O-2,2'-anhydro-1-(3-azido-3-deoxy-5-O-trityl-β-D-arabinofuranosyl)thymine | 607351-46-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: O-2,2'-anhydro-1-(3-azido-3-deoxy-5-O-trityl-β-D-arabinofuranosyl)thymine
• 英文别名: (2R,4S,5R,6S)-5-azido-11-methyl-4-(trityloxymethyl)-3,7-dioxa-1,9-diazatricyclo[6.4.0.02,6]dodeca-8,11-dien-10-one
• CAS: 607351-46-2
• 化学式: C₂₉H₂₅N₅O₄
• 分子量: 507.549
• InChiKey: ACDMGVQZWVCCEG-HIQYAUPDSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.4
• 重原子数：
  38
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.24
• 拓扑面积：
  74.7
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  O-2,2'-anhydro-1-(3-azido-3-deoxy-5-O-trityl-β-D-arabinofuranosyl)thymine 在 吡啶 、 sodium hydroxide 、 溶剂黄146 、 4,4'-二氨基二苯乙烯-2,2'-二磺酸 作用下， 以 乙醇 、 水 、 甲苯 为溶剂， 反应 11.42h， 生成 1-(3-azido-2,3-dideoxy-2-fluoro-β-D-ribofuranosyl)thymine
  参考文献：
  名称：

  结核分枝杆菌胸苷单磷酸激酶抑制剂：2'-和3'-修饰胸苷类似物的生物学评价和构象分析

  摘要：

  结核分枝杆菌胸苷单磷酸激酶 (TMPKmt) 最近被引入作为抗结核药物基于结构设计的潜在目标。基于 TMPKmt X 射线结构和先前的 SAR 研究，我们合成了核苷类似物 3a-b、6a-b、7a-b 和 8a-b，在呋喃核糖环部分的 2'-和 3'-位置进行了修饰. 令我们惊讶的是，这些类似物仅表现出中等的结合亲和力（即 Ki 介于 118 和 1260 μM 之间）。这促使我们研究这些核苷的构象特征。我们得出结论，该系列的化合物，尤其是 8a-b，强烈偏向于“北方”呋喃糖环构象，而 X 射线晶体学显示 TMPKmt 偏爱相反的“南方”构象异构体。本文涵盖了合成，2'-和3'-修饰的dT类似物的生物学评价和构象特征（即优选的环褶皱）。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2003)

  DOI：

  10.1002/ejoc.200300177
• 作为产物：
  描述：

  4-Methyl-benzoic acid (2S,3R,4R,5R)-4-acetoxy-3-azido-5-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-tetrahydro-furan-2-ylmethyl ester 在 4-二甲氨基吡啶 、 三氟甲烷磺酰氯 、 sodium methylate 作用下， 以 吡啶 、 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 58.0h， 生成 O-2,2'-anhydro-1-(3-azido-3-deoxy-5-O-trityl-β-D-arabinofuranosyl)thymine
  参考文献：
  名称：

  结核分枝杆菌胸苷单磷酸激酶抑制剂：2'-和3'-修饰胸苷类似物的生物学评价和构象分析

  摘要：

  结核分枝杆菌胸苷单磷酸激酶 (TMPKmt) 最近被引入作为抗结核药物基于结构设计的潜在目标。基于 TMPKmt X 射线结构和先前的 SAR 研究，我们合成了核苷类似物 3a-b、6a-b、7a-b 和 8a-b，在呋喃核糖环部分的 2'-和 3'-位置进行了修饰. 令我们惊讶的是，这些类似物仅表现出中等的结合亲和力（即 Ki 介于 118 和 1260 μM 之间）。这促使我们研究这些核苷的构象特征。我们得出结论，该系列的化合物，尤其是 8a-b，强烈偏向于“北方”呋喃糖环构象，而 X 射线晶体学显示 TMPKmt 偏爱相反的“南方”构象异构体。本文涵盖了合成，2'-和3'-修饰的dT类似物的生物学评价和构象特征（即优选的环褶皱）。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2003)

  DOI：

  10.1002/ejoc.200300177