1-((2R,3R,4R,5R)-5-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-3-methoxytetrahydrofuran-2-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione | 171268-85-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 1-((2R,3R,4R,5R)-5-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-3-methoxytetrahydrofuran-2-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
• 英文别名: TBDMS(-3)[DMT(-5)]Ribf2Me(b)-uracil-1-yl；1-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-3-methoxyoxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 171268-85-2
• 化学式: C₃₇H₄₆N₂O₈Si
• 分子量: 674.866
• InChiKey: ZWQRHEIYDFEUMS-DWNQJFHRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.87
• 重原子数：
  48
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.41
• 拓扑面积：
  105
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-((2R,3R,4R,5R)-5-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-3-methoxytetrahydrofuran-2-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 在 4-二甲氨基吡啶 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 306.75h， 生成
  参考文献：
  名称：

  用光诱导性AntimiR调节血管生成

  摘要：

  外源性触发以时空定义的方式抑制microRNA（miRs）将有助于特异性靶向生物活性并避免脱靶效应。可以通过辐射激活针对miR-92a的新型抗miR（参见方案； 3'-UTR = 3'-非翻译区）。通过这种方式，miR-92a被抑制，miR-92a靶整合素α5被抑制，内皮细胞的血管生成细胞得到增强。

  DOI：

  10.1002/anie.201307502
• 作为产物：
  描述：

  叔丁基二甲基氯硅烷 、 1-((2R,3r,4r,5r)-5-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-4-羟基-3-甲氧基四氢呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1h,3h)-二酮 在 咪唑 作用下， 生成 1-((2R,3R,4R,5R)-5-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-3-methoxytetrahydrofuran-2-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
  参考文献：
  名称：

  3',4'-氧杂环丁烷核苷的合成及抗HCV活性

  摘要：

  丙型肝炎病毒折磨着全世界大约 1.8 亿人，目前没有可用于治疗这种疾病的直接作用的抗病毒药物。我们的第一代核苷 HCV 抑制剂 RG7128 已经在临床上建立了概念验证，目前处于 IIb 期临床试验中。作为我们不断努力发现新型抗 HCV 药物的一部分，我们制备了 3',4'-氧杂环丁烷胞苷和腺苷核苷作为 HCV RNA 复制的抑制剂。如在全细胞亚基因组复制子测定中所确定的，这些核苷显示不是HCV的抑制剂。然而，2'-单/二氟类似物4、5和6很容易被脱氧胞苷激酶磷酸化为它们的单磷酸盐代谢物，并且它们的三磷酸盐衍生物在体外被证明是 HCV NS5B 聚合酶的抑制剂。复制子测定中缺乏抗 HCV 活性可能是由于单磷酸盐不能转化为其相应的二磷酸盐。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2010.06.025

文献信息

• Facile Synthesis, Geometry, and 2′-Substituent-Dependent in Vivo Activity of 5′-(<i>E</i>)- and 5′-(<i>Z</i>)-Vinylphosphonate-Modified siRNA Conjugates
  作者：Rubina Giare Parmar、Christopher R. Brown、Shigeo Matsuda、Jennifer L. S. Willoughby、Christopher S. Theile、Klaus Charissé、Donald J. Foster、Ivan Zlatev、Vasant Jadhav、Martin A. Maier、Martin Egli、Muthiah Manoharan、Kallanthottathil G. Rajeev

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.7b01147

  日期：2018.2.8

  (E)-Vinylphosphonate ((E)-VP), a metabolically stable phosphate mimic at the 5′-end of the antisense strand, enhances the in vivo potency of siRNA. Here we describe a straightforward synthetic approach to incorporate a nucleotide carrying a vinylphosphonate (VP) moiety at the 5′-end of oligonucleotides under standard solid-phase synthesis and deprotection conditions by utilizing pivaloyloxymethyl (POM) protected

  （E）-乙烯基膦酸酯（（E）-VP）是一种在反义链5'端具有代谢稳定性的磷酸盐模拟物，可增强siRNA的体内效力。在这里，我们描述了一种简单的合成方法，通过利用新戊酰氧基甲基（POM）保护的VP-核苷亚磷酰胺，在标准固相合成和脱保护条件下并入在寡核苷酸的5'-末端带有乙烯基膦酸酯（VP）部分的核苷酸。POM保护提高了5'-VP修饰的寡核苷酸的范围和可扩展性，并且从更广泛的意义上说，增强了用膦酸酯部分修饰的寡核苷酸的合成。三价N-乙酰半乳糖胺缀合的小干扰RNA（GalNAc-siRNA），包含（E与类似的（Z）异构体相比，VP的几何异构体在小鼠中具有强大的RNAi介导的基因沉默，从而改善了RISC装载，尽管组织积累相似。我们还获得了结构上的见解，以了解为什么只有与5'-（E）-VP结合才能很好地耐受较大的2'-核糖替代品，例如2'- O- [2-（甲基氨基）-2-氧代乙基] 。