N⁶,N⁶-Dimethyladenosin-5'-phosphat | 13484-65-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷酸
• 英文名称: N⁶,N⁶-Dimethyladenosin-5'-phosphat
• 英文别名: N6-Dimethyl-AMP；N,N-dimethyladenosine 5'-(dihydrogen phosphate)；[(2R,3S,4R,5R)-5-[6-(dimethylamino)purin-9-yl]-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate
• CAS: 13484-65-6
• 化学式: C₁₂H₁₈N₅O₇P
• 分子量: 375.278
• InChiKey: OWRDTHWSVNWFAZ-WOUKDFQISA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.7
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.58
• 拓扑面积：
  163
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Tokyo green 、 N⁶,N⁶-Dimethyladenosin-5'-phosphat 在 4-二甲氨基吡啶 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 水 、 叔丁醇 为溶剂， 反应 4.0h， 以5.2%的产率得到((2R,3S,4R,5R)-5-(6-(dimethylamino)-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl)methyl (9-(4-methoxy-2-methylphenyl)-3-oxo-3H-xanthen-6-yl) hydrogen phosphate
  参考文献：
  名称：

  靶向肿瘤抑制蛋白 FHIT 的荧光探针的合成和凋亡诱导 FHIT 抑制剂的鉴定

  摘要：

  对于癌症的早期诊断，导致更好的完全康复机会，在癌前病变中表达已经改变的标记基因是可取的，肿瘤抑制基因FHIT是一种候选基因。基因产物 FHIT 蛋白具有独特的二核苷三磷酸水解酶 (AP 3Aase) 活性，在本研究中，我们设计并合成了一系列利用该活性的 FHIT 荧光探针。我们优化了探针结构以实现与 FHIT 的高特异性反应，并将优化的探针应用于 FHIT 抑制剂的筛选试验。用该测定法筛选化合物库确定了几个命中。命中化合物的结构开发提供了有效的 FHIT 抑制剂。这些抑制剂通过半胱天冬酶激活诱导表达 FHIT 的癌症细胞凋亡。我们的结果支持这样的观点，即 FHIT 结合剂，无论是 AP 3 Aase 活性的抑制剂还是激动剂，都可能是有前途的抗癌剂。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.1c00874
• 作为产物：
  描述：

  N6,N6-二甲基腺苷 在 磷酸三乙酯 、 水 、 三氯氧磷 作用下， 反应 2.0h， 生成 N⁶,N⁶-Dimethyladenosin-5'-phosphat
  参考文献：
  名称：

  结核分枝杆菌腺苷5'-磷酸硫酸还原酶中关键配体结合决定因素的鉴定

  摘要：

  结核分枝杆菌5'-磷酸腺苷 (APS) 还原酶是一种铁硫蛋白，是开发新型抗结核药物的有效靶点，特别是用于治疗潜伏感染。为了促进 APS 还原酶的强效和特异性抑制剂的开发，我们通过一系列底物和产物类似物探索了作为结合和特异性基础的分子决定因素。我们的研究强调了特定取代基团对底物结合的重要性，并为配体特异性构象状态提供了功能证据。已为结核分枝杆菌APS 还原酶开发了一个活性位点模型，该模型与此处提供的结果以及铜绿假单胞菌报告的先前结构数据一致APS 还原酶和相关酶。该模型说明了 APS 还原酶与配体相互作用所需的功能特征，并为合理设计小分子作为人类病原体（包括结核分枝杆菌）中存在的 APS 还原酶的潜在抑制剂提供了药理学路线图。

  DOI：

  10.1021/jm900728u

文献信息

• An Improved One-Pot Synthesis of Nucleoside 5′-Triphosphate Analogues
  作者：Irina Gillerman、Bilha Fischer

  DOI：10.1080/15257771003709569

  日期：2010.4.20

  Nucleoside 5′-triphosphate (NTP) analogues are valuable tools for biochemical and medicinal research. Therefore, a facile and efficient synthesis of NTP analogues is required. Here, we report on an improved nucleoside 5′-triphosphorylation procedure to obtain pure products after liquid chromotagrpahy (LC) separation with no need for high performance liquid chromatography (HPLC) purification. To improve

