1-{5-[Bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-4-hydroxy-tetrahydro-furan-2-yl}-5-methyl-1H-pyrimidine-2,4-dione | 1093730-81-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 1-{5-[Bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-4-hydroxy-tetrahydro-furan-2-yl}-5-methyl-1H-pyrimidine-2,4-dione
• 英文别名: 1-[5-[[Bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 1093730-81-4
• 化学式: C₃₁H₃₂N₂O₇
• mdl: MFCD00245066
• 分子量: 544.604
• InChiKey: UBTJZUKVKGZHAD-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.4
• 重原子数：
  40
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.29
• 拓扑面积：
  107
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-(chloro(2-(methylsulfonyl)ethoxy)phosphaneyl)morpholine 、 1-{5-[Bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-4-hydroxy-tetrahydro-furan-2-yl}-5-methyl-1H-pyrimidine-2,4-dione 以 二氯甲烷 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  通过亚磷酸三酯方法在寡核苷酸合成中使用2-甲基磺酰基乙基作为磷保护基

  摘要：

  2-甲基磺酰甲氧基二氯膦已被转化为单-N-吗啉代衍生物，并用于制备5'-O，N-保护的d-nucleoside-3亚磷酰胺。后者的中间体可以在1-羟基苯并三唑存在下用于形成3'-5'-磷酸三酯键。在温和的碱性条件下，MSE保护基可以有选择地快速去除。

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(01)80142-8
• 作为产物：
  描述：

  呋喃 、 beta-胸苷 、 8-甲氧基补骨脂素 、 4,4'-双甲氧基三苯甲基氯 以to give the 5'-dimethoxytrityl thymidine的产率得到1-{5-[Bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-4-hydroxy-tetrahydro-furan-2-yl}-5-methyl-1H-pyrimidine-2,4-dione
  参考文献：
  名称：

  Nucleic acid hybridization assay employing probes crosslinkable to

  摘要：

  本发明涉及一种新的方法和试剂，通过采用能够形成共价键的独特分子的交联反应，并与各种标签或配体结合，以确定特定核酸碱基序列的存在。使用含有与核酸靶分子互补的碱基序列的单链核酸探针，首先通过杂交，然后形成探针和靶之间的共价键，可以测量交联杂交体中标签的数量，作为一种极其敏感的检测特定核酸序列的方法。

  公开号：

  US04599303A1

文献信息

• COMPOSITIONS AND METHODS FOR CHEMICAL CLEAVAGE AND DEPROTECTION OF SURFACE-BOUND OLIGONUCLEOTIDES
  申请人：Illumina, Inc.

  公开号：US20190352327A1

  公开（公告）日：2019-11-21

  Embodiments of the present disclosure relate to methods of preparation of templates for polynucleotide sequencing. In particular, the disclosure relates to linearization of clustered polynucleotides in preparation for sequencing by cleavage of one or more first strands of double-stranded polynucleotides immobilized on a solid support by a transition metal complex, for example, a palladium complex or a nickel complex. Further disclosure relate to linearization of clustered polynucleotides by cleaving one or more second strands of double double-stranded polynucleotides immobilized on a solid support comprising azobenzene linker by Na 2 S 2 O 4 . Nucleotides and oligonucleotides comprising a 3′ phosphate moiety blocking group, and methods of removing the same using a fluoride reagent are also disclosed.

  本公开的实施例涉及用于多核苷酸测序模板制备的方法。具体而言，本公开涉及通过过渡金属络合物（例如钯络合物或镍络合物）裂解固定在固体支持物上的双链多核苷酸的一条或多条第一链，以便为测序做准备。进一步公开涉及通过Na2S2O4裂解固定在含有偶氮苯联结剂的固体支持物上的双链多核苷酸的一条或多条第二链来线性化团簇化的多核苷酸。还公开了含有3'磷酸酯基团阻断基团的核苷酸和寡核苷酸，以及使用氟化试剂去除这些基团的方法。
• Process for preparing polynucleotides
  申请人：University Patents, Inc.

  公开号：US05153319A1

  公开（公告）日：1992-10-06

  New and useful intermediate nucleotides bound to an inorganic polymer support, including the preparation thereof, and processes for the conversion to oligonucleotides which are especially useful for the synthesis of polynucleotides, particularly ribonucleic (RNA) and deoxyribonucleic (DNA) acids, are described.

  本文描述了一种新的、有用的中间核苷酸，它们与无机聚合物支持物结合，包括其制备方法，以及将其转化为寡核苷酸的过程。这些寡核苷酸对于合成多核苷酸，特别是核糖核酸（RNA）和脱氧核糖核酸（DNA）酸非常有用。
• Phosphorothioate oligonucleotides having modified internucleoside linkages
  申请人：ISIS Pharmaceuticals, Inc.

  公开号：US20010027251A1

  公开（公告）日：2001-10-04

  Novel compounds that mimic and/or modulate the activity of wild-type nucleic acids. In general, the compounds are phosphorothioate oligonucleotides wherein the 5′-terminal internucleoside linkage or the 5′- and 3′-terminal linkages are modified.

  新型化合物，模拟和/或调节野生型核酸的活性。一般来说，这些化合物是磷酸硫酰基寡核苷酸，其中5'-端间核苷酸连接或5'-和3'-端连接被修饰。
• Human RNase H1 and oligonucleotide compositions thereof
  申请人：ISIS Pharmaceuticals, Inc.

  公开号：US20040102618A1

  公开（公告）日：2004-05-27

  The present invention provides oligonucleotides that can serve as substrates for human Type 2 RNase H. The present invention is also directed to methods of using these oligonucleotides in enhancing antisense oligonucleotide therapies.

  本发明提供了可以作为人类2型RNA酶H底物的寡核苷酸。本发明还涉及使用这些寡核苷酸增强反义寡核苷酸治疗的方法。
• Nucleosides useful in the preparation of polynucleotides
  申请人：University Patents, Inc.

  公开号：US04500707A1

  公开（公告）日：1985-02-19

  New and useful intermediate nucleotides bound to an inorganic polymer support, including the preparation thereof, and processes for the conversion to oligonucleotides which are especially useful for the synthesis of polynucleotides, particularly ribonucleic (RNA) and deoxyribonucleic acids (DNA).

  新的有用的中间核苷酸与无机聚合物支持物结合，包括其制备，以及转化成寡核苷酸的过程，这些寡核苷酸特别适用于合成多核苷酸，特别是核糖核酸（RNA）和脱氧核糖核酸（DNA）的合成。