2'-O-methyl-5-methylcytidine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 2'-O-methyl-5-methylcytidine
• 英文别名: 4-amino-1-[(2R,3R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)-3-methoxyoxolan-2-yl]-5-methylpyrimidin-2-one
• 化学式: C₁₁H₁₇N₃O₅
• 分子量: 271.273
• InChiKey: CNVRVGAACYEOQI-IBCQBUCCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.5
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.64
• 拓扑面积：
  118
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2'-O-methyl-5-methylcytidine 在 sodium persulfate 作用下， 以 aq. phosphate buffer 为溶剂， 反应 4.0h， 以18%的产率得到2'-O-methyl-5-hydroxymethylcytidine
  参考文献：
  名称：

  2'-O-Methyl-5-hydroxymethylcytidine：RNA 中 5-Methylcytidine 的第二个氧化衍生物

  摘要：

  5-羟甲基胞苷 (hm5C) 最近被鉴定为 RNA 中 m5C 的直接代谢物。我们使用生物同位素体和 LC-MS/HRMS 研究了 hm5C 在人类细胞中的稳定性。这导致在 RNA 中发现了 m5C 的第二种氧化代谢物，即 2'-O-甲基-5-羟甲基胞苷 (hm5Cm)。随后对来自高等生物的总 RNA 的定量分析揭示了这种新 RNA 修饰的不同水平和 TET 独立形成。

  DOI：

  10.1021/jacs.6b12180

文献信息

• COMPOSITION FOR ADMINISTERING AND RELEASING OLIGONUCLEOTIDES
  申请人：Breitenbronn-Consulting GbR

  公开号：EP3685824A1

  公开（公告）日：2020-07-29

  The present invention relates to a composition comprising an oligonucleotide, at least two copolymers with at least two of the copolymers being Poloxamer 188 and Poloxamer 407, and a medium. The present invention further relates to a method for preparing said composition.

  本发明涉及一种组合物，该组合物包含寡核苷酸、至少两种共聚物（其中至少两种共聚物为 Poloxamer 188 和 Poloxamer 407）以及一种培养基。本发明还涉及一种制备所述组合物的方法。
• ANTISENSE DRUG AGAINST THE HUMAN INTERCELLULAR ADHESION MOLECULE 1 (ICAM-1)
  申请人：Universität zu Lübeck

  公开号：EP3914710A1

  公开（公告）日：2021-12-01
• [EN] ANTISENSE DRUG AGAINST THE HUMAN INTERCELLULAR ADHESION MOLECULE 1 (ICAM-1)<br/>[FR] MÉDICAMENT ANTISENS CONTRE LA MOLÉCULE D'ADHÉSION INTERCELLULAIRE HUMAINE 1 (ICAM -1)
  申请人：UNIV LUEBECK

  公开号：WO2020151881A1

  公开（公告）日：2020-07-30

  The present invention relates to a specific antisense oligonucleotide which inhibits the expression of the adhesion molecule ICAM-1 in human cells. The present invention further relates to a vector containing said oligonucleotide and a host cell containing said vector or oligonucleotide and a pharmaceutical composition containing said oligonucleotide as well as uses thereof, in particular in the treatment of an inflammatory disease or condition in humans.
• 2′-<i>O</i>-Methyl-5-hydroxymethylcytidine: A Second Oxidative Derivative of 5-Methylcytidine in RNA
  作者：Sabrina M. Huber、Pieter van Delft、Arun Tanpure、Eric A. Miska、Shankar Balasubramanian

  DOI：10.1021/jacs.6b12180

  日期：2017.2.8

  (hm5C) was recently identified as a direct metabolite of m5C in RNA. We investigated the stability of hm5C in human cells using bio-isotopologues and LC-MS/HRMS. This has led to the discovery of a second oxidative metabolite of m5C in RNA, namely 2′-O-methyl-5-hydroxymethylcytidine (hm5Cm). Subsequent quantitative analysis of total RNA from higher organisms revealed varying levels and TET-independent formation

  5-羟甲基胞苷 (hm5C) 最近被鉴定为 RNA 中 m5C 的直接代谢物。我们使用生物同位素体和 LC-MS/HRMS 研究了 hm5C 在人类细胞中的稳定性。这导致在 RNA 中发现了 m5C 的第二种氧化代谢物，即 2'-O-甲基-5-羟甲基胞苷 (hm5Cm)。随后对来自高等生物的总 RNA 的定量分析揭示了这种新 RNA 修饰的不同水平和 TET 独立形成。