9-O-adenylylspectinomycin

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷酸
• 英文名称: 9-O-adenylylspectinomycin
• 英文别名: [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl [(1S,3S,5R,8R,10R,11S,12R,13R,14S)-8,12-dihydroxy-5-methyl-11-(methylamino)-13-(methylazaniumyl)-7-oxo-2,4,9-trioxatricyclo[8.4.0.03,8]tetradecan-14-yl] phosphate
• 化学式: C24H36N7O13P
• 分子量: 661.6
• InChiKey: YWELMMKQVLJFMW-QEYXCPIGSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -7.9
• 重原子数：
  45
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.75
• 拓扑面积：
  284
• 氢给体数：
  8
• 氢受体数：
  19

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  adenosine 5'-triphosphate 、 Spectinomycin(1+) 生成 9-O-adenylylspectinomycin 、 pyrophosphoric acid
  参考文献：
  名称：

  Enzymatic Adenylylation of Streptomycin and Spectinomycin by R-Factor-Resistant Escherichia coli

  摘要：

  一种含有抗性因子（R因子）的大肠杆菌菌株已知通过腺苷化反应失活链霉素，并显示对链霉素的抗性。该菌株的渗透性冲击物催化了生物学上不活性的链霉素腺苷酸的形成，其中腺苷酰残基可能附着在链霉素的一个D-己醇基团上。链霉素和链霉素腺苷化活性表现出相同的温度失活特性，并且在纯化链霉素失活酶的蛋白质分数中同时存在。从这个菌株中获得的对链霉素或链霉素腺苷化敏感的突变体，在体外测试时都缺乏这两种酶活性。对这些突变体的回变体进行选择，恢复链霉素抗性或链霉素腺苷化抗性，都会重新获得这两种酶活性。因此，我们得出结论，这两种药物的失活是由同一酶催化的。对多种携带R因子的菌株的检查表明，对链霉素和链霉素抗性的菌株都包含腺苷化酶，而对链霉素敏感但对链霉素抗性的菌株则通过磷酸化失活链霉素。

  DOI：

  10.1128/iai.1.1.109-119.1970

文献信息

• Cloning and nucleotide base sequence analysis of a spectinomycin adenyltransferase AAD(9) determinant from Enterococcus faecalis
  作者：D J LeBlanc、L N Lee、J M Inamine

  DOI：10.1128/aac.35.9.1804

  日期：1991.9

  Enterococcus faecalis LDR55, a human clinical isolate, is resistant to tetracycline (Tcr), erythromycin (Emr), and high levels (greater than 2,000 micrograms/ml) of spectinomycin (Spr) but not streptomycin. Filter matings between strain LDR55 and E. faecalis OG1-RF produced transconjugants with the following resistance phenotypes: Tcr Emr Spr, Tcr Emr, Tcr Spr, and Tcr only but never Emr or Spr only. The genetic determinant encoding resistance to spectinomycin was cloned in Streptococcus sanguis Challis from pDL55, a 26-kb plasmid harbored by a Tcr Spr transconjugant. Subcloning experiments yielded a 1.1-kb ClaI-NdeI fragment that encoded very high-level Spr in S. sanguis (10 mg/ml) and Escherichia coli (50 mg/ml). Cell extracts of cultures obtained from Spr strains expressed adenylating activity for spectinomycin but not for streptomycin, indicating that Spr was due to an AAD(9) activity. The nucleotide base sequence of the 1.1-kb ClaI-NdeI fragment contained a single 750-base open reading frame. The protein predicted from the open reading frame consisted of 250 amino acids and had a calculated size of approximately 28,000 daltons, similar to the size estimated from maxicell analysis (29,000 daltons). The deduced amino acid sequence of the streptococcal AAD(9) was compared with that of the AAD(9) encoded by staphylococcal transposon Tn554. The two proteins shared approximately 39% amino acid identity, which was expanded to 53% when conservative amino acid changes were included. When the streptococcal protein was compared with an AAD(3")(9) protein of E. coli, the degrees of identity were 27 and 47%, on the basis of actual amino acids and conservative replacements, respectively. The cloning and nucleotide base sequence analyses of the spectinomycin AAD(9) determinant from E. faecalis that results in high-level Spr when transferred to S. sanguis or E. coli are presented.

