(1′R, 3′S, 4′R)-N⁶-benzoyl-3′-tritylamino-2′,3′-dideoxyadenosine | 195375-63-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: (1′R, 3′S, 4′R)-N⁶-benzoyl-3′-tritylamino-2′,3′-dideoxyadenosine
• 英文别名: N⁶-benzoyl-3’-(trityl)amino-2’,3’-dideoxyadenosine；N-benzoyl-2 ^{FontWeight="Bold" FontSize="10"} ',3'-dideoxy-3'-[(triphenylmethyl)amino]adenosine；5'-OH-3'-NH-Tr-2'-deoxy-N-benzoyladenosine；N6-benzoyl-3'-aminotrityl-2',3'-dideoxyadenosine；Adenosine, N-benzoyl-2',3'-dideoxy-3'-[(triphenylmethyl)amino]-；N-[9-[(2R,4S,5S)-5-(hydroxymethyl)-4-(tritylamino)oxolan-2-yl]purin-6-yl]benzamide
• CAS: 195375-63-4
• 化学式: C₃₆H₃₂N₆O₃
• 分子量: 596.688
• InChiKey: NMWZGASSFONBLY-OJDZSJEKSA-N

物化性质

• 密度：
  1.31±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.1
• 重原子数：
  45
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.17
• 拓扑面积：
  114
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (1′R, 3′S, 4′R)-N⁶-benzoyl-3′-tritylamino-2′,3′-dideoxyadenosine 在 2,2,6,6-四甲基哌啶氧化物 、 碘苯二乙酸 作用下， 以 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 3.0h， 以76%的产率得到(1'R, 3'S, 4'S)-2',3'-dideoxy-3'-tritylamino-N⁶-benzoyl-adenin-4'-carboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  合成所有四种基于核苷的β-氨基酸作为受保护的前体，以交替的α-氨基酸和核苷-β-氨基酸合成聚酰胺-DNA

  摘要：

  描述了一种从市售起始原料合成所有四个正交保护的核苷-β-氨基酸的简单方法。描述了使用三苯甲基策略和甘氨酸作为α-氨基酸与核苷-β氨基酸交替的5'-3'方向的模型四聚体DNA序列的合成。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2012.11.028
• 作为产物：
  描述：

  3'-氨基-2',3'-双脱氧腺苷 在 吡啶 、 三乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 (1′R, 3′S, 4′R)-N⁶-benzoyl-3′-tritylamino-2′,3′-dideoxyadenosine
  参考文献：
  名称：

  寡核苷酸 N3′⇉P5′ 磷酸酯砌块的新方法

  摘要：

  开发了 3'-氨基核苷的 5'-亚磷酰胺的新合成方法。该方法依赖于使用 3'-amino-2',3'-dideoxy 核苷作为关键起始材料。最终的亚磷酰胺产物是通过 2-3 步高效化学转化获得的，使用选择性地将正交保护基团引入 3'-氨基核苷糖和碱基部分。

  DOI：

  10.1081/ncn-200060068

文献信息

• N3‘→P5‘ Oligodeoxyribonucleotide Phosphoramidates:  A New Method of Synthesis Based on a Phosphoramidite Amine-Exchange Reaction
  作者：Jeffrey S. Nelson、Karen L. Fearon、Mark Q. Nguyen、Sarah N. McCurdy、Jeff E. Frediani、Michael F. Foy、Bernard L. Hirschbein

  DOI：10.1021/jo970801t

  日期：1997.10.1

  for the synthesis of N3'-->P5' phosphoramidate oligodeoxynucleotides is demonstrated. Described herein is the synthesis of the monomers utilized in the phosphoramidite amine-exchange process and the experimental details pertaining to this new mode of chain assembly. The phosphoramidite amine-exchange method generates coupling yields in the 92-95% range per cycle and further enables the synthesis of chimeric

  展示了一种合成N3'-> P5'氨基磷酸亚氨基寡脱氧核苷酸的新方法。本文描述了亚磷酰胺交换反应中所用单体的合成以及与这种新的链组装方式有关的实验细节。亚磷酰胺交换法在每个循环中产生的偶联收率在92-95％的范围内，并且无需进行仪器修饰即可合成嵌合的氨基磷酸酯/磷酸二酯或氨基磷酸酯/硫代磷酸酯寡核苷酸。
• [EN] CYCLIC DINUCLEOTIDES AS STING AGONISTS<br/>[FR] DINUCLÉOTIDES CYCLIQUES UTILISÉS EN TANT QU'AGONISTES DE STING
  申请人：JANSSEN BIOTECH INC

  公开号：WO2019118839A1

  公开（公告）日：2019-06-20

  Disclosed are compounds, compositions and methods for treating of diseases, syndromes, or disorders that are affected by the modulation of STING. Such compounds are represented by Formula (I) as follows: wherein B2,X2, R2a, R2b, R2c, Z-M-Y, Y1-M1Z1, B1, X1, R1a, R1b, R1c are as defined herein.

