pentylamine-biotin | 731019-26-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 生物素及其衍生物
• 英文名称: pentylamine-biotin
• 英文别名: N-(5-aminopentyl)-5-(2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamide；biotin cadaverine；EZ-link pentylamine-biotin；5-(biotinamido)-pentylamine；N-(5-aminopentyl)biotinamide；biotinamidohexylamine；N-(5-aminopentyl)-5-{2-oxo-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl}pentanamide；N-(5-aminopentyl)-5-(2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamide
• CAS: 731019-26-4
• 化学式: C₁₅H₂₈N₄O₂S
• 分子量: 328.479
• InChiKey: CCSGGWGTGOLEHK-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.2
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.87
• 拓扑面积：
  122
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  pentylamine-biotin 在 丁二酰亚胺三氟乙酸酯 、 N,N-二异丙基乙胺 、 盐酸 、 甲醇 、 氢氧化钾 、 水 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 21.0h， 生成 4-(N-(5''-biotinylaminopentyl)aminocarbonyl)-rhod potassium salt
  参考文献：
  名称：

  Compositions and methods for detection and isolation of phosphorylated molecules

  摘要：

  本发明涉及磷酸结合化合物，用于结合、检测和分离包括随后鉴定与磷酸化靶分子相互作用或能够被磷酸化的分子的靶分子。提供一种包含磷酸结合化合物、酸和金属离子的结合溶液，其中金属离子同时与靶分子上的暴露的磷酸基团以及磷酸结合化合物的金属螯合基团相互作用，形成将磷酸结合化合物与磷酸化靶分子之间形成桥梁的三元复合物。本发明的结合溶液用于结合和检测固定和溶解的磷酸化靶分子，从复杂混合物中分离磷酸化的靶分子，并有助于蛋白质组学分析，其中激酶和磷酸酶底物和酶可被鉴定。

  公开号：

  US07102005B2
• 作为产物：
  描述：

  N-(5-氨基戊基)氨基甲酸叔丁酯 在 盐酸 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 pentylamine-biotin
  参考文献：
  名称：

  细胞中蛋白质-蛋白质相互作用的光邻近分析

  摘要：

  我们报告了一种新的光邻近蛋白质相互作用（PhotoPPI）分析方法，用于绘制体外和活细胞中蛋白质-蛋白质相互作用的图谱。该方法利用生物正交多功能化学探针，可通过模块化 SNAP-Tag/苄基鸟嘌呤共价相互作用靶向基因编码的目标蛋白 (POI)。第一代光邻近探针 PP1 响应 365 nm 光，同时裂解中心硝基藜芦基连接体和外围二氮丙啶基团，导致高反应性卡宾亲核试剂从 POI 扩散开。我们在体外演示了简单的探针加载，以及随后的模型蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）的相互作用和光依赖性近端标记。PhotoPPI 工作流程与定量 LC-MS/MS 的集成首次在活细胞中实现了氧化还原调节传感器蛋白 KEAP1 的无偏相互作用图谱。我们在基础细胞条件下验证了 KEAP1 与蛋白质 PGAM5 和 HK2 等之间已知和新颖的相互作用。相比之下，对经历代谢或氧化还原应激的细胞中的 PhotoPPI 谱进行比较证实，KEAP1

  DOI：

  10.1021/jacs.9b06528

文献信息

• [EN] VASCULAR ADHESION PROTEIN-1 (VAP-1) MODULATORS AND THERAPEUTIC USES THEREOF<br/>[FR] MODULATEURS DE PROTÉINE 1 D'ADHÉSION VASCULAIRE (VAP -1) ET LEURS UTILISATIONS THÉRAPEUTIQUES
  申请人：BLADE THERAPEUTICS INC

  公开号：WO2020006177A1

  公开（公告）日：2020-01-02

  Disclosed herein are small molecule Vascular Adhesion Protein- 1 (VAP-1) modulator compositions, pharmaceutical compositions, the use and preparation thereof.

