N-1-[(1S,4R)-4-{(monomethoxytrityl)oxymethyl}cyclopentyl]-5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2',3'-O-isopropylideneadenosine | 859147-53-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: N-1-[(1S,4R)-4-{(monomethoxytrityl)oxymethyl}cyclopentyl]-5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2',3'-O-isopropylideneadenosine
• CAS: 859147-53-8
• 化学式: C₄₅H₅₇N₅O₆Si
• 分子量: 792.063
• InChiKey: WIICZKITBPPYTG-MPKXJBMHSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.51
• 重原子数：
  57.0
• 可旋转键数：
  12.0
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.49
• 拓扑面积：
  114.87
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  11.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-1-[(1S,4R)-4-{(monomethoxytrityl)oxymethyl}cyclopentyl]-5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2',3'-O-isopropylideneadenosine 在 吡啶 、 2,4,6-三异丙基苯磺酰氯 、 四丁基氟化铵 、 溶剂黄146 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 10.0h， 生成 N-1-{(1S,4R)-4-(hydroxymethyl)cyclopentyl}-5'-O-{bis(phenylthio)phosphoryl}-2',3'-O-isopropylideneadenosine
  参考文献：
  名称：

  循环 ADP-核糖的稳定和细胞类型选择性类似物的合成，Ca2+-Mobilizing 第二信使。N1-核糖部分的构效关系1

  摘要：

  我们以前开发了循环 ADP-碳环核糖 (cADPcR, 2) 作为稳定模拟的循环 ADP-核糖 (cADPR, 1)，Ca(2+) 动员第二信使。一系列 N1-核糖修饰的 cADPcR 类似物，设计为 cADPR 的新型稳定模拟物，它们是 2"-脱氧类似物 3、3"-脱氧类似物 4、3"-脱氧-2"-O-(甲氧基甲基) 类似物 5、3"-O-甲基类似物 6、2",3"-dideoxy 类似物 7 和 2",3"-dideoxydidehydro 类似物 8，使用与苯硫代磷酸酯型的关键分子内缩合反应成功合成我们研究了这些类似物和 cADPR 的构象，发现腺嘌呤和 N9-核糖部分之间以及腺嘌呤和 N1-核糖部分之间的空间排斥是构象的决定因素。Ca(2+)-动员效应被系统地评估使用三个不同的生物系统，即海胆卵、 NG108-15 神经元细胞和Jurkat T 淋巴细胞。这些 cADPR 类似物对

  DOI：

  10.1021/ja050732x
• 作为产物：
  描述：

  tert-butyl ((1S,3R)-3-(hydroxymethyl)cyclopentyl)carbamate 在 吡啶 、 水 、 potassium carbonate 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 36.0h， 生成 N-1-[(1S,4R)-4-{(monomethoxytrityl)oxymethyl}cyclopentyl]-5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2',3'-O-isopropylideneadenosine
  参考文献：
  名称：

  循环 ADP-核糖的稳定和细胞类型选择性类似物的合成，Ca2+-Mobilizing 第二信使。N1-核糖部分的构效关系1

  摘要：

  我们以前开发了循环 ADP-碳环核糖 (cADPcR, 2) 作为稳定模拟的循环 ADP-核糖 (cADPR, 1)，Ca(2+) 动员第二信使。一系列 N1-核糖修饰的 cADPcR 类似物，设计为 cADPR 的新型稳定模拟物，它们是 2"-脱氧类似物 3、3"-脱氧类似物 4、3"-脱氧-2"-O-(甲氧基甲基) 类似物 5、3"-O-甲基类似物 6、2",3"-dideoxy 类似物 7 和 2",3"-dideoxydidehydro 类似物 8，使用与苯硫代磷酸酯型的关键分子内缩合反应成功合成我们研究了这些类似物和 cADPR 的构象，发现腺嘌呤和 N9-核糖部分之间以及腺嘌呤和 N1-核糖部分之间的空间排斥是构象的决定因素。Ca(2+)-动员效应被系统地评估使用三个不同的生物系统，即海胆卵、 NG108-15 神经元细胞和Jurkat T 淋巴细胞。这些 cADPR 类似物对

  DOI：

  10.1021/ja050732x

文献信息

• SYNTHESIS AND BIOLOGICAL ACTIVITY OF CYCLIC ADP-CARBOCYCLIC-RIBOSE ANALOGS: STRUCTURE-ACTIVITY RELATIONSHIP AND CONFORMATIONAL ANALYSIS OF<i>N</i>-1-CARBOCYCLIC-RIBOSE MOIETY
  作者：Takashi Kudoh、Masayoshi Fukuoka、Satoshi Shuto、Akira Matsuda

  DOI：10.1081/ncn-200060167

  日期：2005.4.1

  Several cyclic ADP-carbocyclic-ribose analogs 3–10 modified in the N-1-carbocyclic-ribose moiety were synthesized. Their Ca2+-releasing activity was estimated in sea urchin eggs to show that the 3″-deoxy analog 6 shows 5 times more potent activity than cADPcR, but the 2″,3″-didieoxy-2″,3″-unsunsaturated analog 3 has very weak activity. We also calculated their stable conformation and found that 3 and

  合成了几种在 N-1-碳环-核糖部分修饰的环状 ADP-碳环-核糖类似物 3-10。在海胆卵中估计了它们的 Ca2+ 释放活性，表明 3"-脱氧类似物 6 的活性是 cADPcR 的 5 倍，但 2",3"-二二氧-2",3"-不饱和类似物 3 具有非常弱的活动。我们还计算了它们的稳定构象，发现 3 和 6 的稳定构象有显着差异。