4-oxo-4-((6-(6-(pyridin-2-yl)-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)pyridin-3-yl)amino)butanoic acid | 1104077-91-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氮化合物
• 英文名称: 4-oxo-4-((6-(6-(pyridin-2-yl)-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)pyridin-3-yl)amino)butanoic acid
• 英文别名: 3,6-dipyridyl-s-tetrazine-mono-succinamic acid；4-Oxo-4-[[6-[6-(2-pyridinyl)-1,2,4,5-tetrazin-3-yl]-3-pyridinyl]amino]butanoic acid；4-oxo-4-[[6-(6-pyridin-2-yl-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)pyridin-3-yl]amino]butanoic acid
• CAS: 1104077-91-9
• 化学式: C₁₆H₁₃N₇O₃
• 分子量: 351.324
• InChiKey: SSZNHHXXASGOOX-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 密度：
  1.463±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.5
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.12
• 拓扑面积：
  144
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-oxo-4-((6-(6-(pyridin-2-yl)-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)pyridin-3-yl)amino)butanoic acid 在 三乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 、 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 2.75h， 生成 2,2',2''-(2-(4-(3-(37,40-dioxo-40-((6-(6-(pyridin-2-yl)-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)pyridin-3-yl)amino)-3,6,9,12,15,-18,21,24,27,30,33-undecaoxa-36-azatetracontyl)thioureido)benzyl)-1,4,7-triazonane-1,4,7-triyl)triacetic acid
  参考文献：
  名称：

  探索用于预靶向放射性配体优化的结构参数

  摘要：

  预靶向提供了一种在降低有效载荷输送过程中对健康组织的脱靶辐射剂量的同时增强靶标特异性的方法。我们最近报告了18基于F的预靶向策略基于逆电子需求Diels–Alder反应以及这种方法的使用，可在注射后1 h内可视化体内胰腺肿瘤组织。在这里，我们报告一个全面的结构：25个新型放射性配体的库的药代动力学关系研究，旨在确定具有最佳药代动力学和剂量学特性的放射性示踪剂。这项研究揭示了分子结构与体内行为之间的关键关系，并产生了两个主要候选物，这些候选物在早期时间点以快速的肿瘤靶向性和较高的靶与背景活性浓度比。我们相信这些知识对于设计和临床翻译用于疾病诊断和治疗的下一代靶向药物具有很高的价值。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.7b01108
• 作为产物：
  描述：

  4-oxo-4-((6-(6-(pyridin-2-yl)-1,4-dihydro-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)pyridin-3-yl)amino)butanoic acid 在 upconversion nanocrystal decorated with toluidine blue O dye 作用下， 以 aq. phosphate buffer 为溶剂， 生成 4-oxo-4-((6-(6-(pyridin-2-yl)-1,2,4,5-tetrazin-3-yl)pyridin-3-yl)amino)butanoic acid
  参考文献：
  名称：

  使用上转换光活化光催化剂通过药物与耐药细菌的快速生物正交缀合来提高抗生素活性

  摘要：

  抗生素万古霉素（Van）常被用作治疗耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的最后手段。由于Van抗性微生物的出现，有必要不断设计策略以提高Van对抗性细胞的功效。在这项研究中，提出了一种使用近红外 (NIR) 光激活将 Van 生物结合到细菌的有效方法。钕3+当被 808 nm 光激发时，其表面装饰有甲苯胺蓝 O (TB) 的 -敏化上转换纳米晶体 (UCNC) 经历了从 UCNC 到 TB 的上转换能量转移。然后，光激发的 TB 催化 Van-dHTz 共轭体系中的二氢四嗪 (dHTz) 部分转化为四嗪，四嗪与细菌细胞壁上先前附着的降冰片烯分子发生有效的逆电子需求 Diels-Alder 反应。Van 通过共价键增强对细菌的亲和力，提高了药物对耐药肠球菌的活性，与纯 Van 相比，MIC 降低了 6 到 7 倍。我们证明该作用方式是由于对肽聚糖细胞壁生物合成的抑制增加。