  本文披露了小分子血管粘附蛋白-1（VAP-1）调节剂组合物、药物组合物及其使用和制备方法。
• Triazine compounds and their analogs, compositions, and methods
  申请人：Timmer T. Richard

  公开号：US20050227983A1

  公开（公告）日：2005-10-13

  The present invention relates to triazine compounds and their analogs and derivatives, and methods and compositions comprising these compounds. The compounds and compositions of this invention are useful for, among other things, treating pathophysiological conditions arising from inflammatory responses, inhibiting or blocking glycated protein produced induction of the signaling-associated inflammatory response in endothelial cells, inhibiting smooth muscle proliferation, treating vascular occlusive conditions characterized by smooth muscle proliferation such as restenosis and atherosclerosis, and the like.

  本发明涉及三嗪化合物及其类似物和衍生物，以及包含这些化合物的方法和组合物。本发明的化合物和组合物可用于治疗由炎症反应引起的病理生理条件，抑制或阻断糖化蛋白诱导内皮细胞中与信号相关的炎症反应，抑制平滑肌增殖，治疗以平滑肌增殖为特征的血管闭塞性疾病，如再狭窄和动脉粥样硬化等。
• Compositions and methods for treating cancer
  申请人：Mayers L. George

  公开号：US20060018908A1

  公开（公告）日：2006-01-26

  The invention features compositions and methods for treating or alleviating a symptom of cancer. The compositions and methods of the invention direct supra-lethal doses of radiation, called Hot-Spots, to virtually all cancer cell types.

  这项发明涉及用于治疗或缓解癌症症状的组合物和方法。该发明的组合物和方法将超致死剂量的辐射（称为热点）直接作用于几乎所有癌细胞类型。
• Directed Evolution of a Bond‐Forming Enzyme: Ultrahigh‐Throughput Screening of Microbial Transglutaminase Using Yeast Surface Display
  作者：Lukas Deweid、Lara Neureiter、Simon Englert、Hendrik Schneider、Jakob Deweid、Desislava Yanakieva、Janna Sturm、Sebastian Bitsch、Andreas Christmann、Olga Avrutina、Hans‐Lothar Fuchsbauer、Harald Kolmar

  DOI：10.1002/chem.201803485

  日期：2018.10.12

  work reports an ultrahigh‐throughput screening approach based on yeast surface display and fluorescence‐activated cell sorting (FACS) that enabled the evolution of microbial transglutaminase towards enhanced activity. Five rounds of FACS screening followed by recombinant expression of the most potent variants in E. coli yielded variants that possessed, compared to the wild type enzyme, improved enzymatic

  来自莫原链霉菌（mTG）的微生物转谷氨酰胺酶由于其能够使谷氨酰胺和伯胺的侧链交联而成为一种有用的生物技术工具。迄今为止，尚未完全了解mTG的底物特异性，这在将mTG用于解决新型靶标时提出了明显的挑战。为此，需要一种可行的策略来提供量身定制的转谷氨酰胺酶。这项工作报告了一种基于酵母表面展示和荧光激活细胞分选（FACS）的超高通量筛选方法，该方法使微生物转谷氨酰胺酶向增强活性的方向进化。进行五轮FACS筛选，然后在大肠杆菌中重组表达最有效的变体产生的变体与野生型酶相比，与工程改造的治疗性抗HER2抗体结合后具有改善的酶促性能和标记行为。这个强大且普遍适用的平台能够调整mTG的催化效率。
• SOLID FORMS OF SULFONAMIDES AND AMINO ACIDS
  申请人：Visor Gary Conard

  公开号：US20120122860A1

  公开（公告）日：2012-05-17

  Solid forms of phenyl sulfonamide compounds of formula (I) active on protein kinases, including Raf protein kinases, are described, as well as methods of using such solid forms to treat diseases and conditions associated with activity of protein kinases, e.g. Raf protein kinases, including pain, polycystic kidney disease, melanoma and colorectal cancer.

  本文描述了公式（I）的苯基磺酰胺化合物的固态形式，这些化合物对蛋白激酶具有活性，包括Raf蛋白激酶，并描述了使用这些固态形式治疗与蛋白激酶活性相关的疾病和病况的方法，例如疼痛，多囊肾病，黑色素瘤和结肠直肠癌。