5'-dimethoxytrityl-2'deoxyuridine-3'-O-(2-chlorophenyl)phosphate | 93778-59-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-dimethoxytrityl-2'deoxyuridine-3'-O-(2-chlorophenyl)phosphate
• 英文别名: [(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl] (2-chlorophenyl) hydrogen phosphate
• CAS: 93778-59-7
• 化学式: C₃₆H₃₄ClN₂O₁₀P
• 分子量: 721.1
• InChiKey: LOSSECUXSVHDMO-VOTWKOMSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.2
• 重原子数：
  50
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.22
• 拓扑面积：
  142
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-dimethoxytrityl-2'deoxyuridine-3'-O-(2-chlorophenyl)phosphate 在 四氮唑 2,4,6-三异丙基苯磺酰氯 、 一水合肼 作用下， 以 吡啶 、 溶剂黄146 为溶剂， 反应 1.25h， 生成
  参考文献：
  名称：

  嘌呤2-氨基对DNA构象和稳定性的影响-II：d [CGT（2-NH 2）ACG]，d [CGU（2-NH 2）ACG]和d [CGT的合成和物理表征（2-NH 2）AT（2-NH 2）ACG]

  摘要：

  据报道，由2'-脱氧鸟苷合成了N-保护的2-氨基-2'-脱氧腺苷（dA'）衍生物。描述了几种含有这种修饰核苷的寡聚脱氧核苷酸的合成，以及通过熔解研究和CD构象分析的物理表征。如所预期的，看到2-氨基基团增加了双链体的稳定性。尽管发现序列d（TA'）3经历了盐诱导的构象转变，但是诸如d（CGTA'CG）的混合序列却没有表现出这种行为。这些序列中存在的所有鸟嘌呤残基均为O 6用氰基乙基或4-硝基苯基乙基进行保护，以消除鸟嘌呤在磷酸化和缩合反应中的降解。描述了引入和除去这些O 6保护基的方法。

  DOI：

  10.1016/0040-4020(84)85098-x
• 作为产物：
  描述：

  2-脱氧尿苷 在 1H-1,2,4-三唑 、 4-二甲氨基吡啶 、 三乙胺 作用下， 以 吡啶 为溶剂， 反应 2.25h， 生成 5'-dimethoxytrityl-2'deoxyuridine-3'-O-(2-chlorophenyl)phosphate
  参考文献：
  名称：

  嘌呤2-氨基对DNA构象和稳定性的影响-II：d [CGT（2-NH 2）ACG]，d [CGU（2-NH 2）ACG]和d [CGT的合成和物理表征（2-NH 2）AT（2-NH 2）ACG]

  摘要：

  据报道，由2'-脱氧鸟苷合成了N-保护的2-氨基-2'-脱氧腺苷（dA'）衍生物。描述了几种含有这种修饰核苷的寡聚脱氧核苷酸的合成，以及通过熔解研究和CD构象分析的物理表征。如所预期的，看到2-氨基基团增加了双链体的稳定性。尽管发现序列d（TA'）3经历了盐诱导的构象转变，但是诸如d（CGTA'CG）的混合序列却没有表现出这种行为。这些序列中存在的所有鸟嘌呤残基均为O 6用氰基乙基或4-硝基苯基乙基进行保护，以消除鸟嘌呤在磷酸化和缩合反应中的降解。描述了引入和除去这些O 6保护基的方法。

  DOI：

  10.1016/0040-4020(84)85098-x

文献信息

• The influence of the purine 2-amino group on DNA conformation and stability-II
  作者：Barbara L. Gaffney、Luis A. Marky、Roger A. Jones

  DOI：10.1016/0040-4020(84)85098-x

  日期：1984.1

  Synthesis of an N-protected derivative of 2-amino-2'-deoxyadenosine (dA') from 2'-deoxyguanosine is reported. The syntheses of several oligodeoxynucleotides containing this modified nucleoside are described, together with physical characterization via melting studies and CD conformational analysis. As expected, the 2-amino group is seen to add to the duplex stability. Although the sequence d(TA')3

  据报道，由2'-脱氧鸟苷合成了N-保护的2-氨基-2'-脱氧腺苷（dA'）衍生物。描述了几种含有这种修饰核苷的寡聚脱氧核苷酸的合成，以及通过熔解研究和CD构象分析的物理表征。如所预期的，看到2-氨基基团增加了双链体的稳定性。尽管发现序列d（TA'）3经历了盐诱导的构象转变，但是诸如d（CGTA'CG）的混合序列却没有表现出这种行为。这些序列中存在的所有鸟嘌呤残基均为O 6用氰基乙基或4-硝基苯基乙基进行保护，以消除鸟嘌呤在磷酸化和缩合反应中的降解。描述了引入和除去这些O 6保护基的方法。