4'-(2''-deoxy-5''-O-dimethoxytrityl-β-D-ribofuranosyl)-2,3,4,5,6-pentafluorobiphenyl | 852378-32-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 4'-(2''-deoxy-5''-O-dimethoxytrityl-β-D-ribofuranosyl)-2,3,4,5,6-pentafluorobiphenyl
• CAS: 852378-32-6
• 化学式: C₃₈H₃₁F₅O₅
• 分子量: 662.653
• InChiKey: PNYJEKRMCNKTTA-OJDZSJEKSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.27
• 重原子数：
  48.0
• 可旋转键数：
  10.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.21
• 拓扑面积：
  57.15
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  5.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4'-(2''-deoxy-5''-O-dimethoxytrityl-β-D-ribofuranosyl)-2,3,4,5,6-pentafluorobiphenyl 、 2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 1.5h， 以69%的产率得到4'-(2''-deoxy-5''-O-dimethoxytrityl-β-D-ribofuranosyl)-3''-O-(2-cyanoethyl-N,N'-diisopropylaminophosphine)-2,3,4,5,6-pentafluorobiphenyl
  参考文献：
  名称：

  联苯DNA中的五氟苯基-苯基相互作用。

  摘要：

  我们准备并研究了序列d（GATGAC（X）nGCTAG）.d（CTAGC（Y）nGTCATC）的寡核苷酸双链体，其中X和Y分别表示联苯（bph）和五氟联苯-（（5F）bph）C-核苷酸，并且n的范围是0-4。这些疏水性碱基替代物有望采用拉链状的链间堆叠基序，其中不仅可以形成bph / bph或（5F）bph /（5F）bph同质对，而且可以形成（5F）bph / bph混合对。通过进行UV熔解曲线分析，我们发现掺入单个（5F）bph /（5F）bph对可导致双链体的稳定性与未修饰的双链体（n = 0）相同，并且比KF的双链体稳定2.4 K.与非氟化bph / bph对形成双链。混合bph /（5F）bph对的T（m）在各个同位对的T（m）值之间。额外的，无论芳香族残基的性质如何，非天然芳香族对都会使T（m）增加+ 3.0-4.4 K /对。使用等温滴定量热法（ITC）对n = 3的一系列双链体进行热力学分析，发现（5F）bph

  DOI：

  10.1002/chem.200401128
• 作为产物：
  描述：

  六氟苯 在 吡啶 、 三乙基硅烷 、 正丁基锂 、 偶氮二异丁腈 、 三(三甲基硅基)硅烷 、 三氟化硼乙醚 、 三溴化硼 、 triethylamine tris(hydrogen fluoride) 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醚 、 正己烷 、 二氯甲烷 、 甲苯 、 乙腈 为溶剂， 反应 106.0h， 生成 4'-(2''-deoxy-5''-O-dimethoxytrityl-β-D-ribofuranosyl)-2,3,4,5,6-pentafluorobiphenyl
  参考文献：
  名称：

  联苯DNA中的五氟苯基-苯基相互作用。

  摘要：

  我们准备并研究了序列d（GATGAC（X）nGCTAG）.d（CTAGC（Y）nGTCATC）的寡核苷酸双链体，其中X和Y分别表示联苯（bph）和五氟联苯-（（5F）bph）C-核苷酸，并且n的范围是0-4。这些疏水性碱基替代物有望采用拉链状的链间堆叠基序，其中不仅可以形成bph / bph或（5F）bph /（5F）bph同质对，而且可以形成（5F）bph / bph混合对。通过进行UV熔解曲线分析，我们发现掺入单个（5F）bph /（5F）bph对可导致双链体的稳定性与未修饰的双链体（n = 0）相同，并且比KF的双链体稳定2.4 K.与非氟化bph / bph对形成双链。混合bph /（5F）bph对的T（m）在各个同位对的T（m）值之间。额外的，无论芳香族残基的性质如何，非天然芳香族对都会使T（m）增加+ 3.0-4.4 K /对。使用等温滴定量热法（ITC）对n = 3的一系列双链体进行热力学分析，发现（5F）bph

  DOI：

  10.1002/chem.200401128