(R)-3-(3-((5-methoxynaphthalen-1-yl)oxy)propoxy)propane-1,2-diol | 1566613-65-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 萘
• 英文名称: (R)-3-(3-((5-methoxynaphthalen-1-yl)oxy)propoxy)propane-1,2-diol
• 英文别名: (2R)-3-[3-(5-methoxynaphthalen-1-yl)oxypropoxy]propane-1,2-diol
• CAS: 1566613-65-7
• 化学式: C₁₇H₂₂O₅
• 分子量: 306.359
• InChiKey: KFILISRXOLHVFT-CYBMUJFWSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.41
• 拓扑面积：
  68.2
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (R)-3-(3-((5-methoxynaphthalen-1-yl)oxy)propoxy)propane-1,2-diol 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 (S)-1-(bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)-3-(3-((5-methoxynaphthalen-1-yl)oxy)propoxy)propan-2-yl (2-cyanoethyl)N,N-diisopropylphosphoramidite
  参考文献：
  名称：

  NDI 和 DAN DNA：NDI 和 DAN 的核酸指导组装

  摘要：

  两种新型 DNA 碱基替代亚磷酰胺1和2分别基于相对富电子的 1,5-二烷氧基萘 (DAN) 和相对缺电子的 1,4,5,8-萘四甲二亚胺 (NDI)，分别被设计、合成并整合到 DNA 寡核苷酸链中。DAN 和 NDI 人工 DNA 碱基以各种顺序排列插入 12 聚体寡核苷酸双链体内部的三碱基对区域内，并用 CD 光谱和 UV 熔解曲线分析进行研究。修饰双链体的 CD 谱表明 B 型 DNA 拓扑结构。熔解曲线分析揭示了 DNA 双链体稳定性的趋势，这与水溶液中 DAN 和 NDI 部分的已知关联以及 NDI 和天然 DNA 碱基对之间已知的有利相互作用相关。这表明 DAN 和 NDI 之间的静电互补性可以驱动 DNA 双链体的稳定性和特异性。在最有利的情况下，发现 DNA 双链体中间的 NDI-DAN-NDI 排列大约与三个 A-T 碱基对一样稳定。

  DOI：

  10.1021/jo402704z
• 作为产物：
  描述：

  1,5-二羟基萘 在 二异丁基氢化铝 、 potassium carbonate 作用下， 以 二氯甲烷 、 甲苯 、 乙腈 为溶剂， 反应 96.5h， 生成 (R)-3-(3-((5-methoxynaphthalen-1-yl)oxy)propoxy)propane-1,2-diol
  参考文献：
  名称：

  NDI 和 DAN DNA：NDI 和 DAN 的核酸指导组装

  摘要：

  两种新型 DNA 碱基替代亚磷酰胺1和2分别基于相对富电子的 1,5-二烷氧基萘 (DAN) 和相对缺电子的 1,4,5,8-萘四甲二亚胺 (NDI)，分别被设计、合成并整合到 DNA 寡核苷酸链中。DAN 和 NDI 人工 DNA 碱基以各种顺序排列插入 12 聚体寡核苷酸双链体内部的三碱基对区域内，并用 CD 光谱和 UV 熔解曲线分析进行研究。修饰双链体的 CD 谱表明 B 型 DNA 拓扑结构。熔解曲线分析揭示了 DNA 双链体稳定性的趋势，这与水溶液中 DAN 和 NDI 部分的已知关联以及 NDI 和天然 DNA 碱基对之间已知的有利相互作用相关。这表明 DAN 和 NDI 之间的静电互补性可以驱动 DNA 双链体的稳定性和特异性。在最有利的情况下，发现 DNA 双链体中间的 NDI-DAN-NDI 排列大约与三个 A-T 碱基对一样稳定。

  DOI：

  10.1021/jo402704z