  核苷5'-三磷酸（NTP）类似物是用于生物化学和药物研究的有价值的工具。因此，需要简便有效地合成NTP类似物。在这里，我们报告了一种改进的核苷5'-三磷酸化程序，可在液相色谱（LC）分离后获得纯产物，而无需进行高效液相色谱（HPLC）纯化。为了提高反应的选择性，我们尝试优化几个参数，例如溶剂，焦磷酸亲核性，反应时间和温度。最终，根据使用31监测随时间变化的产物分布，通过降低温度至-15°C并将反应时间增加至2小时来优化反应。1 H NMR。此外，在LC分离后，NTP以纯产物形式获得，这在原始的Ludwig程序中是不可能的。所有研究的天然和合成核苷均获得了良好的收率。
• Identification of Critical Ligand Binding Determinants in <i>Mycobacterium tuberculosis</i> Adenosine-5′-phosphosulfate Reductase
  作者：Jiyoung A. Hong、Devayani P. Bhave、Kate S. Carroll

  DOI：10.1021/jm900728u

  日期：2009.9.10

  to develop new antitubercular agents, particularly for the treatment of latent infection. To facilitate the development of potent and specific inhibitors of APS reductase, we have probed the molecular determinants that underlie binding and specificity through a series of substrate and product analogues. Our study highlights the importance of specific substitutent groups for substrate binding and provides

  结核分枝杆菌5'-磷酸腺苷 (APS) 还原酶是一种铁硫蛋白，是开发新型抗结核药物的有效靶点，特别是用于治疗潜伏感染。为了促进 APS 还原酶的强效和特异性抑制剂的开发，我们通过一系列底物和产物类似物探索了作为结合和特异性基础的分子决定因素。我们的研究强调了特定取代基团对底物结合的重要性，并为配体特异性构象状态提供了功能证据。已为结核分枝杆菌APS 还原酶开发了一个活性位点模型，该模型与此处提供的结果以及铜绿假单胞菌报告的先前结构数据一致APS 还原酶和相关酶。该模型说明了 APS 还原酶与配体相互作用所需的功能特征，并为合理设计小分子作为人类病原体（包括结核分枝杆菌）中存在的 APS 还原酶的潜在抑制剂提供了药理学路线图。
• 564. The synthesis of 6-dimethylamino-9-β-<scp>D</scp>-ribofuranosylpurine-5′ phosphate
  作者：K. J. M. Andrews、W. E. Barber

  DOI：10.1039/jr9580002768

  日期：——
• Synthesis of Fluorescent Probes Targeting Tumor-Suppressor Protein FHIT and Identification of Apoptosis-Inducing FHIT Inhibitors
  作者：Mitsuyasu Kawaguchi、Eriko Sekimoto、Yuhei Ohta、Naoya Ieda、Takashi Murakami、Hidehiko Nakagawa

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.1c00874

  日期：2021.7.8

  tumor-suppressor gene FHIT is one candidate. The gene product, FHIT protein, has a unique dinucleoside triphosphate hydrolase (AP3Aase) activity, and in this study, we designed and synthesized a series of FHIT fluorescent probes utilizing this activity. We optimized the probe structure for high and specific reactivity with FHIT and applied the optimized probe in a screening assay for FHIT inhibitors. Screening of

  对于癌症的早期诊断，导致更好的完全康复机会，在癌前病变中表达已经改变的标记基因是可取的，肿瘤抑制基因FHIT是一种候选基因。基因产物 FHIT 蛋白具有独特的二核苷三磷酸水解酶 (AP 3Aase) 活性，在本研究中，我们设计并合成了一系列利用该活性的 FHIT 荧光探针。我们优化了探针结构以实现与 FHIT 的高特异性反应，并将优化的探针应用于 FHIT 抑制剂的筛选试验。用该测定法筛选化合物库确定了几个命中。命中化合物的结构开发提供了有效的 FHIT 抑制剂。这些抑制剂通过半胱天冬酶激活诱导表达 FHIT 的癌症细胞凋亡。我们的结果支持这样的观点，即 FHIT 结合剂，无论是 AP 3 Aase 活性的抑制剂还是激动剂，都可能是有前途的抗癌剂。