  DOI：

  10.1039/d0tb02568b

文献信息

• A Minimal, Unstrained S‐Allyl Handle for Pre‐Targeting Diels–Alder Bioorthogonal Labeling in Live Cells
  作者：Bruno L. Oliveira、Zijian Guo、Omar Boutureira、Ana Guerreiro、Gonzalo Jiménez‐Osés、Gonçalo J. L. Bernardes

  DOI：10.1002/anie.201608438

  日期：2016.11.14

  The unstrained S-allyl cysteine amino acid was site-specifically installed on apoptosis protein biomarkers and was further used as a chemical handle and ligation partner for 1,2,4,5-tetrazines by means of an inverse-electron-demand Diels-Alder reaction. We demonstrate the utility of this minimal handle for the efficient labeling of apoptotic cells using a fluorogenic tetrazine dye in a pre-targeting

  未拉伸的 S-烯丙基半胱氨酸氨基酸被定点安装在凋亡蛋白生物标志物上，并通过逆电子需求 Diels-Alder 进一步用作 1,2,4,5-四嗪的化学手柄和连接伴侣反应。我们证明了这种最小手柄在预靶向方法中使用荧光四嗪染料有效标记凋亡细胞的效用。S-烯丙基手柄尺寸小、易于化学安装以及对四嗪的选择性反应性，应该很容易扩展到其他蛋白质和生物分子，这可以促进它们在活细胞内的标记。
• TETRAZINE-BASED BIO-ORTHOGONAL COUPLING REAGENTS AND METHODS
  申请人：Fox Joseph Michael

  公开号：US20090023916A1

  公开（公告）日：2009-01-22

  Coupling reactions, suitable for use in organic or aqueous media, are performed by contacting a 1,2,4,5-tetrazine with a dienophile. The dienophile may be covalently bonded to a protein, and the coupling reaction may be performed in biological media such as those containing cells or cell lysates. The reactions may be performed in the presence of primary amines, thiols, acetylenes, azides, phosphines, and products of Staudinger and/or Sharpless-Huisgen reactions Novel 3-substituted cyclopropene compounds and trans-cyclooctenes are exemplary dienophiles for these reactions.

  耦合反应，适用于有机或水性介质，通过将1,2,4,5-四唑与二烯丙烯发生反应来进行。二烯丙烯可能与蛋白质共价结合，耦合反应可在含有细胞或细胞裂解产物的生物介质中进行。这些反应可在存在主要胺基、硫醇、乙炔、叠氮化物、膦化合物以及Staudinger和/或Sharpless-Huisgen反应产物的情况下进行。新颖的3-取代环丙烯化合物和反式-环辛烯是这些反应的优秀二烯丙烯。
• [EN] METHODS FOR INDUCING BIOORTHOGONAL REACTIVITY<br/>[FR] PROCÉDÉS POUR INDUIRE UNE RÉACTIVITÉ BIO-ORTHOGONALE
  申请人：FOX JOSEPH

  公开号：WO2017106427A1

  公开（公告）日：2017-06-22

  A method for catalytically converting a dihydrotetrazine 1 into a tetrazine 2, wherein one R group on the dihydrotetrazine 1 is a substituted or unsubstituted aryi, heteroaryl, alkyl, alkenyl, alkynyl, carbonyl, or heteroatom-containing group, and the other R group is selected from the group consisting of H and substituted or unsubstituted aryl, heteroaryl, alkyl, alkenyl, alkynyl, carbonyl,-or heteroatom-containing groups; 1, 2 wherein the method comprises oxidizing dihydrotetrazine 1 in a reaction medium in the presence of a catalyst and a stoichiometric oxidant.

