5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxy-3-[4-(dioctadecylamino)but-2-ynyl]thymidine | 1428580-35-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxy-3-[4-(dioctadecylamino)but-2-ynyl]thymidine
• 英文别名: 1-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-3-[4-(dioctadecylamino)but-2-ynyl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 1428580-35-1
• 化学式: C₇₁H₁₀₉N₃O₇
• 分子量: 1116.66
• InChiKey: IQQLNCRXYLOBDS-QPVVUFHJSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  21.6
• 重原子数：
  81
• 可旋转键数：
  45
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.66
• 拓扑面积：
  101
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxy-3-[4-(dioctadecylamino)but-2-ynyl]thymidine 、 2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.17h， 以90%的产率得到5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxy-3-[4-(dioctadecylamino)but-2-ynyl]thymidine 2-cyanoethyl-N,N-diisopropylphosphoramidite
  参考文献：
  名称：

  功能化脂质的合成及其在可调节的核苷和核酸疏水化中的应用

  摘要：

  制备了两个功能化的单侧链和双侧链脂质分子（方案1和2）。该化合物带有末端COOH，OH或卤素取代基。此外，双侧链脂质18带有内部炔烃官能团。后一种化合物通过碱催化的烷基化作用在N（3）处使胸苷疏水化。此外，完全保护的胸苷，32，是N（3）烷基化与所述双面链醇9施加光延反应条件。

  DOI：

  10.1002/hlca.201100410
• 作为产物：
  描述：

  5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-O-(t-butyldimethylsilyl)-2'-deoxythymidine 在 二苯并-18-冠醚-6 、 四丁基氟化铵 、 水 、 potassium carbonate 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 48.0h， 生成 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxy-3-[4-(dioctadecylamino)but-2-ynyl]thymidine
  参考文献：
  名称：

  功能化脂质的合成及其在可调节的核苷和核酸疏水化中的应用

  摘要：

  制备了两个功能化的单侧链和双侧链脂质分子（方案1和2）。该化合物带有末端COOH，OH或卤素取代基。此外，双侧链脂质18带有内部炔烃官能团。后一种化合物通过碱催化的烷基化作用在N（3）处使胸苷疏水化。此外，完全保护的胸苷，32，是N（3）烷基化与所述双面链醇9施加光延反应条件。

  DOI：

  10.1002/hlca.201100410

文献信息

• REACTIVE, LIPOPHILIC NUCLEOSIDE BUILDING BLOCKS FOR THE SYNTHESIS OF HYDROPHOBIC NUCLEIC ACIDS
  申请人：Ionovation GmbH

  公开号：US20190175633A1

  公开（公告）日：2019-06-13

  The present invention relates to a method for the isolation and/or identification of known or unknown sequences of nucleic acids (target sequences) optionally marked with reporter groups by base specific hybridation with complementary sequences using nucleolipids. The nucleolipids are prepared by lipophilizing nucleosides of formula (Ia) wherein Q represents a group having a substituted tetrahydrofuran ring and Bas represents a group having one or more heterocyclic rings having one or more heterocyclic nitrogen atoms.

  本发明涉及一种方法，用于通过碱特异性杂交与互补序列使用核苷酸脂质来分离和/或识别带有报告基团的已知或未知核酸序列（目标序列）。所述核苷酸脂质是通过使式（Ia）的核苷的亲脂化制备的， 其中，Q代表具有取代四氢呋喃环的基团，Bas代表具有一个或多个含有一个或多个杂环氮原子的杂环环的基团。
• Reactive, lipophilic nucleoside building blocks for the synthesis of hydrophobic nucleic acids
  申请人：Ionovation GmbH

  公开号：EP2712869A1

  公开（公告）日：2014-04-02

  The present invention relates to a method for the isolation and/or identification of known or unknown sequences of nucleic acids (target sequences) optionally marked with reporter groups by base specific hybridation with, essentially, complementary sequences (in the following referred to as sample oligonucleotides, sample sequences or sample nucleic acids), which belong to a library of sequences. Further, the invention relates to nucleolipids used in the method of the invention and a process for the preparation of said nucleolipids.

  本发明涉及一种用于通过与基本上互补序列（以下简称为样品寡核苷酸、样品序列或样品核酸）的碱基特异性杂交来分离和/或鉴定已知或未知核酸序列（目标序列）的方法，该目标序列可以选择性地标记有报告基团，这些目标序列属于一个序列库。此外，本发明涉及用于所述方法的核脂质以及用于制备所述核脂质的方法。