(3aS,4S,6R,6aR)-6-(6-(((4-methoxyphenyl)diphenylmethyl)amino)-9H-purin-9-yl)-2,2-dimethyltetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxole-4-carbaldehyde | 1053633-95-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: (3aS,4S,6R,6aR)-6-(6-(((4-methoxyphenyl)diphenylmethyl)amino)-9H-purin-9-yl)-2,2-dimethyltetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxole-4-carbaldehyde
• 英文别名: (3aR,4R,6S,6aS)-4-[6-[[(4-methoxyphenyl)-diphenylmethyl]amino]purin-9-yl]-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxole-6-carbaldehyde
• CAS: 1053633-95-6
• 化学式: C₃₃H₃₁N₅O₅
• 分子量: 577.64
• InChiKey: ZWMOALYVARFCCQ-QWOIFIOOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.6
• 重原子数：
  43
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.27
• 拓扑面积：
  110
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (3aS,4S,6R,6aR)-6-(6-(((4-methoxyphenyl)diphenylmethyl)amino)-9H-purin-9-yl)-2,2-dimethyltetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxole-4-carbaldehyde 在 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 作用下， 以 乙酸乙酯 、 甲苯 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 methyl 3-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(6-(((4-methoxyphenyl)diphenylmethyl)amino)-9H-purin-9-yl)-2,2-dimethyltetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl)propanoate
  参考文献：
  名称：

  人 DNA 甲基转移酶 1 过渡态类似物抑制剂的合成和表征

  摘要：

  人类 DNA 甲基转移酶 1 (DNMT1) 对 CpG 区域的高甲基化使肿瘤抑制基因沉默，而对 DNMT1 的抑制可以重新激活沉默的基因。5-氮杂胞苷是经批准的 DNMT1 抑制剂，但它们的诱变机制限制了它们的效用。来自S-腺苷高半胱氨酸、蛋氨酸和脱氧胞苷类似物的合成子方法在 16 种化学稳定的过渡态模拟物的合成中概括了 DNMT1 过渡态的化学特征。对引起纯化的DNMT1的完全和部分抑制的抑制剂进行了表征。抑制剂对 DNMT1 与 DNMT3b 显示出适度的选择性。活性位点对接预测抑制剂与S-腺苷-l的相互作用催化位点的甲硫氨酸和脱氧胞苷区域，通过直接结合分析进行验证。纯化的 DNMT1 的抑制剂作用未反映在培养的细胞中。部分抑制剂激活细胞 DNA 甲基化，而完全抑制剂对细胞 DNA 甲基化没有影响。这些化合物提供了对用于 DNA 甲基转移酶的新的非共价 DNMT 化学支架家族的化学访问。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.1c01869
• 作为产物：
  描述：

  2',3'-异丙叉腺苷 在 吡啶 、 二氯乙酸 、 三甲基氯硅烷 、 二甲基亚砜 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 反应 26.25h， 生成 (3aS,4S,6R,6aR)-6-(6-(((4-methoxyphenyl)diphenylmethyl)amino)-9H-purin-9-yl)-2,2-dimethyltetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxole-4-carbaldehyde
  参考文献：
  名称：

  Inactivation of S-Adenosyl-l-homocysteine Hydrolase by 6‘-Cyano-5‘,6‘-didehydro- 6‘-deoxyhomoadenosine and 6‘-Chloro-6‘- cyano-5‘,6‘-didehydro-6‘-deoxyhomoadenosine. Antiviral and Cytotoxic Effects

  摘要：

  6'-Cyano-5',6'-didehydro-6'-deoxyhomoadenosine (E)-1, (Z)-1, and 6'-chloro-6'-cyano-5',6'-didehydro-6'-deoxyhomoadenosine (E)-2 were synthesized and tested as new mechanism-based inhibitors of AdoHcy hydrolase. Nucleoside (E)-1 was identified as a type I inhibitor of the enzyme, whereas inactivation of the enzyme by nucleosides (Z)-1 and (E)-2 was accompanied by the formation of a covalent labeling of AdoHcy hydrolase.