  粪肠球菌 LDR55 是一种人类临床分离物，对四环素 (Tcr)、红霉素 (Emr) 和高浓度（大于 2,000 微克/毫升）的光谱霉素 (Spr) 有抗药性，但对链霉素无抗药性。菌株 LDR55 与粪大肠杆菌 OG1-RF 的过滤配对产生的转座子具有以下抗性表型：Tcr Emr Spr, Tcr Emr Spr, Tcr Emr Spr, Tcr Emr Spr, Tcr Emr Spr：Tcr Emr Spr、Tcr Emr、Tcr Spr 和仅 Tcr，但从来没有仅 Emr 或 Spr。从 Tcr Spr 转座子所携带的 26 kb 质粒 pDL55 中克隆出了血清链球菌 Challis 对光谱霉素的抗性基因决定簇。亚克隆实验产生了一个 1.1 kb 的 ClaI-NdeI 片段，该片段在血链球菌（10 毫克/毫升）和大肠杆菌（50 毫克/毫升）中编码非常高水平的 Spr。从 Spr 菌株培养物中提取的细胞提取物对光谱霉素（spectinomycin）具有腺苷酸化活性，但对链霉素（streptomycin）却没有，这表明 Spr 是由 AAD(9) 活性引起的。1.1 kb ClaI-NdeI 片段的核苷酸碱基序列包含一个 750 碱基的开放阅读框。从开放阅读框预测出的蛋白质由 250 个氨基酸组成，其计算大小约为 28,000 道尔顿，与 maxicell 分析估计的大小（29,000 道尔顿）相似。链球菌 AAD(9) 的推导氨基酸序列与葡萄球菌转座子 Tn554 编码的 AAD(9) 的氨基酸序列进行了比较。这两种蛋白质的氨基酸相同度约为 39%，如果将保守的氨基酸变化包括在内，则相同度扩大到 53%。将链球菌蛋白与大肠杆菌的 AAD(3")(9)蛋白进行比较，根据实际氨基酸和保守替换，两者的同一性分别为 27% 和 47%。本文介绍了对粪肠球菌的光谱霉素 AAD(9) 决定子的克隆和核苷酸碱基序列分析。
• Structural mechanism of AadA, a dual-specificity aminoglycoside adenylyltransferase from Salmonella enterica
  作者：Ana Laura Stern、Sander Egbert Van der Verren、Sandesh Kanchugal P、Joakim Näsvall、Hugo Gutiérrez-de-Terán、Maria Selmer

  DOI：10.1074/jbc.ra118.003989

  日期：2018.7

  position 3″ of streptomycin and position 9 of spectinomycin. We previously reported the apo-AadA structure with a closed active site. To clarify how AadA binds ATP and its two chemically distinct drug substrates, we here report crystal structures of WT AadA complexed with ATP, magnesium, and streptomycin and of an active-site mutant, E87Q, complexed with ATP and streptomycin or the closely related dihydrostreptomycin

  链霉素和大观霉素是与细菌核糖体结合并扰动蛋白质合成的抗生素。临床上最普遍的细菌耐药性机制是通过氨基糖苷修饰酶（如氨基糖苷核苷酸转移酶（ANTs））对其进行化学修饰。来自肠炎沙门氏菌的AadA是一种氨基糖苷（3″）（9）腺苷酸转移酶，其O-腺苷酸可将链霉素的3″位和壮观的霉素的9位。我们之前曾报道过apo-AadA结构具有封闭的活性位点。为了阐明AadA如何结合ATP及其两个化学上不同的药物底物，我们在这里报告了WT AadA与ATP，镁和链霉素复合以及与ATP和链霉素或紧密相关的二氢链霉素复合的活性位点突变体E87Q的晶体结构。这些结构揭示了ATP结合诱导了构象变化，该构象变化将两个用于药物结合的域定位在域间裂隙处，并揭示了两个域与链霉素的三个环之间的相互作用。壮观霉素对接后进行的分子动力学模拟表明，尽管与链霉素的结构相似性有限，但壮观霉素在修饰位点周围产生相似的相互作用，并且与突变数据一
• Plasmid-Determined Resistance to Antimicrobial Agents
  作者：J Davies、D I Smith

  DOI：10.1146/annurev.mi.32.100178.002345

  日期：1978.10