  将二氢四氮唑1催化转化为四氮唑2的方法，其中二氢四氮唑1上的一个R基团是取代或未取代的芳基、杂环芳基、烷基、烯基、炔基、羰基或含杂原子的基团，另一个R基团选自H和取代或未取代的芳基、杂环芳基、烷基、烯基、炔基、羰基或含杂原子的基团；其中该方法包括在反应介质中在催化剂和化学计量氧化剂的存在下氧化二氢四氮唑1。
• Computationally guided discovery of a reactive, hydrophilic trans-5-oxocene dienophile for bioorthogonal labeling
  作者：William D. Lambert、Samuel L. Scinto、Olga Dmitrenko、Samantha J. Boyd、Ronald Magboo、Ryan A. Mehl、Jason W. Chin、Joseph M. Fox、Stephen Wallace

  DOI：10.1039/c7ob01707c

  日期：——

  important in cellular imaging, where non-specific background fluorescence has been linked to the hydrophobicity of the bioorthogonal moiety. Here we report that trans-5-oxocene (oxoTCO) displays enhanced reactivity and hydrophilicity compared to trans-cyclooctene (TCO) in the tetrazine ligation reaction. Aided by ab initio calculations we show that the insertion of a single oxygen atom into the trans-cyclooctene

  有机化学原理和预测技术的使用使新的生物正交反应得以发展。随着这个“工具箱”扩展到包括新的反应流形和正交反应对，现有反应的持续发展仍然是一个重要的目标。这在细胞成像中尤其重要，在该成像中，非特异性背景荧光已与生物正交部分的疏水性相关。在这里，我们报道在四嗪连接反应中，反式-5-氧并茂（oxoTCO）与反式-环辛烯（TCO）相比，显示出增强的反应性和亲水性。通过从头算计算，我们证明了单个氧原子插入反式-环辛烯（TCO）环系统足以赋予水溶性，并通过增加角应变而导致明显的速率加速。我们证明了在体外和体内使用水溶性四嗪衍生物和蛋白质底物包含部位特异性遗传编码四嗪部分的oxoTCO的快速和定量环加成反应。我们预计oxoTCO将在亲水性和快速生物缀合动力学至关重要的研究中使用。
• Rapid Bioorthogonal Chemistry Turn-on through Enzymatic or Long Wavelength Photocatalytic Activation of Tetrazine Ligation
  作者：Han Zhang、William S. Trout、Shuang Liu、Gabriel A. Andrade、Devin A. Hudson、Samuel L. Scinto、Kevin T. Dicker、Yi Li、Nikifar Lazouski、Joel Rosenthal、Colin Thorpe、Xinqiao Jia、Joseph M. Fox

  DOI：10.1021/jacs.6b02168

  日期：2016.5.11

  thereby turning on reactivity toward trans-cyclooctene dienophiles. Alternately, the aerial oxidation of dihydrotetrazines can be efficiently catalyzed by nanomolar levels of horseradish peroxidase under peroxide-free conditions. Selection of dihydrotetrazine/tetrazine pairs of sufficient kinetic stability in aerobic aqueous solutions is key to the success of these approaches. In this work, polymer fibers

  使用空气作为氧化剂，可以通过可控的催化刺激来诱导快速生物正交反应性。用红光 (660 nm) 照射的亚甲基蓝 (4 μM) 催化二氢四嗪快速氧化为四嗪，从而开启对反式环辛烯亲二烯体的反应性。或者，在无过氧化物的条件下，纳摩尔水平的辣根过氧化物酶可以有效地催化二氢四嗪的空气氧化。选择在有氧水溶液中具有足够动力学稳定性的二氢四嗪/四嗪对是这些方法成功的关键。在这项工作中，携带潜在二氢四嗪的聚合物纤维被小分子、肽和蛋白质的反式环辛烯缀合物催化活化和共价修饰。除了用荧光团进行可视化之外，与细胞粘附肽缀合的纤维还表现出显着增强的介导细胞接触引导的能力。