  DOI：

  10.1021/jm051023x

文献信息

• [EN] INHIBITORS OF DNMT1 AS ANTICANCER THERAPEUTIC AGENTS<br/>[FR] INHIBITEURS DE DNMT1 UTILISÉS EN TANT QU'AGENTS THÉRAPEUTIQUES ANTICANCÉREUX
  申请人：VICTORIA LINK LTD

  公开号：WO2020013712A1

  公开（公告）日：2020-01-16

  Inhibitors of DNA methyltransferase 1 (an enzyme responsible for the maintenance of DNA CpG methylation marks in human cells) and their use as therapeutic agents against various cancers. The invention relates to compounds, pharmaceutical compositions, methods for inhibiting DNA methyltransferase 1, and methods for treating cancer. The inhibitors are compounds of the general formula.

  DNA 甲基转移酶 1 的抑制剂（一种负责在人类细胞中维持 DNA CpG 甲基化标记的酶）及其作为治疗各种癌症的药物的使用。该发明涉及化合物、药物组合物、抑制 DNA 甲基转移酶 1 的方法以及治疗癌症的方法。这些抑制剂是一般公式的化合物。
• Inactivation of <i>S</i>-Adenosyl-<scp>l</scp>-homocysteine Hydrolase by 6‘-Cyano-5‘,6‘-didehydro- 6‘-deoxyhomoadenosine and 6‘-Chloro-6‘- cyano-5‘,6‘-didehydro-6‘-deoxyhomoadenosine. Antiviral and Cytotoxic Effects
  作者：Georges Guillerm、Murielle Muzard、Cédric Glapski、Serge Pilard、Erik De Clercq

  DOI：10.1021/jm051023x

  日期：2006.2.1

  6'-Cyano-5',6'-didehydro-6'-deoxyhomoadenosine (E)-1, (Z)-1, and 6'-chloro-6'-cyano-5',6'-didehydro-6'-deoxyhomoadenosine (E)-2 were synthesized and tested as new mechanism-based inhibitors of AdoHcy hydrolase. Nucleoside (E)-1 was identified as a type I inhibitor of the enzyme, whereas inactivation of the enzyme by nucleosides (Z)-1 and (E)-2 was accompanied by the formation of a covalent labeling of AdoHcy hydrolase.
• Synthesis and Characterization of Transition-State Analogue Inhibitors against Human DNA Methyltransferase 1
  作者：Farah Lamiable-Oulaidi、Rajesh K. Harijan、Karl J. Shaffer、Douglas R. Crump、Yan Sun、Quan Du、Shivali A. Gulab、Ashna A. Khan、Andreas Luxenburger、Anthony D. Woolhouse、Simone Sidoli、Peter C. Tyler、Vern L. Schramm

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.1c01869

  日期：2022.4.14

  methyltransferase 1 (DNMT1) silences tumor-suppression genes, and inhibition of DNMT1 can reactivate silenced genes. The 5-azacytidines are approved inhibitors of DNMT1, but their mutagenic mechanism limits their utility. A synthon approach from the analogues of S-adenosylhomocysteine, methionine, and deoxycytidine recapitulated the chemical features of the DNMT1 transition state in the synthesis of 16 chemically

  人类 DNA 甲基转移酶 1 (DNMT1) 对 CpG 区域的高甲基化使肿瘤抑制基因沉默，而对 DNMT1 的抑制可以重新激活沉默的基因。5-氮杂胞苷是经批准的 DNMT1 抑制剂，但它们的诱变机制限制了它们的效用。来自S-腺苷高半胱氨酸、蛋氨酸和脱氧胞苷类似物的合成子方法在 16 种化学稳定的过渡态模拟物的合成中概括了 DNMT1 过渡态的化学特征。对引起纯化的DNMT1的完全和部分抑制的抑制剂进行了表征。抑制剂对 DNMT1 与 DNMT3b 显示出适度的选择性。活性位点对接预测抑制剂与S-腺苷-l的相互作用催化位点的甲硫氨酸和脱氧胞苷区域，通过直接结合分析进行验证。纯化的 DNMT1 的抑制剂作用未反映在培养的细胞中。部分抑制剂激活细胞 DNA 甲基化，而完全抑制剂对细胞 DNA 甲基化没有影响。这些化合物提供了对用于 DNA 甲基转移酶的新的非共价 DNMT 化学支架家族的化学访问。