对于40种pyridocarbazole衍
生物的复合物的结合模式和结合常数1 - 40报告,其中双链DNA的(dsDNAs)。通过偏转光谱和基于DNA的膜中相应分子的取向与链排列的组合来确定结合模式。所有化合物均表现出插层结合模式。根据
吡啶并
咔唑骨架上的取代基和dsDNA的序列,通过
石英晶体微量天平(QCM)测定的其对于络合物的结合常数K a从1.7×10 5到4.5×10 7 M -1变化。结合常数K a具有2-(ω-
氨基)烷基和5-(ω-
氨基)烷基
氨基甲酰基的
吡啶并
咔唑衍
生物的“α-羟基”大于相应的ω-
脲基衍
生物的β-羟基。这些ω-
氨基化合物在络合中表现出强烈的GC碱基对偏好。随着NaCl浓度的增加,K a值降低。通过分子模型阐明,2系ω-
氨基衍
生物的骨架与堆积的GC碱基对完全重叠,从而导致形成稳定的嵌入复合物,以及5系
脲基的骨架衍
生物半重叠导致形成不稳定的络合物。此外,ln K a