4,4,8-trimethyl-5-(naphthalen-2-yloxy)acetyl-4,5-dihydro-1H-[1,2]dithiolo[3,4-c]quinoline-1-thione

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 萘
• 英文名称: 4,4,8-trimethyl-5-(naphthalen-2-yloxy)acetyl-4,5-dihydro-1H-[1,2]dithiolo[3,4-c]quinoline-1-thione
• 英文别名: 4,4,8-trimethyl-5-((2-naphthalenyloxy)acetyl)-4,5-dihydro-1H-[1,2]dithiolo[3,4-c]quinoline-1-thione；2-naphthalen-2-yloxy-1-(4,4,8-trimethyl-1-sulfanylidenedithiolo[3,4-c]quinolin-5-yl)ethanone
• 化学式: C₂₅H₂₁NO₂S₃
• 分子量: 463.645
• InChiKey: JOFQNASFJMPIBR-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.6
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.2
• 拓扑面积：
  112
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  萘氧基-2-羰酰氯 、 4,4,8-trimethyl-2,3-dithiolo[5,4-c]-quinoline-1-thione 在 吡啶 作用下， 以 甲苯 为溶剂， 反应 5.0h， 以80%的产率得到4,4,8-trimethyl-5-(naphthalen-2-yloxy)acetyl-4,5-dihydro-1H-[1,2]dithiolo[3,4-c]quinoline-1-thione
  参考文献：
  名称：

  New Chemicals Suppressing SARS-CoV-2 Replication in Cell Culture

  摘要：

  利用分子建模技术从沃罗涅日国立大学的数据库中筛选出了 SARS-CoV-2 主要蛋白酶（Mpro）抑制剂的候选化合物。该数据库包含约 19,000 种化合物，由 41,000 多种配体构象代表。这些配体使用 SOL docking 程序与 Mpro 进行了对接。对于 SOL 评分最佳值的 1000 个配体，采用 PM7 量子化学方法和 COSMO 溶剂模型计算了蛋白质与配体的结合焓。利用 SOL 评分和计算出的蛋白质-配体结合焓，选择了 18 种化合物进行实验。其中几个抑制剂抑制了冠状病毒在细胞培养中的复制，我们利用其中最好的三个抑制剂寻找化学类似物。用同样的程序对类似物进行筛选，然后进行实验，最终确定了七种抑制细胞培养中 SARS-CoV-2 复制的抑制剂，其 EC50 值在微摩尔水平。鉴定出的抑制剂属于三类化学物质。这三种抑制剂（4,4-二甲基二硫喹啉衍生物）在 Vero E6 细胞培养中抑制 SARS-CoV-2 复制的效果与已发表的最佳非共价抑制剂一样好，而且细胞毒性低。这些结果为开发针对 SARS-CoV-2 冠状病毒的抗病毒药物提供了可能。

  DOI：

  10.3390/molecules27175732

文献信息

• New Chemicals Suppressing SARS-CoV-2 Replication in Cell Culture
  作者：Alexey Sulimov、Ivan Ilin、Danil Kutov、Khidmet Shikhaliev、Dmitriy Shcherbakov、Oleg Pyankov、Nadezhda Stolpovskaya、Svetlana Medvedeva、Vladimir Sulimov

  DOI：10.3390/molecules27175732

  日期：——

  Candidates to being inhibitors of the main protease (Mpro) of SARS-CoV-2 were selected from the database of Voronezh State University using molecular modeling. The database contained approximately 19,000 compounds represented by more than 41,000 ligand conformers. These ligands were docked into Mpro using the SOL docking program. For one thousand ligands with best values of the SOL score, the protein–ligand binding enthalpy was calculated by the PM7 quantum-chemical method with the COSMO solvent model. Using the SOL score and the calculated protein–ligand binding enthalpies, eighteen compounds were selected for the experiments. Several of these inhibitors suppressed the replication of the coronavirus in cell culture, and we used the best three among them in the search for chemical analogs. Selection among analogs using the same procedure followed by experiments led to identification of seven inhibitors of the SARS-CoV-2 replication in cell culture with EC50 values at the micromolar level. The identified inhibitors belong to three chemical classes. The three inhibitors, 4,4-dimethyldithioquinoline derivatives, inhibit SARS-CoV-2 replication in Vero E6 cell culture just as effectively as the best published non-covalent inhibitors, and show low cytotoxicity. These results open up a possibility to develop antiviral drugs against the SARS-CoV-2 coronavirus.

  利用分子建模技术从沃罗涅日国立大学的数据库中筛选出了 SARS-CoV-2 主要蛋白酶（Mpro）抑制剂的候选化合物。该数据库包含约 19,000 种化合物，由 41,000 多种配体构象代表。这些配体使用 SOL docking 程序与 Mpro 进行了对接。对于 SOL 评分最佳值的 1000 个配体，采用 PM7 量子化学方法和 COSMO 溶剂模型计算了蛋白质与配体的结合焓。利用 SOL 评分和计算出的蛋白质-配体结合焓，选择了 18 种化合物进行实验。其中几个抑制剂抑制了冠状病毒在细胞培养中的复制，我们利用其中最好的三个抑制剂寻找化学类似物。用同样的程序对类似物进行筛选，然后进行实验，最终确定了七种抑制细胞培养中 SARS-CoV-2 复制的抑制剂，其 EC50 值在微摩尔水平。鉴定出的抑制剂属于三类化学物质。这三种抑制剂（4,4-二甲基二硫喹啉衍生物）在 Vero E6 细胞培养中抑制 SARS-CoV-2 复制的效果与已发表的最佳非共价抑制剂一样好，而且细胞毒性低。这些结果为开发针对 SARS-CoV-2 冠状病毒的抗病毒药物提供了可能。