[(2R,3R,5R)-5-[4-[[2,3-di(icosoxy)benzoyl]amino]-2-oxopyrimidin-1-yl]-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] 4-oxopentanoate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: [(2R,3R,5R)-5-[4-[[2,3-di(icosoxy)benzoyl]amino]-2-oxopyrimidin-1-yl]-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] 4-oxopentanoate
• 化学式: C₆₁H₁₀₃N₃O₉
• 分子量: 1022.5
• InChiKey: DSYGUYIOJXQVTH-RGDFECTESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  20.1
• 重原子数：
  73
• 可旋转键数：
  49
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.79
• 拓扑面积：
  153
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  9

文献信息

• METHOD FOR LIQUID-PHASE SYNTHESIS OF NUCLEIC ACID
  申请人：Takeda Pharmaceutical Company Limited

  公开号：US20150315229A1

  公开（公告）日：2015-11-05

  In this method, an oligonucleotide is prepared by using, as a synthesis unit, a novel nucleoside monomer compound represented by formula (I) [wherein X, R 1 , Y, Base, Z, Ar, R 2 , R 3 and n are each as defined in Claim 1 ]. The novel nucleoside monomer compound is a nucleoside, the base moiety of which is substituted with an aromatic-hydrocarbon-ring-carbonyl or -thiocarbonyl group having at least one hydrophobic group. The method cars dispense with columm-chromalographic purification in every reaction, and enables base elongation not only in the 3′-direction but also in the 5′-direction, thus attaining efficient liquid-phase mass synthesis of an oligonucleotide.

  在这种方法中，通过使用一种由式(I)所表示的新型核苷单体化合物作为合成单元来制备寡核苷酸。其中，X、R1、Y、Base、Z、Ar、R2、R3和n如权利要求1所定义。该新型核苷单体化合物是一种核苷，其碱基基团被取代了至少一个疏水基团的芳香烃环羰基或硫羰基。该方法不需要在每次反应中进行柱层析纯化，并且不仅可以在3'-方向上进行碱基延伸，还可以在5'-方向上进行碱基延伸，从而实现寡核苷酸的高效液相大规模合成。
• [EN] METHOD FOR LIQUID-PHASE SYNTHESIS OF NUCLEIC ACID<br/>[FR] PROCÉDÉ DE SYNTHÈSE EN PHASE LIQUIDE D'UN ACIDE NUCLÉIQUE
  申请人：TAKEDA PHARMACEUTICAL

  公开号：WO2014077292A1

  公开（公告）日：2014-05-22

  ヌクレオシドの塩基部分が、少なくとも１つの疎水性基を有する芳香族炭化水素環カルボニルもしくはチオカルボニル基で置換された式(I)の新規ヌクレオシドモノマー化合物を合成ユニットとして用いて、核酸オリゴマーを製造することにより、各反応毎のカラムクロマト精製を回避でき、３'方向へも５'方向へも塩基伸長ができ、核酸オリゴマーを、液相合成法により効率的に大量合成することができる。[式中、X、R1、Y、Base、Z、Ar、R2、R3、ｎは請求項１に記載の意味を表す。]