[9-[2-Carboxy-5-(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxycarbonylphenyl]-6-(dimethylamino)xanthen-3-ylidene]-dimethylazanium

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并吡喃
• 英文名称: [9-[2-Carboxy-5-(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxycarbonylphenyl]-6-(dimethylamino)xanthen-3-ylidene]-dimethylazanium
• 化学式: C₂₉H₂₆N₃O₇
• 分子量: 528.541
• InChiKey: PAOQTZWNYMMSEE-UHFFFAOYSA-O

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2
• 重原子数：
  39
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.21
• 拓扑面积：
  117
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-(2-aminoacetyl)-N-(2-((tert-butoxy)carbonylamino)ethyl)-glycine 、 [9-[2-Carboxy-5-(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxycarbonylphenyl]-6-(dimethylamino)xanthen-3-ylidene]-dimethylazanium 在 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 15.0h， 以100%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  有效的功能分子掺入功能化肽核酸（PNA）的方法：用于合成标记的PNA低聚物

  摘要：

  描述了一种用于官能化PNA（肽核酸）的新颖有效的合成方法，其中结合了功能性分子代替核碱基。新颖ω-AA-的Boc PNA-OH（20 - 24，AA =氨基酸）被设计为PNA前体引入该功能分子可有效地结合的单体单元。化合物20 - 24与OSu的（定量反应Ñ -hydroxysuccinimidyl）活性酯衍生物和商业功能分子的异硫氰酸酯衍生物，得到目标官能PNA单体单元25 - 53。可以通过SPPS（固相肽合成）以与四个A（Cbz），G（Cbz），C（Cbz），和T PNA单体单元。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2007.03.109

文献信息

• CELL TRACKING REAGENTS AND THEIR METHODS OF USE
  申请人：LIFE TECHNOLOGIIES CORPORATION

  公开号：US20170044372A1

  公开（公告）日：2017-02-16

  Described herein are compounds, methods, and kits for short- and long-term tracking of cell proliferation, differentiation, and/or function. The compounds disclosed herein are rhodamine-based cell-tracking reagents that fluoresce in the red portion of the UV/VIS spectrum and provide bright fluorescence intensity, uniform cell staining, and good retention within live cells as well as low toxicity toward cells.

  本文描述了一种用于短期和长期跟踪细胞增殖、分化和/或功能的化合物、方法和试剂盒。本文披露的化合物是基于罗丹明的细胞跟踪试剂，其在紫外/可见光谱的红色部分发出荧光，并且具有明亮的荧光强度、均匀的细胞染色以及在活细胞内良好的保留性，同时对细胞具有低毒性。
• HYBRIDIZATION AND MISMATCH DISCRIMINATION USING OLIGONUCLEOTIDES CONJUGATED TO MINOR GROOVE BINDERS
  申请人：HEDGPETH JOEL

  公开号：US20090048427A1

  公开（公告）日：2009-02-19

  Conjugates between a minor groove binding molecule, such as the trimer of 1,2-dihydro-(3H)-pyrrolo[3,2-e]indole-7-carboxylate (CDPI 3 ), and an oligonucleotide form unusually stable hybrids with complementary target sequences, in which the tethered CDPI 3 group resides in the minor groove of the duplex. These conjugates can be used as probes and primers. Due to their unusually high binding affinity, conjugates as short as 8-mers can be used as amplification primers with high specificity and efficiency. MGB conjugation also increases the discriminatory power of short oligonucleotides, providing enhanced detection of nucleotide sequence mismatches by short oligonucleotides. The MGB-conjugated probes and primers described herein facilitate various analytic and diagnostic procedures, such as amplification reactions, PCR, detection of single-nucleotide polymorphisms, gene hunting, differential display, fluorescence energy transfer, hydrolyzable probe assays and others; by allowing the use of shorter oligonucleotides, which have higher specificity and better discriminatory power.

  一种小沟结合分子（例如1,2-二氢-（3H）-吡咯并[3,2-e]吲哚-7-羧酸三聚体（CDPI3））与寡核苷酸之间的共轭体形成与互补靶序列异常稳定的杂交体，在其中，被拴在一起的CDPI3基团位于双链的小沟中。这些共轭体可用作探针和引物。由于它们的结合亲和力异常高，因此即使是长度为8个碱基的共轭体也可用作具有高特异性和效率的扩增引物。MGB共轭还增加了短寡核苷酸的鉴别能力，通过短寡核苷酸提供了更好的核苷酸序列不匹配检测。所述的MGB共轭探针和引物可促进各种分析和诊断过程，例如扩增反应，PCR，单核苷酸多态性检测，基因寻找，差异显示，荧光能量转移，可水解探针测定等；通过使用更短的寡核苷酸，从而具有更高的特异性和更好的鉴别能力。
• Incorporation of Antifreeze Proteins into Polymer Coatings Using Site-Selective Bioconjugation
  作者：Aaron P. Esser-Kahn、Vivian Trang、Matthew B. Francis

  DOI：10.1021/ja103038p

  日期：2010.9.29

  repertoire of proteins promises to yield new materials with unprecedented capabilities, so long as versatile chemical methods are available to introduce synthetic components at specific sites on biomolecule surfaces. As a demonstration of this potential, we have used site-selective strategies to attach antifreeze proteins found in Arctic fish and insects to polymer chains. This multivalent arrangement increases

  只要有多种化学方法可以在生物分子表面的特定位点引入合成成分，蛋白质的多样化功能库有望产生具有前所未有能力的新材料。作为这种潜力的证明，我们使用了位点选择性策略将北极鱼类和昆虫中发现的抗冻蛋白附加到聚合物链上。这种多价排列增加了蛋白质的热滞后活性，并导致材料可以被浇铸成薄膜。聚合物-蛋白质结合物保留了蛋白质在零度以下的水中减缓冰生长的能力，并且在附着到玻璃表面后可以抑制冰的形成。这些廉价的材料可能被证明可用作设备组件的涂层，这些组件必须在低温下运行而不会结冰。
• US7556923B1
  申请人：——

  公开号：US7556923B1

  公开（公告）日：2009-07-07
• US7794945B2
  申请人：——

  公开号：US7794945B2

  公开（公告）日：2010-09-14