8-oxo-dGMP

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷酸
• 英文名称: 8-oxo-dGMP
• 英文别名: {[(2R,3S,5R)-5-(2-amino-6,8-dioxo-6,7,8,9-tetrahydro-3H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy}phosphonic acid；[5-(2-amino-6,8-dioxo-1,7-dihydropurin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate
• 化学式: C₁₀H₁₄N₅O₈P
• 分子量: 363.224
• InChiKey: AQIVLFLYHYFRKU-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.2
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  196
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  8-oxo-dGTP 以 水 为溶剂， 反应 0.5h， 生成 二磷酸酯 、 8-oxo-dGMP
  参考文献：
  名称：

  Crystal Structures and Inhibitor Interactions of Mouse and Dog MTH1 Reveal Species-Specific Differences in Affinity

  摘要：

  MTH1 可水解氧化的三磷酸核苷，从而使核苷酸池免受氧化损伤。这样就能防止受损核苷酸结合到 DNA 中，否则就会导致突变和细胞死亡。与非恶性细胞相比，癌细胞中的活性氧水平较高，导致癌细胞中的氧化核苷酸水平较高，从而使癌细胞更加依赖 MTH1 而存活。通过抑制 MTH1 来特异性靶向癌细胞的可能性凸显了 MTH1 是一个很有前景的癌症靶点。将 MTH1 抑制剂应用于临床需要进行动物实验，而了解抑制剂效力的物种差异至关重要。我们在此表明，人类 MTH1 抑制剂 TH588 对小鼠 MTH1 的抑制作用比人类、大鼠、猪和狗的 MTH1 蛋白低约 20 倍。我们展示了小鼠 MTH1 与 TH588 和狗 MTH1 复合物的晶体结构，并阐明了所观察到的与 TH588 亲和力差异的结构和序列基础。我们发现 MTH1 中的 116 氨基酸残基是决定 TH588 亲和力的重要因素。此外，我们还展示了小鼠 MTH1 与底物 8-oxo-dGTP 复合物的结构。晶体结构使我们深入了解了不同生物的 MTH1 蛋白之间的高度结构保守性，并提供了 MTH1 与抑制剂之间相互作用的详细视图，揭示了微小的结构差异会对亲和性和特异性产生巨大影响。

  DOI：

  10.1021/acs.biochem.7b01163