3-O-{2-cyanoethyl(diisopropylamino)phosphino}-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-(4-phenyldiazenylphenyl)ethynyl-2'-deoxyuridine | 1627941-97-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 3-O-{2-cyanoethyl(diisopropylamino)phosphino}-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-(4-phenyldiazenylphenyl)ethynyl-2'-deoxyuridine
• CAS: 1627941-97-2；1627941-99-4
• 化学式: C₅₃H₅₅N₆O₈P
• 分子量: 935.029
• InChiKey: YNJDPZQQNCNQFN-BATPFTKQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  10.33
• 重原子数：
  68.0
• 可旋转键数：
  19.0
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.3
• 拓扑面积：
  161.99
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  13.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  碘苷 在 吡啶 、 copper(l) iodide 、 四(三苯基膦)钯 、 三乙胺 、 二异丙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 9.5h， 生成 、 3-O-{2-cyanoethyl(diisopropylamino)phosphino}-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-(4-phenyldiazenylphenyl)ethynyl-2'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  C5-Azobenzene-substituted 2'-Deoxyuridine-containing Oligodeoxynucleotides for Photo-Switching Hybridization

  摘要：

  我们设计并合成了一种新的光异构核苷 dUAz，它在 2'- 脱氧尿苷的 C5 位上带有偶氮苯基。在 365 纳米（正向）和 450 纳米（反向）的照射下，寡脱氧核苷酸中的 dUAz 可快速、选择性地实现光异构化。热变性实验表明，dUAz 能稳定顺式双链，而破坏反式双链的稳定性，其错配识别能力与胸苷相当。这些结果表明，dUAz 可以成为一种强大的材料，用于可逆地操纵核酸杂交的时空控制。

  DOI：

  10.3390/molecules19045109