1-[(2R,5R)-4-hydroxy-5-[[[(2R,5R)-2-(hydroxymethyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxy-[(2-morpholin-4-ylethyldisulfanyl)methylsulfanyl]phosphoryl]oxymethyl]oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 1-[(2R,5R)-4-hydroxy-5-[[[(2R,5R)-2-(hydroxymethyl)-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxy-[(2-morpholin-4-ylethyldisulfanyl)methylsulfanyl]phosphoryl]oxymethyl]oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• 化学式: C₂₇H₄₀N₅O₁₂PS₃
• 分子量: 753.8
• InChiKey: QTXJFMDDRPFYSM-IUEJOXOBSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.7
• 重原子数：
  48
• 可旋转键数：
  15
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.7
• 拓扑面积：
  282
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  16

文献信息

• THIOSULFONATE REAGENTS FOR THE SYNTHESIS OF FUNCTIONALIZED NUCLEIC ACIDS
  申请人：Wave Life Sciences Ltd.

  公开号：EP3248982A1

  公开（公告）日：2017-11-29

  Described herein are thiosulfonate reagents of Structure IIa useful for the synthesis of phosphorothiotriesters from H-phosphonates in a stereospecific fashion. wherein, X is alkyl, cycloalkyl, or heteroaryl; R is R1-R2; R1 is selected from -S-alkenylene-, -S-alkylene-, -S-alkylene-aryl-alkylene-, -S-CO-aryl-alkylene-, and -S-CO-alkylene-aryl-alkylene-; and R2 is selected from heterocyclo-alkylene-S-, heterocyclo-alkenylene-S-,aminoalkyl-S-, and (alkyl)4N-alkylene-S-.

  本文描述的是结构 IIa 的硫代磺酸试剂，可用于以立体特异性方式从 H-膦酸盐合成硫代磷酸酯。 其中 X 是烷基、环烷基或杂芳基； R 是 R1-R2； R1 选自-S-亚烷基、-S-亚烷基、-S-亚烷基-芳基-亚烷基、-S-CO-芳基-亚烷基和-S-CO-亚烷基-芳基-亚烷基；以及 R2 选自杂环亚烷基-S-、杂环亚烯基-S-、氨基烷基-S-和（烷基）4N-亚烷基-S-。
• Methods for the synthesis of functionalized nucleic acids
  申请人：WAVE LIFE SCIENCES LTD.

  公开号：US10280192B2

  公开（公告）日：2019-05-07

  The present application, among other things, provides technologies, e.g., reagents, methods, etc. for preparing oligonucleotides comprising phosphorothiotriesters linkages. In some embodiments, provided methods comprise reacting an H-phosphonate of structure Ia or Ib with a silylating reagent to provide a silyloxyphosphonate, and reacting the silyloxyphosphonate with a thiosulfonate reagent of structure IIa or IIb to provide an oligonucleotide of structure IIIa or IIIb. In some embodiments, provided methods comprise reacting an H-phosphonate of structure Ic with a silylating reagent to provide a silyloxyphosphonate, reacting the silyloxyphosphonate with a bis(thiosulfonate) reagent of structure IVc to provide a phosphorothiotriester comprising a thiosulfonate group of structure Vc, and then reacting the phosphorothiotriester comprising a thiosulfonate group of structure Vc with a nucleophile of structure VIc to provide an oligonucleotide of structure IIIc. In some embodiments, the present application provides a thiosulfonate reagent of structure IIa:

  本申请，除其他外，提供了用于制备包含硫代磷酸酯连接的寡核苷酸的技术，例如试剂、方法等。在一些实施方案中，所提供的方法包括使结构 Ia 或 Ib 的 H-膦酸盐与硅烷化试剂反应以提供硅氧基膦酸盐，并使硅氧基膦酸盐与结构 IIa 或 IIb 的硫代磺酸盐试剂反应以提供结构 IIIa 或 IIIb 的寡核苷酸。在一些实施方案中，所提供的方法包括使结构 Ic 的 H-膦酸盐与硅烷化试剂反应以提供硅氧基膦酸盐，使硅氧基膦酸盐与结构 IVc 的双硫代磺酸酯试剂反应以提供包含结构 Vc 的硫代磺酸酯基团的硫代磷酸酯、然后将包含结构 Vc 的硫代磺酸基团的硫代磷酸酯与结构 VIc 的亲核剂反应，得到结构 IIIc 的寡核苷酸。在某些实施方案中，本申请提供了结构 IIa 的硫代磺酸盐试剂：
• METHODS FOR THE SYNTHESIS OF FUNCTIONALIZED NUCLEIC ACIDS
  申请人：Wave Life Sciences Ltd.

  公开号：EP2734208B1

  公开（公告）日：2017-03-01
• US9605019B2
  申请人：——

  公开号：US9605019B2

  公开（公告）日：2017-03-28