5-[(3aS,4R,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-N-{2-[2-(2-{2-[2-(2-phenoxyacetamido)phenoxy]acetamido}ethoxy)ethoxy]ethyl}pentanamide | 1469268-04-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 生物素及其衍生物
• 英文名称: 5-[(3aS,4R,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-N-{2-[2-(2-{2-[2-(2-phenoxyacetamido)phenoxy]acetamido}ethoxy)ethoxy]ethyl}pentanamide
• 英文别名: 5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-N-{2-[2-(2-{2-[2-(2-phenoxyacetamido)phenoxy]acetamido}ethoxy)ethoxy]ethyl}pentanamide
• CAS: 1469268-04-9
• 化学式: C₃₂H₄₃N₅O₈S
• 分子量: 657.788
• InChiKey: XBIBXZCDSNADQL-ZXRRJQOQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.07
• 重原子数：
  46.0
• 可旋转键数：
  21.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  165.35
• 氢给体数：
  5.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  tert-butyl 2-[2-(2-{2-[2-(2-phenoxyacetamido)phenoxy]acetamido}ethoxy)ethoxy]ethylcarbamate 在 三乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 5-[(3aS,4R,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-N-{2-[2-(2-{2-[2-(2-phenoxyacetamido)phenoxy]acetamido}ethoxy)ethoxy]ethyl}pentanamide
  参考文献：
  名称：

  使用化学探针鉴定苹果酸脱氢酶2作为HIF-1抑制剂LW6的靶蛋白

  摘要：

  追踪目标：为了鉴定与HIF-1α抑制剂LW6直接结合的蛋白质，合成了一系列带有可点击标签和/或可光活化部分的新化学探针。发现LW6位于线粒体（参见图片），并且MDH2被确定为LW6的靶蛋白。这些结果表明，LW6的HIF-1α抑制活性是MDH2抑制的结果。

  DOI：

  10.1002/anie.201304987

文献信息

• Synthesis and Structure–Activity Relationship Study of Chemical Probes as Hypoxia Induced Factor-1α/Malate Dehydrogenase 2 Inhibitors
  作者：Ravi Naik、Misun Won、Hyun Seung Ban、Deepak Bhattarai、Xuezhen Xu、Yumi Eo、Ye Seul Hong、Sarbjit Singh、Yongseok Choi、Hee-Chul Ahn、Kyeong Lee

  DOI：10.1021/jm501241g

  日期：2014.11.26

  hypoxia inducible factor-1α inhibitor 3-aminobenzoic acid-based chemical probes, which were previously identified to bind to mitochondrial malate dehydrogenase 2, was performed to provide a better understanding of the pharmacological effects of LW6 and its relation to hypoxia inducible factor-1α (HIF-1α) and malate dehydrogenase 2 (MDH2). A variety of multifunctional probes including the benzophenone

  进行了基于缺氧诱导因子-1α抑制剂3-氨基苯甲酸的化学探针的结构-活性关系研究，该探针先前已确定与线粒体苹果酸脱氢酶2结合，以更好地了解LW6的药理作用及其关系缺氧诱导因子-1α（HIF-1α）和苹果酸脱氢酶2（MDH2）。制备了多种多功能探针，包括用于光亲和性标记和点击反应的二苯甲酮或三氟甲基二嗪，并使用基于细胞的HRE荧光素酶测定法和MDH2测定法评估了人结肠直肠癌HCT116细胞的生物学活性。其中，重氮探针4a对HIF-1α和MDH2均显示出强大的抑制活性。显着地，探针对HIF-1α活性的抑制作用与MDH2酶测定的抑制作用一致，这通过对重组人MDH2的体外结合活性，耗氧量，ATP产生和AMP活化蛋白的影响得到进一步证实。激酶（AMPK）激活。还证明了LW6和探针4a与MDH2的竞争结合方式。