  揭示了一种通过调节STING来治疗受影响的疾病、综合征或紊乱的化合物、组合物和方法。这些化合物由以下式（I）表示：其中B2、X2、R2a、R2b、R2c、Z-M-Y、Y1-M1Z1、B1、X1、R1a、R1b、R1c如本文所定义。
• Synthesis of protected 3'-amino nucleoside monomers
  申请人：Gryaznov M. Sergei

  公开号：US20060009636A1

  公开（公告）日：2006-01-12

  Orthogonally protected 3′-amino nucleoside monomers and efficient methods for their synthesis are described. The methods employ selective protection of the 3′-amino group in the presence of the unprotected nucleoside base.

  正交保护的3′-氨基核苷单体及其高效合成方法被描述。这些方法在未保护的核苷碱基存在下，采用对3′-氨基基团的选择性保护。
• A NEW APPROACH TO OLIGONUCLEOTIDE N3′⇉P5′ PHOSPHORAMIDATE BUILDING BLOCKS
  作者：Daria Zielinska、Krisztina Pongracz、Sergei Gryaznov

  DOI：10.1081/ncn-200060068

  日期：2005.4.1

  developed. The methodology relies upon the use of 3′-amino-2′,3′-dideoxy nucleosides as the key starting materials. The final phosphoramidite products were obtained with high yields via 2–3-step efficient chemical transformations using selective introduction of orthogonal protective groups to the 3′-aminonucleoside sugar and base moieties.

  开发了 3'-氨基核苷的 5'-亚磷酰胺的新合成方法。该方法依赖于使用 3'-amino-2',3'-dideoxy 核苷作为关键起始材料。最终的亚磷酰胺产物是通过 2-3 步高效化学转化获得的，使用选择性地将正交保护基团引入 3'-氨基核苷糖和碱基部分。
• [EN] OLIGONUCLEOTIDE COMPOSITIONS AND METHODS OF MAKING THE SAME<br/>[FR] COMPOSITIONS D'OLIGONUCLÉOTIDES ET LEURS PROCÉDÉS DE PRÉPARATION
  申请人：GERON CORP

  公开号：WO2015168310A1

  公开（公告）日：2015-11-05

  The present disclosure provides a solid phase method of making oligonucleotides via sequential coupling cycles including at least one coupling of a dinucleotide dimer subunit to a free 3'-terminal group of a growing chain. The oligonucleotides include at least two nucleoside subunits joined by a N3'→P5' phosphoramidate linkage. The method may include the steps of (a) deprotecting the protected 3' amino group of a terminal nucleoside attached to a solid phase support, said deprotecting forming a free 3' amino group; (b) contacting the free 3' amino group with a 3'-protected amino-dinucleotide-5'-phosphoramidite dimer in the presence of a nucleophilic catalyst to form an internucleoside N3'→P5' phosphoramidite linkage; and (c) oxidizing (e.g., sulfurizing) the linkage. The compositions produced by the subject methods may include a reduced amount of one or more (N-x) oligonucleotide products. Also provided are pharmaceutical compositions including the subject oligonucleotide compositions.

  本公开提供了一种通过顺序偶联循环制备寡核苷酸的固相方法，其中至少包括将二核苷酸二聚体亚基偶联到生长链的自由3'-末端基团的至少一个偶联步骤。这些寡核苷酸包括至少两个核苷酸亚基，通过N3'→P5'磷酰胺酸酯键连接。该方法可能包括以下步骤：(a)去保护连接到固相支持物上的末端核苷酸的保护3'氨基基团，去保护形成自由的3'氨基基团；(b)在存在亲核催化剂的情况下，将自由的3'氨基基团与3'-保护氨基-二核苷酸-5'-磷酰胺酯二聚体反应，形成核苷酸之间的N3'→P5'磷酰胺酯键；(c)氧化（例如，硫化）该键。通过该方法生产的组合物可能包括减少一种或多种(N-x)寡核苷酸产物的数量。还提供了包括该寡核苷酸组合物的制药组合物。