-3H-pyrimidin-4-one
  参考文献：
  名称：

  二氢（烷硫基）（萘基甲基）氧嘧啶：S-DABO系列的新型非核苷逆转录酶抑制剂。

  摘要：

  已经合成了与2-（环己基硫基）-3,4-二氢-5-甲基-6-（3-甲基苄基）-4-氧嘧啶（3c，MC 639）相关的新型化合物，并已作为人免疫缺陷病毒类型的抑制剂进行了测试-1（HIV-1）。硫脲与芳基甲基乙酰乙酸乙酯反应，得到5-烷基-6-（芳基甲基）-3,4-二氢-2-巯基-4-氧嘧啶，然后在硫原子上烷基化，得到所需的2-烷硫基或2-环烷硫基衍生物（S-DABO）。为了改善抗逆转录病毒活性，尝试了在嘧啶环的N-3，C-4和C-6处进行化学修饰。特别是，用1-萘甲基甲基部分取代苄基可增强S-DABO的活性，而在嘧啶环的4位上N-3烷基化和C = O转化为C = S则导致化合物缺乏抗HIV-1活性。当1-萘甲基被异构体2-萘甲基取代时，通常观察到较低的活性。最具活性的化合物在低微摩尔范围内显示活性，其EC50值可与奈韦拉平相当。

  DOI：

  10.1021/jm960802y
• 作为产物：
  描述：

  2-(2-萘基)乙酰氯 在 乙醇 、 sodium 、 三乙胺 、 magnesium chloride 作用下， 反应 7.0h， 生成 6-[2]naphthylmethyl-2-thioxo-2,3-dihydro-1H-pyrimidin-4-one
  参考文献：
  名称：

  二氢（烷硫基）（萘基甲基）氧嘧啶：S-DABO系列的新型非核苷逆转录酶抑制剂。

  摘要：

  已经合成了与2-（环己基硫基）-3,4-二氢-5-甲基-6-（3-甲基苄基）-4-氧嘧啶（3c，MC 639）相关的新型化合物，并已作为人免疫缺陷病毒类型的抑制剂进行了测试-1（HIV-1）。硫脲与芳基甲基乙酰乙酸乙酯反应，得到5-烷基-6-（芳基甲基）-3,4-二氢-2-巯基-4-氧嘧啶，然后在硫原子上烷基化，得到所需的2-烷硫基或2-环烷硫基衍生物（S-DABO）。为了改善抗逆转录病毒活性，尝试了在嘧啶环的N-3，C-4和C-6处进行化学修饰。特别是，用1-萘甲基甲基部分取代苄基可增强S-DABO的活性，而在嘧啶环的4位上N-3烷基化和C = O转化为C = S则导致化合物缺乏抗HIV-1活性。当1-萘甲基被异构体2-萘甲基取代时，通常观察到较低的活性。最具活性的化合物在低微摩尔范围内显示活性，其EC50值可与奈韦拉平相当。

  DOI：

  10.1021/jm960802y

文献信息

• Specific Inhibitors of Mitochondrial Deacylase Sirtuin 4 Endowed with Cellular Activity
  作者：Martin Pannek、Zayan Alhalabi、Daniela Tomaselli、Martina Menna、Francesco Fiorentino、Dina Robaa、Michael Weyand、Maximilian Puhlmann、Stefano Tomassi、Federica Barreca、Marco Tafani、Elma Zaganjor、Marcia C. Haigis、Wolfgang Sippl、Dante Rotili、Antonello Mai、Clemens Steegborn

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.3c01496

  日期：2024.2.8

  virtual screen revealed 12 active compounds. A focused screen based on two top compounds, followed by structure-assisted design of derivatives, yielded four first-in-class potent Sirt4 inhibitors. Kinetic analyses indicate compound competition with the acyl peptide substrate, consistent with the docking models and implicating Sirt4’s unique acyl binding site. The compounds indeed show preference for Sirt4

  Sirtuins 是 NAD +依赖性蛋白质赖氨酸脱酰酶，与衰老相关疾病有关。哺乳动物 Sirtuin 4 (Sirt4) 位于线粒体中，是癌症和代谢疾病的潜在治疗靶点，但尚未报道有效且选择性的 Sirt4 抑制剂。在这里，我们描述了有效的 Sirt4 特异性小分子抑制剂的鉴定。通过基于目标的虚拟屏幕测试命中结果，发现了 12 种活性化合物。基于两种顶级化合物的重点筛选，随后进行衍生物的结构辅助设计，产生了四种一流的强效 Sirt4 抑制剂。动力学分析表明化合物与酰基肽底物竞争，与对接模型一致并暗示 Sirt4 独特的酰基结合位点。这些化合物确实比其他亚型更偏好 Sirt4，其中一种 ( 69 ) 具有高度亚型选择性，并且它们在细胞中具有活性。我们的结果为优化 Sirt4 特异性抑制剂提供了第一个先导化合物和机制见解，可用作实验工具和潜在的治疗方法。
• Libermann et al., Bulletin de la Societe Chimique de France, 1950, p. 486,488
  作者：Libermann et al.

  DOI：——

  日期：——
• Dihydro(alkylthio)(naphthylmethyl)oxopyrimidines:  Novel Non-Nucleoside Reverse Transcriptase Inhibitors of the <i>S</i>-DABO Series
  作者：Antonello Mai、Marino Artico、Gianluca Sbardella、Silvana Quartarone、Silvio Massa、Anna G. Loi、Antonella De Montis、Franca Scintu、Monica Putzolu、Paolo La Colla

  DOI：10.1021/jm960802y

  日期：1997.5.1

  (S-DABOs). Chemical modifications at N-3, C-4, and C-6 of the pyrimidine ring were attempted with the aim of improving antiretroviral activity. In particular, replacement of the benzyl group with the 1-naphthylmethyl moiety enhanced the activity of S-DABOs, whereas N-3 alkylation and C=O transformation into C=S at position 4 of the pyrimidine ring led to compounds devoid of anti-HIV-1 activity. Lower

  已经合成了与2-（环己基硫基）-3,4-二氢-5-甲基-6-（3-甲基苄基）-4-氧嘧啶（3c，MC 639）相关的新型化合物，并已作为人免疫缺陷病毒类型的抑制剂进行了测试-1（HIV-1）。硫脲与芳基甲基乙酰乙酸乙酯反应，得到5-烷基-6-（芳基甲基）-3,4-二氢-2-巯基-4-氧嘧啶，然后在硫原子上烷基化，得到所需的2-烷硫基或2-环烷硫基衍生物（S-DABO）。为了改善抗逆转录病毒活性，尝试了在嘧啶环的N-3，C-4和C-6处进行化学修饰。特别是，用1-萘甲基甲基部分取代苄基可增强S-DABO的活性，而在嘧啶环的4位上N-3烷基化和C = O转化为C = S则导致化合物缺乏抗HIV-1活性。当1-萘甲基被异构体2-萘甲基取代时，通常观察到较低的活性。最具活性的化合物在低微摩尔范围内显示活性，其EC50值可与奈韦拉平相当。