4-(2-((E)-2-((E)-3-((E)-2-(3-(6-((((2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy)carbonyl)oxy)hexyl)-1,1-dimethyl-1,3-dihydro-2H-benzo[e]indol-2-ylidene)ethylidene)-2-phenoxycyclohex-1-en-1-yl)vinyl)-3,3-dimethyl-3H-indol-1-ium-1-yl)butane-1-sulfonate | 1425272-39-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 萘
• 英文名称: 4-(2-((E)-2-((E)-3-((E)-2-(3-(6-((((2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy)carbonyl)oxy)hexyl)-1,1-dimethyl-1,3-dihydro-2H-benzo[e]indol-2-ylidene)ethylidene)-2-phenoxycyclohex-1-en-1-yl)vinyl)-3,3-dimethyl-3H-indol-1-ium-1-yl)butane-1-sulfonate
• CAS: 1425272-39-4
• 化学式: C₅₅H₆₁N₃O₉S
• 分子量: 940.17
• InChiKey: VEESDTBPRXFPEK-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  11.0
• 重原子数：
  68.0
• 可旋转键数：
  18.0
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  145.59
• 氢给体数：
  0.0
• 氢受体数：
  10.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-(2-((E)-2-((E)-3-((E)-2-(3-(6-((((2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy)carbonyl)oxy)hexyl)-1,1-dimethyl-1,3-dihydro-2H-benzo[e]indol-2-ylidene)ethylidene)-2-phenoxycyclohex-1-en-1-yl)vinyl)-3,3-dimethyl-3H-indol-1-ium-1-yl)butane-1-sulfonate 、 1-氨基-11-叠氮-3,6,9-三氧杂十一烷 以 乙腈 为溶剂， 反应 2.0h， 以14.9 mg的产率得到4-(2-((E)-2-((E)-3-((E)-2-(3-(1-azido-13-oxo-3,6,9,14-tetraoxa-12-azaicosan-20-yl)-1,1-dimethyl-1H-benzo[e]indol-2(3H)-ylidene)ethylidene)-2-phenoxycyclohex-1-enyl)vinyl)-3,3-dimethyl-3H-indolium-1-yl)butane-1-sulfonate
  参考文献：
  名称：

  NUCLEOTIDE DERIVATIVES

  摘要：

  本发明提供了化合物和方法，用于将荧光标签附加到生物分子，如核苷酸。这些化合物和方法对于包括DNA修饰反应在内的生物测定非常有用。

  公开号：

  US20130059343A1
• 作为产物：
  描述：

  N,N'-二琥珀酰亚胺基碳酸酯 、 4-(2-((E)-2-((E)-3-((E)-2-(3-(6-hydroxyhexyl)-1,1-dimethyl-1H-benzo[e]indol-2(3H)-ylidene)ethylidene)-2-phenoxycyclohex-1-enyl)vinyl)-3,3-dimethyl-3H-indolium-1-yl)butane-1-sulfonate 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 12.0h， 生成 4-(2-((E)-2-((E)-3-((E)-2-(3-(6-((((2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy)carbonyl)oxy)hexyl)-1,1-dimethyl-1,3-dihydro-2H-benzo[e]indol-2-ylidene)ethylidene)-2-phenoxycyclohex-1-en-1-yl)vinyl)-3,3-dimethyl-3H-indol-1-ium-1-yl)butane-1-sulfonate
  参考文献：
  名称：

  NUCLEOTIDE DERIVATIVES

  摘要：

  本发明提供了化合物和方法，用于将荧光标签附加到生物分子，如核苷酸。这些化合物和方法对于包括DNA修饰反应在内的生物测定非常有用。

  公开号：

  US20130059343A1