1-0-(Dimethoxytrityl)-3-N-(6-aminocaproyl)-Amino-1,2-Dihydroxypropane | 125348-34-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 1-0-(Dimethoxytrityl)-3-N-(6-aminocaproyl)-Amino-1,2-Dihydroxypropane
• 英文别名: 1-O-(Dimethoxytrityl)-3-N-(6-aminocaproyl)-Amino-1,2-Dihydroxypropane；6-amino-N-[3-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]-2-hydroxypropyl]hexanamide
• CAS: 125348-34-7
• 化学式: C₃₀H₃₈N₂O₅
• 分子量: 506.642
• InChiKey: AXHLNJIHZJDISA-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  713.5±60.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.143±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.5
• 重原子数：
  37
• 可旋转键数：
  15
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.37
• 拓扑面积：
  103
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-0-(Dimethoxytrityl)-3-N-(6-aminocaproyl)-Amino-1,2-Dihydroxypropane 、 9-蒽甲酸 在 1-羟基苯并三唑 、 三乙胺 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 生成 N-(6-((3-(bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)-2-hydroxypropyl)amino)-6-oxohexyl)anthracene-9-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  New synthetic substrates of mammalian nucleotide excision repair system

  摘要：

  利用新型非核苷磷酰胺试剂设计了用于研究核苷酸切除修复（NER）过程中受损链切除的 DNA 探针，这些试剂含有 N-[6-(9-蒽基氨基甲酰基)己酰基]-3-氨基-1,2-丙二醇（nAnt）和 N-[6-(5(6)-荧光素基氨基甲酰基)己酰基]-3-氨基-1,2-丙二醇（nFlu）分子。插入 DNA 的新病变模拟加合物在 NER 过程中显示出良好的底物特性。经修饰的扩展线性 nFlu- 和 nAntr-DNA 适用于估计哺乳动物全细胞提取物催化的特异性切除活性。对于 137-bp 的线性双链 DNA 模型，底物活性范围如下：nAnt-DNA ≈ nFlu-DNA > Chol-DNA（Chol-DNA--含有胆固醇残基的非核苷片段的合法 NER 底物）。体外试验表明，修饰 DNA 是研究全细胞提取物中 NER 活性的有用工具。所开发的方法可用于在模型 DNA 中加入对 NER 敏感的畸变。含有大块非核苷修饰的新合成扩展线性 DNA 将有助于 NER 机制研究和应用。

  DOI：

  10.1093/nar/gkt301
• 作为产物：
  描述：

  6-(N-三氟乙酰基)氨基己酸 在 吡啶 、 氨 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 55.0h， 生成 1-0-(Dimethoxytrityl)-3-N-(6-aminocaproyl)-Amino-1,2-Dihydroxypropane
  参考文献：
  名称：

  EP2881385

  摘要：

  公开号：

文献信息

• [EN] DIASTEREOMERIC LINKING REAGENTS FOR NUCLEOTIDE PROBES<br/>[FR] RÉACTIFS DE LIAISON DIASTÉRÉOMÉRIQUES POUR SONDES NUCLÉOTIDIQUES
  申请人：BRENTANO BIOTECHNOLOGY ASS

  公开号：WO2021061154A1

  公开（公告）日：2021-04-01

  A versatile reagent with a non-nucleotide monomeric unit comprising an enantiomeric center and having a ligand, and first and second coupling groups that are linked to the non-nucleotide monomeric unit. Such a reagent permits preparation of versatile nucleotide/non-nucleotide polymers, having any desired sequence of nucleotide and non-nucleotide monomeric units, each of the latter of which bear a desired ligand. These polymers can, for example, be used as probes which can exhibit enhanced sensitivity and/or which are capable of detecting a genus of nucleotides each species of which has a common target nucleotide sequence of interest bridged by different sequences not of interest.

  一种多功能试剂，具有一个非核苷单体单元，包括一个对映中心和一个配体，以及与非核苷单体单元相连的第一和第二偶联基团。这种试剂可以制备多功能核苷酸/非核苷酸聚合物，具有任何所需的核苷酸和非核苷酸单体单元序列，其中每个后者都带有所需的配体。这些聚合物可以用作探针，可以展示增强的灵敏度和/或能够检测一类核苷酸，其中每个物种都有一个共同的感兴趣的靶核苷酸序列，通过不感兴趣的不同序列连接。
• Non-nucleotide linking reagents for nucleotide probes
  申请人：GEN-PROBE INCORPORATED

  公开号：EP0313219A2

  公开（公告）日：1989-04-26

  A versatile reagent with a non-nucleotide monomeric unit having a ligand, and first and second coupling groups which are linked to the non-nucleotide monomeric unit. The ligand can be either a functional moiety, such as a label or intercalator, or a linking arm which can be linked to such a moiety. Such reagent permits preparation of versatile nucleotide/non-­nucleotide polymers, having any desired sequence of nucleotide and non-nucleotide monomeric units, each of the latter of which bear a desired ligand. These polymers can for example, be used as probes which can exhibit enhanced sensitivity and/or which are capable of detecting a genus of nucleotides each species of which has a common target nucleotide sequence of interest bridged by different sequences not of interest.

  一种多功能试剂，其非核苷酸单体单元具有配体以及与非核苷酸单体单元相连的第一和第二偶联基团。配体可以是功能性分子，如标记物或插入物，也可以是与功能性分子相连的连接臂。这种试剂可以制备多功能核苷酸/非核苷酸聚合物，具有任何所需的核苷酸和非核苷酸单体单元序列，其中每个单体单元都带有所需的配体。例如，这些聚合物可以用作探针，从而提高灵敏度和/或能够检测核苷酸属，其中每种核苷酸都有一个共同的目标核苷酸序列，并由不同的非目标核苷酸序列连接。
• US5585481A
  申请人：——

  公开号：US5585481A

  公开（公告）日：1996-12-17
• US5696251A
  申请人：——

  公开号：US5696251A

  公开（公告）日：1997-12-09
• EP2881385
  申请人：——

  公开号：——

  公开（公告）日：——