2'-Deoxy-3',5'-bis-O-[(1,1-dimethylethyl)dimethylsilyl]-5-[[[(1,1-dimethylethyl)dimethylsilyl]oxy]methyl]cytidine | 1210427-82-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 2'-Deoxy-3',5'-bis-O-[(1,1-dimethylethyl)dimethylsilyl]-5-[[[(1,1-dimethylethyl)dimethylsilyl]oxy]methyl]cytidine
• 英文别名: 4-amino-1-[(2R,4S,5R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]pyrimidin-2-one
• CAS: 1210427-82-9
• 化学式: C₂₈H₅₇N₃O₅Si₃
• 分子量: 600.034
• InChiKey: XGPDFZUJNISNHI-YTFSRNRJSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.05
• 重原子数：
  39
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.86
• 拓扑面积：
  95.6
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2'-Deoxy-3',5'-bis-O-[(1,1-dimethylethyl)dimethylsilyl]-5-[[[(1,1-dimethylethyl)dimethylsilyl]oxy]methyl]cytidine 在 triethylamine tris(hydrogen fluoride) 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 以52%的产率得到2'-脱氧-5-(羟甲基)胞啶
  参考文献：
  名称：

  大脑中第六个DNA碱基羟甲基胞嘧啶的定量

  摘要：

  注意事项：LC-MS允许在脑组织中量化复制后形成的DNA碱基5-羟甲基胞嘧啶的量（参见图片；左图）。核苷在与更高的认知功能相关的区域中含量最高，并且其在小鼠海马中的含量似乎随着年龄的增长而增加。新方法使羟甲基胞嘧啶的定量达到前所未有的准确性。

  DOI：

  10.1002/anie.201002033
• 作为产物：
  描述：

  在 氨 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 为溶剂， 反应 3.0h， 以76 mg的产率得到2'-Deoxy-3',5'-bis-O-[(1,1-dimethylethyl)dimethylsilyl]-5-[[[(1,1-dimethylethyl)dimethylsilyl]oxy]methyl]cytidine
  参考文献：
  名称：

  大脑中第六个DNA碱基羟甲基胞嘧啶的定量

  摘要：

  注意事项：LC-MS允许在脑组织中量化复制后形成的DNA碱基5-羟甲基胞嘧啶的量（参见图片；左图）。核苷在与更高的认知功能相关的区域中含量最高，并且其在小鼠海马中的含量似乎随着年龄的增长而增加。新方法使羟甲基胞嘧啶的定量达到前所未有的准确性。

  DOI：

  10.1002/anie.201002033

文献信息

• Quantification of the Sixth DNA Base Hydroxymethylcytosine in the Brain
  作者：Martin Münzel、Daniel Globisch、Tobias Brückl、Mirko Wagner、Veronika Welzmiller、Stylianos Michalakis、Markus Müller、Martin Biel、Thomas Carell

  DOI：10.1002/anie.201002033

  日期：——

  allowed the amount of the post‐replicatively formed DNA base 5‐hydroxymethylcytosine (see picture; left) to be quantified in brain tissue. The nucleoside is most abundant in areas that are associated with higher cognitive functions, and its content in mouse hippocampi seems to increase with age. The new method enables hydroxymethylcytosine to be quantified with unprecedented accuracy.

  注意事项：LC-MS允许在脑组织中量化复制后形成的DNA碱基5-羟甲基胞嘧啶的量（参见图片；左图）。核苷在与更高的认知功能相关的区域中含量最高，并且其在小鼠海马中的含量似乎随着年龄的增长而增加。新方法使羟甲基胞嘧啶的定量达到前所未有的准确性。